Gaussian: "пре-оптимизация" для MP2

обсуждение вопросов физической химии и химической физики
physical chemistry and chemical physics: discussions for professionals
Ответить
1177
Сообщения: 148
Зарегистрирован: Пн июн 19, 2006 11:49 am

Gaussian: "пре-оптимизация" для MP2

Сообщение 1177 » Ср ноя 14, 2007 2:59 pm

Вопрос:
Каким методом лучше всего предварительно оптимизировать структуру, чтобы затем оптимизировать её методом MP2 [RMP2/6-311+G(d)] за максимально короткое время? Спасибо.

Аватара пользователя
Yu/2
Сообщения: 541
Зарегистрирован: Сб ноя 15, 2003 12:33 pm

Сообщение Yu/2 » Ср ноя 14, 2007 3:31 pm

DFT или HF, если их результаты хотя бы качественно соласуются с тем, что дает MP2.

Аватара пользователя
ИСН
Робин Гуд
Сообщения: 8531
Зарегистрирован: Пт окт 10, 2003 5:32 pm
Контактная информация:

Сообщение ИСН » Ср ноя 14, 2007 3:43 pm

Я (хотя живу в лесу, молюсь колесу, и моё слово на фоне профессионалов этой науки весит мало) скажу так: юзать голый HF - это как бы естественно, это то, над чем надстроен MP2. А DFT - это другая надстройка, и она может увести Не Туда.

Аватара пользователя
Yu/2
Сообщения: 541
Зарегистрирован: Сб ноя 15, 2003 12:33 pm

Сообщение Yu/2 » Ср ноя 14, 2007 3:48 pm

ИСН писал(а):Я (хотя живу в лесу, молюсь колесу, и моё слово на фоне профессионалов этой науки весит мало) скажу так: юзать голый HF - это как бы естественно, это то, над чем надстроен MP2. А DFT - это другая надстройка, и она может увести Не Туда.
Правильно. Но в любом случае нужно зорко следить. А по поводу MP2 vs. DFT, иногда это сильно зависит от функционала. Я в своей работе встречал случаи, когда O3LYP давал почти ту же геометрию (если говорить о ней) что и MP2 в базисах Даннинга.

Такие пироги.

Аватара пользователя
SSR
Сообщения: 230
Зарегистрирован: Пн окт 01, 2007 9:06 pm

Сообщение SSR » Ср ноя 14, 2007 6:33 pm

К сожалению, мы опять вынуждены рассуждать несколько беспредметно, поскольку не имеем понятия о каких именно системах идёт речь! В любом случае на первом шаге может оказаться разумно использовать полуэмпирические методы (для большей части незамысловатой органики - самое оно) или даже методы молекулярной механики. Если всё ОК - дальше можете использовать ab initio методы, начиная с HF. Если соединение у вас содержит переходной металл, то, скорее всего, уже первым шагом для вас будет оптимизация с использование DFT (ну и начать в этом случае для закрытых оболочек разумно с B3LYP/6-31G(d)). Yu/2, на мой взгляд, сделал вполне резонные замечания.
Последний раз редактировалось SSR Сб ноя 24, 2007 5:59 pm, всего редактировалось 2 раза.
Если люди не полагают, что математика проста, то только потому, что они не понимают, как на самом деле сложна жизнь (Джон фон Нейман)

1177
Сообщения: 148
Зарегистрирован: Пн июн 19, 2006 11:49 am

Сообщение 1177 » Ср ноя 14, 2007 8:02 pm

Крайне незамысловатая (но приличная по размеру :D ) органика

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1485
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Сообщение surius » Чт ноя 15, 2007 7:47 am

1177 писал(а):Крайне незамысловатая (но приличная по размеру :D ) органика
Органику на бочку! :D
"Bite my shiny metal ass"
Bender

eukar

Сообщение eukar » Чт ноя 15, 2007 10:33 am

surius писал(а):
1177 писал(а):Крайне незамысловатая (но приличная по размеру :D ) органика
Органику на бочку! :D
Кажется, на программерских форумах это называется "Код в студию!" :)

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1485
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Сообщение surius » Чт ноя 15, 2007 10:42 am

eukar писал(а):
surius писал(а):
1177 писал(а):Крайне незамысловатая (но приличная по размеру :D ) органика
Органику на бочку! :D
Кажется, на программерских форумах это называется "Код в студию!" :)
Ну или как версия: "Кота из мешка!"
"Bite my shiny metal ass"
Bender

1177
Сообщения: 148
Зарегистрирован: Пн июн 19, 2006 11:49 am

Сообщение 1177 » Чт ноя 15, 2007 3:05 pm

Например:

CH3(CH2)2CHCH3(CH2)6CHCH3(CH2)2CH3

4,11-диметилтетрадекан

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2021
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Сообщение amge » Пт ноя 16, 2007 8:26 am

1177 писал(а):Например ... 4,11-диметилтетрадекан
IMHO, геометрию подобных алканов можно считать любым методом, хоть молекулярной механикой, и получится неплохо. Что касается энергетики, то тут надо осторожнее, например, имеется статья с названием "Systematic Errors in Computed Alkane Energies Using B3LYP and Other Popular DFT Functionals" (линейные vs. разветвленные алканы, в обменнике).

1177
Сообщения: 148
Зарегистрирован: Пн июн 19, 2006 11:49 am

Сообщение 1177 » Пт ноя 16, 2007 1:53 pm

amge, спасибо. очень интересная ссылка.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Сообщение VTur » Сб ноя 17, 2007 11:27 am

1177 писал(а):Например:

CH3(CH2)2CHCH3(CH2)6CHCH3(CH2)2CH3

4,11-диметилтетрадекан
Если требуется только геометрия, то даже нарисованная в ГауссВью или ЧемОфисе и даже руками для таких алканов будет в пределах погрешности.
Что требуется кроме геометрии?

1177
Сообщения: 148
Зарегистрирован: Пн июн 19, 2006 11:49 am

Сообщение 1177 » Сб ноя 17, 2007 1:56 pm


Ответить

Вернуться в «физическая химия / physical chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 20 гостей