Нельзя ли поискать в Reaxys соединения, отвечающие данной субструктуре, и для которых одновременно имеются какие-нибудь данные по биоактивности с выводом биоданных.
Структуру набирал в IsisDraw с дополнительными опциями, при этом:
Все связи в пятичленном цикле Single/Double (т.е. или одинарная или двойная)
GH* - Any Group or H (Ring closure allowed)
A - любой атом
steric - descriptor, указывающий на транс двойную связь
Заранее большое спасибо!!!
P.S. Возможно следует перенабрать данную структуру в своей базе (не знаю насколько совместимы набранные символы атомов, групп и связей на разных системах);
Надеюсь, что количество данных будет укладываться в разумные рамки...
+++Поиск в Reaxys
+++Поиск в Reaxys
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Последний раз редактировалось mishka Пт апр 02, 2010 11:52 pm, всего редактировалось 1 раз.
- suprachemister
- Сообщения: 4884
- Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm
Re: Поиск в Reaxys
Срисовал.
Реаксис: 0 результатов.
Какой тип связи в пятичленном кольце?
Если поставить any, то получим 60000 соединений, из которых 4800 с pharmacological data
Реаксис: 0 результатов.
Какой тип связи в пятичленном кольце?
Если поставить any, то получим 60000 соединений, из которых 4800 с pharmacological data
Re: Поиск в Reaxys
suprachemister спасибо за проведенный поиск!
Для ограничения можно было бы задать условие, что по крайней мере один из атомов в пятичленном цикле является азотом.
Наверное можно это сделать в виде поиска трех отдельных структур, в которых нарисован один атом азота в 5-чл. цикле и почередно изменено его местоположение.
Тип связи в пятичленном кольце - any (или можно single/double).
Для ограничения можно было бы задать условие, что по крайней мере один из атомов в пятичленном цикле является азотом.
Наверное можно это сделать в виде поиска трех отдельных структур, в которых нарисован один атом азота в 5-чл. цикле и почередно изменено его местоположение.
Тип связи в пятичленном кольце - any (или можно single/double).
- suprachemister
- Сообщения: 4884
- Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm
Re: Поиск в Reaxys
Сделал поиск как в первом варианте ( атом азота не ставил)
тип связи в кольце поставил any
pharmacological data по 4785 компаундам
тип связи в кольце поставил any
pharmacological data по 4785 компаундам
Код: Выделить всё
http://ifile.it/x2iehsu
Re: Поиск в Reaxys
Да Вы просто неоценимую помощь приносите, причем многим.
СПАСИБО. ОЧЕНЬ ОЧЕНЬ БОЛЬШОЕ СПАСИБО.
СПАСИБО. ОЧЕНЬ ОЧЕНЬ БОЛЬШОЕ СПАСИБО.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 11 гостей