Утилиты для масс-спектрометристов

[Vit Nhoc]

Как я уже написал, сейчас Chemcraft строит спектр отдельных ионов, со стандартным распределением по изотопам. Имеет ли смысл визуализировать масс-спектры с изменёнными изотопами, например масс-спектры дейтерированных молекул?

[Jokermaniak]

Интересно создание подобного иструмента. ВЭЖХ - высокоэффективная жидкостная хроматография, с коорой обычно сопрягают масс-спектрометрию со всевозможными мягкими методами ионизации, как писал коллега ESI, APPI/APCI, MALDI, DART. Он несколько бесится с жиру, поскольку спектры высокого разрешения доступны далеко не всем ( сейчас такой прибор по цене начинается от 700 килобаксов), как и на самом деле вообще ВЭЖХ- МС. И далеко не всегда там бывает молекулярный ион.

Наиболее распространней метод именно ионизация электронным ударом, что можно делать на относительно недорогих даже и отечественных ГХ-МС приборах, поэтому предсказание фрагментации, безусловно будет полезным. Иногда фрагментайция даже более полезна, чем точная масса, поскольку указывает косвенно на возможную структуру вещества.

Путаете теплое с мягким. В EI без костылей не ввести жидкость, а в ESI/AP никак не ввести газ. В MALDI без костылей можно только в твердом виде. Но испарить большую часть молекул невозможно - они разложатся. Поэтому GC-EI-MS это метод для анализа уже известного и довольно узкого круга небольших молекул, а ESI/AP-HRMS - метод исследования широкого круга молекул, в том числе и весьма тяжелых. По этой самой причине, кстати, EI почти не делают в высоком разрешении - метод всё равно не сможет поднять ионы такого размера, чтобы высокое разрешение было важно. А предсказание фрагментации в EI не особо нужно потому, что всё, что почти всё EI может поднять, уже давно промерено и внесено в базы. Для структурного анализа по МС нужен MS/MS спектрометр, что-то сложное определять по фрагментации в одиночном EI-MS - что на кофейной гуще гадать.

И ESI-HRMS стоит не настолько дорого. За 200 тысяч можно купить, а возможно и дешевле.