Новости химической науки > Маннозидаза в конформации «кресло»

Гидеон Дэвис (Gideon Davies) и Венди Оффен (Wendy Offen) из Университета Йорка с коллегами из Университета Ньюкасла и Университетов Онтарио и Британской Колумбии объединились для изучения ферментативного катализа.

Рисунок из Chem. Commun., 2009 DOI: 10.1039/b902240f

Исследователи смогли зафиксировать комплекс Михаэлиса в конформации кресло, этот комплекс представляет собой недостающее звено в конформационых переходах ряда ферментов наряду с тем, что он позволяет иллюстрировать почему имидазоляты углеводов являются хорошими ингибиторами гликозидазы.

Конформационное поведение фермента, катализирующего перенос гликозильного фрагмента, является ключевым в понимании роли конформационного контроля в процессе замещения.

Маннозидазы, катализирующие распад α- β-маннозидов преодолевают примерно одинаковые проблемы при управлении реакции замещения у аномерного центра. Дэвис поясняет, что определение координаты реакции фермента имеет огромное значение как для фундаментального понимания ферментативно катализируемых процессов, так и для разработки ингибиторов этого фермента. Совместная работа исследователей была посвящена улавливанию комплекса Михаэлиса негидролизованного субстрата, находящегося в равновесно-связанном состоянии с активным центром фермента β-маннозидазы.

Результаты работы, проделанной в группе Дэвиса, позволяют получить новую информацию и о переходных состояниях фермента-катализатора α-маннозидазы, что может помочь в разработке новых ингибиторов этого белка (α-маннозидаза часто используется в качестве терапевтического агента). Дальнейшая работа исследователей будет посвящена разработке специфических катализаторов маннозидаз и применению их ингибиторов в живых клетках.

Источник: Chem. Commun., 2009 DOI: 10.1039/b902240f

метки статьи: #биохимия, #кинетика и катализ, #органическая химия, #физическая химия