Построение молекул в программе Hyperchem

вопросы строения молекул и квантовой химии
plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Вс апр 12, 2009 9:06 pm

Объясните, пожалуйста, как строить хлоргидраты органических соединений в Hypercheme (например, хлоргидрат 3-этоксикарбометилглутаконового альдегида) и молекулу N-фенил-3-этоксикарбометилпиридиний хлорид.

Polychemist
Сообщения: 9163
Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение Polychemist » Вс апр 12, 2009 9:38 pm

А какие проблемы просто шлепнуть дополнительный водород к нужному азоту, где-то рядом хлор, потом быстренько оптимизнуть полуэмпирикой?

Аватара пользователя
Бухалыч
Сообщения: 1789
Зарегистрирован: Сб июн 02, 2007 1:44 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение Бухалыч » Вс апр 12, 2009 11:01 pm

И для большей лучшести поставить Formal Charges

plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Пн апр 13, 2009 12:47 pm

Плюс на азоте и минус на хлоре надо ставить или программа сама это подразумевает? А проблема в том, что полученные расчеты совершенно не подтверждают экспериментальные данные и ранее сделанные расчеты полученных соединений имеют значения совсем другого порядка, влоть до разницы в знаке! (рассчитывали теплоту образования). Вот это и вызвало вопрос.

Аватара пользователя
Бухалыч
Сообщения: 1789
Зарегистрирован: Сб июн 02, 2007 1:44 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение Бухалыч » Пн апр 13, 2009 1:54 pm

Дык полуэмпирика тем и "хороша", что результат зачастую зависит от начальной геометрии.
Заряды, как уже было сказано, лучше ставить самостоятельно.
И не забывайте проверять спиновые мультиплетности.

VTur
Сообщения: 7360
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение VTur » Вт апр 14, 2009 5:24 pm

plenochnik писал(а): А проблема в том, что полученные расчеты совершенно не подтверждают экспериментальные данные и ранее сделанные расчеты полученных соединений имеют значения совсем другого порядка, влоть до разницы в знаке! (рассчитывали теплоту образования).
Это Вы на полном серьёзе из полуэмпирики получаете теплоту образования? Возьмите лучше любую аддитивную модель, результата будет намного точнее.
После отстоя требуйте долива

plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Вт апр 14, 2009 10:22 pm

если бы я еще знала, что это такое......и как с этим жить.....Помогите!!! Диплом рушится!!!!

plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Вт апр 14, 2009 10:40 pm

Просто по экспериментальным данным образуется соединение Хлоргидрат дианила 3-этоксиарбометилглутаконового альдегида, а не N-фенил-3-этоксикарбометилпиридиний хлорид. По расчетам же у меня получается наоборот!!!! Теплота образования второго соединения получается меньше, чем первого!!!!! Попробуйте, пжл, кто-нить посчитать...мож у вас получится!!!

VTur
Сообщения: 7360
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение VTur » Вт апр 14, 2009 10:46 pm

У меня от одного названия глаза на лоб лезут. Если в нем столько атомов, сколько букофф, то проще написать некую похожую цифру и сказать, что взял в инете.
После отстоя требуйте долива

Marxist

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение Marxist » Вт апр 14, 2009 10:51 pm

Просто не надо считать в гиперкеме.

plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Вт апр 14, 2009 11:16 pm

а в чем считать тогда?

Marxist

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение Marxist » Вт апр 14, 2009 11:35 pm

В чём угодно. Полно программ.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 1862
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение amge » Ср апр 15, 2009 8:40 am

plenochnik писал(а):Просто по экспериментальным данным образуется соединение Хлоргидрат дианила 3-этоксиарбометилглутаконового альдегида, а не N-фенил-3-этоксикарбометилпиридиний хлорид. По расчетам же у меня получается наоборот!!!! Теплота образования второго соединения получается меньше, чем первого!!!!! Попробуйте, пжл, кто-нить посчитать...мож у вас получится!!!
Хоть бы формулы нарисовали, прежде чем просить о помощи :cry:

plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Ср апр 15, 2009 3:40 pm

Написала :)

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2719
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение EvgeniX » Ср апр 15, 2009 3:57 pm

plenochnik писал(а):Написала :)
Это совсем разные соединения, даже не изомеры.
Рекомендую почитать книги по термодинамике.

Polychemist
Сообщения: 9163
Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение Polychemist » Ср апр 15, 2009 4:47 pm

plenochnik писал(а):Написала :)
Скачал. И не смог открыть? Это в чем :shock: ? Считать можно во всем, если знать как... Как я понял, в HC Вы считали. Вопрос - как?

plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Ср апр 15, 2009 6:39 pm

Это и не должны были быть изомеры. Закачивала в обычном вордовском файле. Может потому что в новом ворде делала.... :( Считала обыным путем: построила молекулу, на азоте плюсик поставила....Водороды добавила......потом молекулярной механикой, а потом PM3....
пробовала строить и в виде хлоргидратов.....добавила хлор с минусом-дальше как обычно.

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2719
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение EvgeniX » Ср апр 15, 2009 6:41 pm

plenochnik писал(а):Это и не должны были быть изомеры.
Как в таком случае оценивается выгодность образования одного из двух соединений? Как сравниваются энергии (энтальпии)?

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2719
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение EvgeniX » Ср апр 15, 2009 6:47 pm

Polychemist писал(а):
plenochnik писал(а):Написала :)
Скачал. И не смог открыть?
Это MS Word 2007. Сконвертировал в 2003.

PS: Но название файла можно было и указать...

plenochnik
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Сб фев 09, 2008 4:37 pm
Контактная информация:

Re: Построение молекул в программе Hyperchem

Сообщение plenochnik » Ср апр 15, 2009 8:49 pm

Вкратце изложу предложенную моим руководителем концепцию диплома: были проведены реакции кетодиацеталей с аммиаком, ароматическими и алифатическими аминами(первичными). В результате получилось, что с аммиаком и алифатическим аминами реакция протекает с образованием цикла, а с ароматическим амином- полиеновая цепь. Так получилось экспериментально. Хотели это объяснить с помощью теплот образования, например в случае с аммиаком рассчитать теплоту образования полученного циклического соединения и возможной полиеновой цепи. Так как реакция прошла с образованием цикла, то по идее теплота образования у него должна быть ментше, чем у соответствующего полиена. Если это все бред, то скажите об этом, пжл, потому что я в физхимии полный ноль, и вообще хочу закончить институт и чтобы химия осталась приятным воспоминанием молодости! :D

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 5 гостей