Наивный вопрос по вкладам АО

обсуждение вопросов физической химии и химической физики
physical chemistry and chemical physics: discussions for professionals
VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Ср мар 04, 2009 10:16 am

jablonsky писал(а):VTur: коэффициенты мы трактуем в строгом соответствии с подходом ЛКАО. Цель расчетов - характеристики граничных орбиталей, описано в книжке Nguyen Trong Anh.
Не, книжку я читать не буду. Перескажите, что там написано.
А в тех книжках, что я читаю, никаких трактовок коэффициентов АО нет. Считается, что они физического смысла не имеют.
После отстоя требуйте долива

Nik®
Сообщения: 92
Зарегистрирован: Пн апр 09, 2007 11:58 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение Nik® » Ср мар 04, 2009 11:13 am

jablonsky писал(а):В моем случае вся химия связана с сопряженным нуклеофильным присоединением (реакция Михаэля). Фишка в том, что двойных связей в ненасыщеном кетоне несколько, а нуклеофил присоединяется только к одной. Вот и занимаемся региоселективностью: заряды, вклады орбиталей. Дело еще в том, что вклад pz не всегда наибольший. А может известны еще какие-либо расчетные факторы региоселективности?

VTur: коэффициенты мы трактуем в строгом соответствии с подходом ЛКАО. Цель расчетов - характеристики граничных орбиталей, описано в книжке Nguyen Trong Anh.
Попробуйте использовать функции электрофильности и нуклеофильности Фукуи, очень хорошо помогают обьяснить и предсказать наблюдаемую региоселективность

Darth Vasya
Сообщения: 426
Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение Darth Vasya » Ср мар 04, 2009 1:55 pm

jablonsky писал(а):А может известны еще какие-либо расчетные факторы региоселективности?
Конечно! Тепловой эффект и энергетические барьеры различных путей! :D
Плохо зная грамматику, сложные конструкции должны употребляться с осторожностью.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Ср мар 04, 2009 6:52 pm

Nik® писал(а):Попробуйте использовать функции электрофильности и нуклеофильности Фукуи, очень хорошо помогают обьяснить и предсказать наблюдаемую региоселективность
Так же желательно проверить локальную и глобальную жесткости и мягкости.
DFT.pdf
Шучу! Сам не считаю, а другим советую.
После отстоя требуйте долива

Bunev
Сообщения: 10
Зарегистрирован: Пт янв 23, 2009 8:26 am

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение Bunev » Чт мар 05, 2009 2:39 pm

Необязательно чтобы они были больше, больше должно быть у реагирующий орбитали. В вашем случае вполне достаточно посчитать индексы Фукуи, для объяснения наблюдаемой региоселективности.

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение EvgeniX » Чт мар 05, 2009 7:58 pm

jablonsky писал(а):В моем случае вся химия связана с сопряженным нуклеофильным присоединением (реакция Михаэля). Фишка в том, что двойных связей в ненасыщеном кетоне несколько, а нуклеофил присоединяется только к одной. Вот и занимаемся региоселективностью: заряды, вклады орбиталей. Дело еще в том, что вклад pz не всегда наибольший. А может известны еще какие-либо расчетные факторы региоселективности?
Самый главный фактор - активационные барьеры различных путей присоединения.

jablonsky
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Ср окт 08, 2008 12:06 am

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение jablonsky » Пт мар 06, 2009 3:28 am

Тепловой эффект и энергетические барьеры различных путей конечно посчитаны, но они представляют собой лишь следствие электронных свойств реагентов (т.е. например, если заряд в одном месте выше, то и энергетические параметры реакции по этому месту будут лучше). Хочется докопаться до исходных причин. Am I right?

Спасибо за обзор по DFT, углубляюсь. Теперь вопрос по индексам Фукуи и ЖМКО: я так понял они считаются только DFT? Можно ли это посчитать в Hyperchem (в литературе есть данные, вроде считали)? Может есть книжки/мануалы по расчетам этих параметров?

Darth Vasya
Сообщения: 426
Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение Darth Vasya » Пт мар 06, 2009 1:48 pm

jablonsky писал(а):Тепловой эффект и энергетические барьеры различных путей конечно посчитаны, но они представляют собой лишь следствие электронных свойств реагентов
Ну это как сказать. Это примерно как "значения функции и всех её производных в данной точке полностью определяют её поведение во всех остальных точках": в большинстве случаев, когда это вообще справедливо, толку с этого на сколько-нибудь интересном удалении от данной точки никакого :)

