перспективы медхимии

вопросы современной биологической химии, молекулярной биологии, химической энзимологии и смежных наук
biochem, molbio, chemical enzymology and related discussions for professionals
Cherep
Сообщения: 22226
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: перспективы медхимии

Сообщение Cherep » Пн дек 29, 2014 11:21 pm

Растворяется он хуже поди из-за межмолекулярных взаимодействий в кристалле, которые надо растворителю разрушить, не?

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Пн янв 05, 2015 11:12 am

я выразился не правильно ..... "хуже растворяется" - типа скорость растворения, я имел ввиду растворимость, т.е. кол-во мг в 1 мл воды.
.....
Последний раз редактировалось Vanya Ivanov Чт янв 08, 2015 9:07 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4050
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение uchebnik fiziki » Пн янв 05, 2015 11:52 am

и что этот частичный заряд покажет?
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Вт янв 06, 2015 11:58 pm

спасибо
Последний раз редактировалось Vanya Ivanov Чт янв 08, 2015 9:08 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 9386
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Гесс » Ср янв 07, 2015 2:32 am

Vanya Ivanov писал(а):ну он должен быть больше на единицу площади у сульфамида .... нет? За счет чего этот эффект возникает? Объяснение должно быть простым ...
единицу чьей площади?

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4050
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение uchebnik fiziki » Ср янв 07, 2015 10:54 am

Vanya Ivanov писал(а):Объяснение должно быть простым ...
Кому должно? Объяснение с привлечением неясных функций простым быть не может.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Чт янв 22, 2015 5:32 pm

Тут попалась на глаза на глаза фраза, что российский препарат "зоракс" принес разработчикам 15-20 раз больше чистой прибыли, чем они затратили на разработку. Т.е. для разработчиков (не производители) - это близко к рекорду! Посмотрел на состав фарм субстанции - эфир унитиола и пантотеновая к-та. Вот не понятно со структурой самого унитиола .... что там за эфир?
Посмотрел сайт wikipedia - "димеркапрол" - его струкутура, хим название и брутто-формула - вообще жесть? Что там должно быть? Наверно все же Na соль простого эфир сульфо-к-ты?

chemistryandron
Сообщения: 132
Зарегистрирован: Чт июл 09, 2009 4:19 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение chemistryandron » Чт янв 22, 2015 9:38 pm

Vanya Ivanov писал(а):Тут попалась на глаза на глаза фраза, что российский препарат "зоракс" принес разработчикам 15-20 раз больше чистой прибыли, чем они затратили на разработку. Т.е. для разработчиков (не производители) - это близко к рекорду!
Откуда информация? И может не "зоракс", а "зорекс" :roll: ?
http://www.rlsnet.ru/tn_index_id_34225.htm
http://zorex.ru/vracham/
Vanya Ivanov писал(а): Посмотрел на состав фарм субстанции - эфир унитиола и пантотеновая к-та. Вот не понятно со структурой самого унитиола .... что там за эфир?
Посмотрел сайт wikipedia - "димеркапрол" - его струкутура, хим название и брутто-формула - вообще жесть? Что там должно быть? Наверно все же Na соль простого эфир сульфо-к-ты?
Откуда и какой эфир унитиола? По ссылкам указанным ранее, состав "зорекса" следующий: димеркаптопропансульфонат натрия (унитиол) и кальция пантотенат. Про унитиол написано следующее (http://en.wikipedia.org/wiki/2,3-Dimerc ... fonic_acid):
2,3-Dimercapto-1-propanesulfonic acid (abbreviated DMPS) and its sodium salt (known as Unithiol)...
Таким образом о том, что на сайте:
https://ru.wikipedia.org/wiki/Димеркапрол
приведенно в качестве струтуры, хим. названия и брутто-формулы унитиола сами все сказали :issue: ... Вроде как, ЭТО не очень похоже на димеркапрол и тем более на унитиол :dontknow: .

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Чт янв 22, 2015 9:47 pm

Ага, спасибо. Что сам уже на ночь глядя затупил. Нужно было сразу у англо-саксов посмотреть. Будет время поправте что ли русскую версию ... или сам если доберусь. А вот интересно какой биохимически - фармакологический механизм действия этой комбинации как антипохмельного препарата? I have no clue.

chemistryandron
Сообщения: 132
Зарегистрирован: Чт июл 09, 2009 4:19 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение chemistryandron » Чт янв 22, 2015 10:29 pm

