Добрый день!
Имеется синтезатор ДНК (ABS), синтезируем праймеры фосфорамидитным способом. Есть "Анализатор ДНК", который работает только с флуоресцентной меткой "Су 5".
Хочу попробовать "пришить" эту метку к олигам. В наличии есть метка "Су 5" в виде "Су 5 amidite" (Amersham Biosciences) и "Cy 5 dCTP" (Amersham Biosciences)
Помогите с методикой "пришивки" и последующей очистки.
Заранее благодарна.
Нужна помощь в синтезе олига с меткой "Су 5"
Re: Нужна помощь в синтезе олига с меткой "Су 5"
У вас 3 варианта на выбор.
1)При синтезе олига добавляете еще одну букву в конце, но эта буква будет Су 5 amidite
Вот ссылка
http://www.gelifesciences.com/aptrix/up ... Leads6.pdf
2) Уже с обычным синтезированным и снятым почищенным олигом проводите реакцию с Cy 5 dCTP и терминальной дезоксинуклеотидил трансферазой протокол вот здесь:
http://www.sileks.com/main/descr/zip/Biozond.zip
При этом насколько я понял пометятся разные концы олига
3) вариант сделать и первое и второе, тогда пометятся два разных конца олига
1)При синтезе олига добавляете еще одну букву в конце, но эта буква будет Су 5 amidite
Вот ссылка
http://www.gelifesciences.com/aptrix/up ... Leads6.pdf
2) Уже с обычным синтезированным и снятым почищенным олигом проводите реакцию с Cy 5 dCTP и терминальной дезоксинуклеотидил трансферазой протокол вот здесь:
http://www.sileks.com/main/descr/zip/Biozond.zip
При этом насколько я понял пометятся разные концы олига
3) вариант сделать и первое и второе, тогда пометятся два разных конца олига
Re: Нужна помощь в синтезе олига с меткой "Су 5"
avor, огромное спасибо! Спасли жизнь человеку 
Re: Нужна помощь в синтезе олига с меткой "Су 5"
Если вдруг окажется, что выход целевых олигов невелик (особенно через амидит), то можете попробовать прогрессивную технологию:
Код: Выделить всё
http://www.biodye.ru/oligo_kitsRe: Нужна помощь в синтезе олига с меткой "Су 5"
Спасибо за совет, гаер*
Этот вариант мы тоже рассматриваем. И скорее всего будем "метить" праймеры Вашим способом.
Этот вариант мы тоже рассматриваем. И скорее всего будем "метить" праймеры Вашим способом.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 7 гостей