На самом деле всё суть следствия решения (в нашем приближении) уравнения Шрёдингера для электронной подсистемы с ядерными координатами в качестве параметров, а дальше уже между этими следствиями могут существовать или не существовать корреляции. В данном случае объективной действительностью являются энергии и барьеры, а некие "электронные свойства" - это уже ваша интерпретация объективной действительности. А там уж выбирайте, чему больше доверять :)
Плохо зная грамматику, сложные конструкции должны употребляться с осторожностью.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Пт мар 06, 2009 6:21 pm

Darth Vasya писал(а):Ну это как сказать. Это примерно как "значения функции и всех её производных в данной точке полностью определяют её поведение во всех остальных точках":
Дак, это "голографическая теорема" Мезея. Это уже 10 лет общее место в квантовой физике молекул, но химики энто не замечают.
принцип для скрытых молекулярных свойств.pdf
электронная плотность и функциональные группы в квантовой химии.pdf
теоремы молеклярного распознавания.pdf
голографической электронной плотности и меры квантового моделирования.pdf
После отстоя требуйте долива

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Пт мар 06, 2009 6:25 pm

jablonsky писал(а):Хочется докопаться до исходных причин. Am I right?
Исходные причины - распределение электронной плотности и её подвижность. А коэффициенты перед орбиталями в разных расчетах различные, и ни какого смысла не имеют.
jablonsky писал(а):Теперь вопрос по индексам Фукуи и ЖМКО: я так понял они считаются только DFT?
В другом формализме они просто не определены и существуют только в рамках DFT.
jablonsky писал(а):Можно ли это посчитать в Hyperchem (в литературе есть данные, вроде считали)? Может есть книжки/мануалы по расчетам этих параметров?
В Hyperchem лучше вообще ничего не считать. Это полуучебная программа.
После отстоя требуйте долива

jablonsky
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Ср окт 08, 2008 12:06 am

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение jablonsky » Вс мар 08, 2009 5:56 pm

VTur писал(а):Исходные причины - распределение электронной плотности и её подвижность. А коэффициенты перед орбиталями в разных расчетах различные, и ни какого смысла не имеют.
Ну, заряды тоже могут сильно различаться в зависимости от метода расчета. А спор про вклады переходит в стадию "-имеют смысл! - нет, не имеют!". Я так понимаю Вы вообще отрицаете сам факт орбитального контроля?
Могут ли зависеть результаты расчета от программы (при одном и том же методе расчета)?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Вс мар 08, 2009 7:41 pm

jablonsky писал(а):Ну, заряды тоже могут сильно различаться в зависимости от метода расчета.
Заряды различаются от того, как Вы определяете атомы, несущие этот заряд. Если никак - то и заряды фикция. В большинстве методов к зарядам на атомах надо относится, как к заявлениям правительства по подъёму науки.
jablonsky писал(а): А спор про вклады переходит в стадию "-имеют смысл! - нет, не имеют!". Я так понимаю Вы вообще отрицаете сам факт орбитального контроля?
Этот контроль зависит и от метода, и от базиса. А смысла коэффициенты аппроксимации, по-определению, не имеют
jablonsky писал(а):Могут ли зависеть результаты расчета от программы (при одном и том же методе расчета)?
Ещё как!
После отстоя требуйте долива

jablonsky
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Ср окт 08, 2008 12:06 am

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение jablonsky » Вс мар 08, 2009 10:02 pm

В итоге получается, что все расчеты сильно зависят от человека-оператора: какой он выберет метод, базисы, программу... по принципу "Ой нет, это плохо объясняет наблюдаемое в эксперименте, попробуем еще что-нибудь". Так? Или вообще квантовая химия ради квантовой химии?..

А еще по индексам Фукуи: да, они определены в DFT, но с другой стороны, при использовании формулы для функции нуклеофильной атаки [f+ = q (N+1) − q (N) ], где q - это заряд на атоме, я могу же использовать заряды, рассчитанные полуэмпирически или как угодно еще? Или это в принципе некорректно?

Darth Vasya
Сообщения: 426
Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение Darth Vasya » Пн мар 09, 2009 10:08 am

jablonsky писал(а):все расчеты сильно зависят от человека-оператора: какой он выберет метод, базисы, программу... по принципу "Ой нет, это плохо объясняет наблюдаемое в эксперименте, попробуем еще что-нибудь"
Конечно, зависит. А в эксперименте как будто по-другому :)

Грубо говоря, если человек-оператор знает, какой метод достаточно хорошо отвечает на его вопрос, то результат будет хороший. А если плохо знает, то может получиться плохой. Под "наблюдаемое в эксперименте", конечно, тоже всегда можно подгонять, но это уже не вполне наука. Да и точно так же можно под что-нибудь подгонять это самое наблюдаемое.
Плохо зная грамматику, сложные конструкции должны употребляться с осторожностью.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2021
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение amge » Пн мар 09, 2009 12:01 pm

VTur писал(а):
jablonsky писал(а):Могут ли зависеть результаты расчета от программы (при одном и том же методе расчета)?
Ещё как!
Более того, даже при расчетах одним и тем же методом одной и той же программой запросто можно получить разные результаты (например, если оптимизировать геометрию гибкой молекулы при различных ограничениях на минимальные градиенты). Но если метод/базис одинаковы, а ограничительные параметры сопоставимы, то расчет различными программами должен дать одно и то же. Здесь как и в любом другом эксперименте: все зависит от подробности описания и/или опыта. Например, разгонку смеси другой химик не воспроизведет, если, например, использует более короткий, чем у его предшественника, дефлегматор.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Пн мар 09, 2009 12:34 pm

jablonsky писал(а):В итоге получается, что все расчеты сильно зависят от человека-оператора: какой он выберет метод, базисы, программу... по принципу "Ой нет, это плохо объясняет наблюдаемое в эксперименте, попробуем еще что-нибудь". Так? Или вообще квантовая химия ради квантовой химии?..
Чем лучше Вы учитываете межъэлектронную корреляцию и больше базис, тем данные правильнее и их погрешность меньше - они точнее. Хотя случайно можно получить в малом базисе и простом методе требуемую величину, но это будет случайность, и для других случаев может не повториться или дать очень большую погрешность. Численные значения в молмеханике и полуэмпирике не должны приниматься в расчет вообще, должно быть только качественное сравнение.
jablonsky писал(а):А еще по индексам Фукуи: да, они определены в DFT, но с другой стороны, при использовании формулы для функции нуклеофильной атаки [f+ = q (N+1) − q (N) ], где q - это заряд на атоме, я могу же использовать заряды, рассчитанные полуэмпирически или как угодно еще? Или это в принципе некорректно?
Полуэмпирические заряды, заряды по Малликену, Лёвдину и натуральные в природе не существуют. Это удобная фикция - в этих теориях нет атомов.
После отстоя требуйте долива

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Пн мар 09, 2009 12:39 pm

к jablonsky
Для меня принцип простой - все, что связано с орбиталями, смысла не имеет и использовать эти данные глупо. оНи в природе не существуют.
В молекулах есть электронная плотность, вот её и надо анализировать. Она существует, следовательно, существуют и её свойства.
После отстоя требуйте долива

Darth Vasya
Сообщения: 426
Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение Darth Vasya » Пн мар 09, 2009 1:13 pm

VTur писал(а):Численные значения в молмеханике и полуэмпирике не должны приниматься в расчет вообще, должно быть только качественное сравнение.
Ну какие тут возможны "вообще"? Можно и принимать, просто необходимо знать точно, насколько и в каких пределах их можно принимать для данных систем и свойств. Если Вам ни разу в жизни не пригодилась ММ, это ещё не повод всех, кто всерьёз относится к полученным с её помощью результатам, записывать в дураки :D
Плохо зная грамматику, сложные конструкции должны употребляться с осторожностью.

jablonsky
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Ср окт 08, 2008 12:06 am

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение jablonsky » Пн мар 09, 2009 4:26 pm

Ну, некоторые утверждают, что и в электроны не верят: "Я их не видел". Орбиталей не существует??? Это в смысле молекулярных или атомных?

Да, полуэмпирические расчеты крайне неточно отражают эксперимент, но, например, тенденцию при варьировании заместителя и общую картину электронного строения молекулы они ведь передают. Или как?

И еще: по общему мнению квантового народа Hyperchem - довольно плохая программа. А можно узнать почему? В нем не реализованы какие-то важные алгоритмы, или считает неправильно, с большой погрешностью? Математика-то по идее во всех прогах одинаковая?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Наивный вопрос по вкладам АО

Сообщение VTur » Пн мар 09, 2009 8:36 pm

Darth Vasya писал(а):
VTur писал(а):Численные значения в молмеханике и полуэмпирике не должны приниматься в расчет вообще, должно быть только качественное сравнение.
Ну какие тут возможны "вообще"? Можно и принимать, просто необходимо знать точно, насколько и в каких пределах их можно принимать для данных систем и свойств. Если Вам ни разу в жизни не пригодилась ММ, это ещё не повод всех, кто всерьёз относится к полученным с её помощью результатам, записывать в дураки :D
Я привык верить цифрам, для которых можно указать погрешность. Для ММ и полуэмпирики погрешности настолько велики, что можно проводить только качественные сравнения (больше - меньше, стабильнее - менее стабильное). Если цифры близки (различие 2 - ккал/моль), сравнение может дать и обратный результат. Когда различия в разы, то сравнению можно верить. Мы проводили сравнения известных термодинамических свойств и дипольных моментов.
После отстоя требуйте долива

Ответить

Вернуться в «физическая химия / physical chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 16 гостей