Vanya Ivanov писал(а):Ага, спасибо. Что сам уже на ночь глядя затупил. Нужно было сразу у англо-саксов посмотреть.
Не за что. Я в очередной раз убеждаюсь, что нашей википедией пользоваться очень осторожно нужно.
Vanya Ivanov писал(а): А вот интересно какой биохимически - фармакологический механизм действия этой комбинации как антипохмельного препарата? I have no clue.
Насчет механизма... Много что написано. Можно попробовать посмотреть и сопоставить (вроде как, в ссылках на русскую википедию ляпов нет):
https://ru.wikipedia.org/wiki/Похмелье
http://zorex.ru/vracham/
http://www.dissercat.com/content/reguly ... reparatami
http://www.google.com/patents/WO2008063099A1?cl=en
https://ru.wikipedia.org/wiki/Окислител ... е_пирувата
https://ru.wikipedia.org/wiki/Пантотеновая_кислота
А как все на самом деле... Например, из того, что я слышал выходит, что научного обоснованных показаний для применения пантотената нет. Любопытно, что хотя унитиол и дисульфирам не очень похожи по хим. стуктуре, но оба содержат серу и действуют на уровне ацетальдегидрогеназы. Про дисульфирам написано (http://en.wikipedia.org/wiki/Disulfiram)
Under normal metabolism, alcohol is broken down in the liver by the enzyme alcohol dehydrogenase to acetaldehyde, which is then converted by the enzyme acetaldehyde dehydrogenase to the harmless acetic acid. Disulfiram blocks this reaction at the intermediate stage by blocking acetaldehyde dehydrogenase.

Правда унитиол активирует ацетальдегидрогеназу, а дисульфирам ингибирует.
Последний раз редактировалось chemistryandron Пт янв 23, 2015 11:48 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Пт янв 23, 2015 4:33 pm

chemistryandron писал(а): Правда унитиол активирует ацетальдегидрогеназу, а дисульфирам ингибирует.
Ну так это и объясняет мол механизм антипохмельного действия. Ацетальдегид не накапливается - похмельный синдром отступает.
Хотя вот еще интересный момент .... все эти синтетические сульфгидриды конкуренты активным центрам меал-содержащих ферментов, в частности магнию/кальцию, а в активном центре алкоголь дегидрогеназ содержится Zn2+. а альдегид дегидрогеназы в активном центре лишь Cys-SH. Так может быть унитиол еще и притормаживает предыдущую р-цию и лимитирующая стадия попросту устраняется?
ADH-ALDH.GIF
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

chemistryandron
Сообщения: 132
Зарегистрирован: Чт июл 09, 2009 4:19 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение chemistryandron » Пт янв 23, 2015 11:44 pm

Vanya Ivanov писал(а): Ну так это и объясняет мол механизм антипохмельного действия. Ацетальдегид не накапливается - похмельный синдром отступает.
Это одно из объяснений. А связывание с ферментом (или ферментами, Ваша идея интересная, но почему-то везде пишут именно про взаимодействие с ацетальдегидрогеназой) является ли основным объяснением механизма действия зорекса? В инструкции данного лекарственного средства написано (http://zorex.ru/vracham/) еще вот что:
Активные сульфгидрильные группы димеркаптопропансульфоната натрия, взаимодействуя с тиоловыми ядами и продуктами метаболизма алкоголя (этанола), находящимися в крови и тканях, образуют с ними нетоксичные соединения (комплексы), которые выводятся с мочой. При приёме препарата внутрь активное вещество димеркаптопропансульфонат натрия с портальным кровотоком проникает в печень, где быстро и необратимо связывается с ацетальдегидом, что вызывает последующее выведение этилового спирта из других органов и тканей.
Да. И как Вы писали ранее:
Vanya Ivanov писал(а):какой биохимически - фармакологический механизм действия этой комбинации как антипохмельного препарата?
в данном лекарственном средстве кроме унитиола содержится еще и кальция пантотенат. А он там зачем? На сайте (ссылку давал ранее) написано:
Наличие кальция пантотената в составе препарата усиливает дезинтоксикационное действие димеркаптопропансульфоната натрия.
Пару ссылок даю (сам данные работы не читал, но может Вам интересно будет):
1.Moiseenok AG, et al. The Protective Effect of Pantothenic Acid Derivatives and Changes in the System of Acetyl CoA Metabolism in Acute Ethanol Poisoning. Farmakol Toksikol. Oct1988;51(5):82-86.
2.Chernikevich IP, et al. Possible ways of regulating detoxifying processes in the alcohol dehydrogenase reaction with pantothenic acid derivatives. Vopr Med Khim. Mar1993;39(2): 38-40.
Хотя, с другой стороны повторюсь, но в свое время на фармаше говорилось так:
научного обоснованных показаний для применения пантотената нет
Кстати еще интересно, что унитиол еще и сюда попал: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9505366
http://www.rostmaster.ru/lib/endodiabet ... 0084.shtml

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Вт мар 31, 2015 9:27 pm

тут встретил, карты электронной плотности биоизостеров - сложного эфира и оксадизола, изображение сделано в sybyl.
Я вот не помню - спартан там вроде цветные картинки распределения электронной плотности.
Не подскажет ли кто, можно ли получить такие же картинки в другом ПО?
bioisosters.jpg
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 9386
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Гесс » Вт мар 31, 2015 10:22 pm

Ниразу непонятно по какому принципу отсечены сектора, но вообще электронную плотность можно визуализировать почти в каждом визуализаторе, был бы cube wfn али иной какой файл хранящий подходящую инфу.
Один из наиболее мощных девайсов - vmd. Можно поморочить голову в gmolden

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Вт мар 31, 2015 11:03 pm

не сталкивался с этим софтом, .... щас посмотрим ...

