+++Поиск в Reaxys

как найти книгу или статью? не поделится ли кто-нибудь программой? если у вас такой вопрос - значит, вам сюда!
Ответить
mishka
Сообщения: 4613
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

+++Поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Чт апр 01, 2010 1:35 am

Нельзя ли поискать в Reaxys соединения, отвечающие данной субструктуре, и для которых одновременно имеются какие-нибудь данные по биоактивности с выводом биоданных.

Структуру набирал в IsisDraw с дополнительными опциями, при этом:

Все связи в пятичленном цикле Single/Double (т.е. или одинарная или двойная)
GH* - Any Group or H (Ring closure allowed)
A - любой атом
steric - descriptor, указывающий на транс двойную связь


Заранее большое спасибо!!!

P.S. Возможно следует перенабрать данную структуру в своей базе (не знаю насколько совместимы набранные символы атомов, групп и связей на разных системах);
Надеюсь, что количество данных будет укладываться в разумные рамки...
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Последний раз редактировалось mishka Пт апр 02, 2010 11:52 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
suprachemister
Сообщения: 4884
Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm

Re: Поиск в Reaxys

Сообщение suprachemister » Чт апр 01, 2010 4:44 am

Срисовал.
Реаксис: 0 результатов.

Какой тип связи в пятичленном кольце?
Если поставить any, то получим 60000 соединений, из которых 4800 с pharmacological data

mishka
Сообщения: 4613
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: Поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Чт апр 01, 2010 9:46 am

suprachemister спасибо за проведенный поиск!
Для ограничения можно было бы задать условие, что по крайней мере один из атомов в пятичленном цикле является азотом.
Наверное можно это сделать в виде поиска трех отдельных структур, в которых нарисован один атом азота в 5-чл. цикле и почередно изменено его местоположение.
Тип связи в пятичленном кольце - any (или можно single/double).

Аватара пользователя
suprachemister
Сообщения: 4884
Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm

Re: Поиск в Reaxys

Сообщение suprachemister » Пт апр 02, 2010 10:53 pm

Сделал поиск как в первом варианте ( атом азота не ставил)
тип связи в кольце поставил any
pharmacological data по 4785 компаундам :arrow:

Код: Выделить всё

http://ifile.it/x2iehsu

mishka
Сообщения: 4613
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: Поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Пт апр 02, 2010 11:51 pm

Да Вы просто неоценимую помощь приносите, причем многим.
СПАСИБО. ОЧЕНЬ ОЧЕНЬ БОЛЬШОЕ СПАСИБО.

Ответить

Вернуться в «обмен книгами, статьями, программами»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей