Новости химической науки > Антитела против РНК

Впервые разработан общеприменимый метод для получения антител к молекулам РНК.

Новая разработка позволит использовать перенести рутинный подход получения белковых антител на благодатную почву РНК. Развитие метода может привести к широкому использованию связанных с РНК антител в определении структуры РНК или в биохимической и медицинской диагностике.

Активный карман во фрагменте антитела (красный) захватывает связывающий нуклеотид (зеленый) в модельной РНК (синяя лента). (Рисунок из Proc. Natl. Acad. Sci. USA DOI: 10.1073/pnas.0709082105)

Для получения антител к РНК не используется традиционная методика, основанная на иммунном отклике. Это обуславливается тем, что нуклеазы разрушают «чужие» РНК, практически сразу после инъекции в организм животного.

Новые антитела к РНК получены с помощью существующей синтетической библиотеки, полученной при использовании фагов. Эти фрагменты были подвергнуты скринингу на предмет связывания с РНК исследователями из Университета Чикаго, общее руководство которыми осуществлял Джозеф Пиккирилли (Joseph A. Piccirilli).

Скрининг позволил идентифицировать два антитела, селективно и прочно связывающиеся с 3-D структурой модельной РНК ΔC209 P4-P6. Один из этих фрагментов был использован для способствования кристаллизации модельной РНК, что позволило получить данные ее рентгеноструктурного анализа с разрешением, ранее недоступным.

В присутствии фрагмента антитела модельная РНК сохраняет свою структуру. Антитело образует карман вокруг уридилового нуклеотида, выдающегося наружу из поверхности РНК. Пиккирилли полагает, что такие «выдающиеся» нуклеотиды, обычные для ряда молекул РНК смогут обеспечивать общий для этого класса молекул сайт для связывания с антителами.

Антитела к белкам и полисахаридам являются незаменимым орудием для построения клеточного образа и диагностики заболеваний. Исследователи полагают, что их подход сможет содействовать дальнейшему изучению биологической роли РНК.

Proc. Natl. Acad. Sci. USA, DOI: 10.1073/pnas.0709082105

метки статьи: #аналитическая химия, #биохимия, #медицинская химия, #молекулярная биология