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Сб апр 25, 2015 11:11 am

Коллеги помогите грамотно перевести термины:

Biased signaling
Biased agonist
ligand bias

В контексте:
Biased signaling is set to revolutionize pharmacology and drug discovery. It is now becoming established that agonists can be designed to selectively activate different components of the cell signaling pathway and that ligand bias may play a role in therapeutic efficacy or contribute to adverse responses, depending on the pathway activated. Biased agonists are now entering clinical trials. These ‘biased’ agonists hold the potential to enable therapeutic activation of a GPCR whilst avoiding unwanted side effects. However, challenges remain in fully understanding these implications for drug discovery and how exploiting this knowledge can be used to develop more effective medicines.
Явно это не термин "частичный, селективный или непрямой агонист", так как эти термины закреплены за веществами действующими на внеклеточную (наружную) часть рецептора GPCR. А "Biased agonist" действует на систему G-белков и арестина, т.е. на внутриклеточную часть рецептора, таким образом включая (выключая?) один или несколько сигнальных путей, из всех возможных, от одного рецептора. Может все же "не прямой агонист" , что то я отстал от этой тематики...

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3455
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: перспективы медхимии

Сообщение Upstream » Вс апр 26, 2015 6:50 am

Сдаётся мне, что за этой словестной игрой стоит горячее желание группы западных соискателей грантов выделиться в особое научное направление/бренд и утвердиться в качестве его основоположников. Если идти у них на поводу, то нужно сильно напрячься, чтобы подобрать адекватное русское определение, соответствующее приведённому выше толкованию, так как biased прямой благозвучной транслитерации не поддаётся, в отличие от, скажем, bisexual.
А если в это не упираться, то, ИМХО, модулирующий и модулятор, прижившиеся, главным образом, в иммунофармакологии, вполне по смыслу подходят:
модулирующие передачу сигнала
агонист-модулятор
лиганд, модулирущий ...

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1521
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: перспективы медхимии

Сообщение Vanya Ivanov » Вс апр 26, 2015 9:25 am

Upstream писал(а):....Если идти у них на поводу, то нужно сильно напрячься, чтобы подобрать адекватное русское определение, соответствующее приведённому выше толкованию ....
Ох ..... боюсь, что прийдется смотреть правде в глаза и принимать их правила игры. Они тратят кучу своих денег и "заказывают музычку". Нам до их результатов как до ..... (варианты различатся). Может не мудрить и не парить мозги (старческие остатки) и пойти по проторенной дорожке, адаптации англосаксонских терминов на русский?
биасетный лиганд (агонист) - звучит конечно, как привычный звук над унитазом, но со временем привыкнется и притрется?

Polychemist
Сообщения: 8577
Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am

Re: перспективы медхимии

Сообщение Polychemist » Вс апр 26, 2015 1:46 pm

Может уж тогда "биазетный"? По-русски вроде как ближе всего "однобокий" или "частичный".

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3455
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: перспективы медхимии

Сообщение Upstream » Вс апр 26, 2015 3:58 pm

"Таким образом, отдельно взятый лиганд может проявлять агонизм в отношении одних внутриклеточных событий и антагонизм в отношении других, причем отличиться от других лигандов по внутренней активности в отношении каждого конкретного процесса. В мировой литературе для обозначения таких функционально «асимметричных» лигандов используется термин biased ligand, которому в русском языке довольно сложно найти эффективный смысловой эквивалент, означающий тропность лиганда к тому или иному эффекторному каскаду. Ситуация усложняется тем, что для одного и того же подтипа рецепторов в зависимости от их анатомической локализации может быть доступен ограниченный спектр внутриклеточных путей передачи сигнала."

Functional selectivity (or “agonist trafficking”, “biased agonism”, “differential engagement” and “protein agonism”) is the ligand-dependent selectivity for certain signal transduction pathways in one and the same receptor. This can be present when a receptor has several possible signal transduction pathways. To which degree each pathway is activated thus depends on which ligand binds to the receptor.

Functional selectivity posits that a ligand may inherently produce a mix of the classic characteristics through a single receptor isoform depending on the effector pathway coupled to that receptor. For instance, a ligand can not easily be classified as an agonist or antagonist, because it can be a little of both, depending on its preferred signal transduction pathways. Thus, such ligands must instead be classified on the basis of their individual effects in the cell, instead of being either an agonist or antagonist to a receptor.


Дык, почему бы не "функционально-селективный" агонист/лиганд?
Biased signaling = фунционально селективное модулирование передачи сигнала/функциональная селективность влияния на передачу сигнала

Ответить

Вернуться в «биохимия и молекулярная биология / biochemistry and molecular biology»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 2 гостя