@ SPRESI reactions base

Ответить
Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

@ SPRESI reactions base

Сообщение Ivan110 » Пт дек 21, 2007 9:50 pm

Для интереса попробовал позагружать базу данных реакций из SPRESI.
В общем надо быть большим энтузиастом, чтобы всё закачать. В exchange
кусок примерно 190000 реакций. Для уменьшения трафика пришлось
оставить только поля: реакция, номер, выход, условия, ссылка, авторы
и название статьи. ISIS base не ниже Ver. 2.1. Так как выгружается в
виде RDF трафик составил 2.3 Гб. Поиск в ISIS-ной базе возможен по
подструктуре и по всем остальным полям.
Последний раз редактировалось Ivan110 Сб дек 22, 2007 12:44 am, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
Biginelli
Сообщения: 6027
Зарегистрирован: Сб окт 29, 2005 11:15 pm

Сообщение Biginelli » Сб дек 22, 2007 12:37 am

:shock: абалдеть...

Спасибо за самоотверженный труд!!!

Аватара пользователя
Archeolog
Сообщения: 1893
Зарегистрирован: Сб авг 27, 2005 2:08 pm
Контактная информация:

Сообщение Archeolog » Сб дек 22, 2007 9:13 pm

Простите мою безграмотность, а какой прогой эту базу принято открывать?
Я уже все решил, и не пытайтесь сбить меня с толку фактами!

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Сб дек 22, 2007 9:44 pm

ISIS Base с версией не ниже 2.1, пробовал версию 2.0.6 - взбрыкивает.

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Сб дек 22, 2007 9:59 pm

на всякий случай ссылка на ISIS/Base 2.1.4 (17487 кб):

Код: Выделить всё

http://chemister.pp.ru/Download/ISIS.zip

Vladimir1980
Сообщения: 179
Зарегистрирован: Вс ноя 04, 2007 11:11 pm

Сообщение Vladimir1980 » Вс дек 23, 2007 4:03 pm

Еще раз огромное спасибо Вам IVAN, за Ваш труд, который трудно переоценить! Спасибо за SPRESI, Scien*ce of synt*sis, за свежие выпуски журналов и мн.др.! А по какому принципу скачан этот кусок? По годам? Если, да, то с какого года по какой?

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Вс дек 23, 2007 4:15 pm

по номеру реакции: SPRESI_ID от 1 до 190000. (До заполнения базы в ISIS - к сожалению она поддерживает
максимальный объём 128 Mb, если туда догрузить ещё то выдаст ошибку и больше не будет работать)

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4237
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Пн дек 24, 2007 6:30 am

Я что-то не очень в теме... А что там можно найти?
Carpe diem

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Пн дек 24, 2007 9:52 am

Можно посмотреть идёт та или иная реакция в общей схеме или с конкретными
заместителями. Eсли идёт, то какие выходы и условия реакции, где описана
в литературе. Полная версия на сайте SPRESI содержит примерно 4 млн.
реакций и охватывает период 1974-2005 годы. Тут кусок первых 190000 реакций -
столько сколько можно ввести в одну базу ISIS.

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Чт дек 27, 2007 9:29 am

В exchange следующие 190000 реакций из базы (SPRESI_ID: 190001-400000).

Vladimir1980
Сообщения: 179
Зарегистрирован: Вс ноя 04, 2007 11:11 pm

Сообщение Vladimir1980 » Чт дек 27, 2007 11:21 am

Спасибо! Вы как очень щедрый Дед Морозподарок за подарком раздаете! :D А эти базы как-нибудь объединять в одну можно?

Аватара пользователя
N oxide
Сообщения: 507
Зарегистрирован: Вт ноя 06, 2007 4:01 pm

Сообщение N oxide » Чт дек 27, 2007 6:46 pm

как работать с базой??
чой-то не очень понятно... :cry:
пытаюсь открыть SPRESI_01 под ISIS base - не хочет, говорит "file not found".
Мож чего не так делаю?? подскажите :oops:

p.s. скачал ISIS/Base 2.1.4

Аватара пользователя
Abwer
Сообщения: 6265
Зарегистрирован: Пт июн 01, 2007 1:38 pm

Сообщение Abwer » Чт дек 27, 2007 7:15 pm

N oxide писал(а):как работать с базой??
чой-то не очень понятно... :cry:
пытаюсь открыть SPRESI_01 под ISIS base - не хочет, говорит "file not found".
Мож чего не так делаю?? подскажите :oops:

p.s. скачал ISIS/Base 2.1.4
Надо поместить файл на диск С... и чтобы в пути не было русских букафф, а то айсис может не понимать указаного пути

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Чт дек 27, 2007 9:37 pm

Объеденить в одну можно используя программу ISIS/Host - там нет ограничений по объёму баз.

Vitka
Сообщения: 42
Зарегистрирован: Ср фев 28, 2007 2:17 am

Сообщение Vitka » Пт дек 28, 2007 12:48 am

А на какой-нибудь торрент-трекер выложить можно? Удобнее будет

Wolf1
Сообщения: 348
Зарегистрирован: Пт дек 16, 2005 8:51 am

Сообщение Wolf1 » Пт дек 28, 2007 8:13 am

Vitka писал(а):А на какой-нибудь торрент-трекер выложить можно? Удобнее будет
Кому как. Когда трафик строго регламентирован проще малыми фрагментами.

Спасибо, Иван!!

Wolf1
Сообщения: 348
Зарегистрирован: Пт дек 16, 2005 8:51 am

Сообщение Wolf1 » Пт дек 28, 2007 8:24 am

Кстати Иван, а где нибудь есть в свободно доступе ISIS/Host ?

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Пт дек 28, 2007 9:12 am

Даже если найти ISIS/Host его поставить достаточно сложно. Сперва надо
поставить Oracle Enterprise Server for Windows. Та версия которая есть на
сайте Oracle очень требовательна к програмной и аппаратной части. Для неё
нужна 64-битная операционная среда Windows 2003 Server Enterprise (или
Datacenter Edition) и кроме того из аппаратных требований: не менее 2-х
64-бит. процессоров (двухядерные не подходят, нужна именно плата с 2 процес-
сорами). Я тут поспрашивал, в Москве никого не нашёл у кого Oracle стоит на
виндах. Eсли есть то установлено на Sun Solaris, а это уже нужен комп вообще
с другой архитектурой.

Wolf1
Сообщения: 348
Зарегистрирован: Пт дек 16, 2005 8:51 am

Сообщение Wolf1 » Пт дек 28, 2007 9:45 am

Да, действительно менять из-за программы комп. не серьезно.

Но вот такой вопрос, а ChemFinder из ChemOffice 2005 может с такими базами работать?

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Пт дек 28, 2007 10:02 am

Загружал в ChemFinder 10.0 из ChemOffice Ultra 2006 ver 10.0, работает -
но тормозит со страшной силой...

Ответить

Вернуться в «Полезные материалы от участников форума»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 2 гостя