Страница 1 из 13

@ SPRESI reactions base

Добавлено: Пт дек 21, 2007 9:50 pm
Ivan110
Для интереса попробовал позагружать базу данных реакций из SPRESI.
В общем надо быть большим энтузиастом, чтобы всё закачать. В exchange
кусок примерно 190000 реакций. Для уменьшения трафика пришлось
оставить только поля: реакция, номер, выход, условия, ссылка, авторы
и название статьи. ISIS base не ниже Ver. 2.1. Так как выгружается в
виде RDF трафик составил 2.3 Гб. Поиск в ISIS-ной базе возможен по
подструктуре и по всем остальным полям.

Добавлено: Сб дек 22, 2007 12:37 am
Biginelli
:shock: абалдеть...

Спасибо за самоотверженный труд!!!

Добавлено: Сб дек 22, 2007 9:13 pm
Archeolog
Простите мою безграмотность, а какой прогой эту базу принято открывать?

Добавлено: Сб дек 22, 2007 9:44 pm
Ivan110
ISIS Base с версией не ниже 2.1, пробовал версию 2.0.6 - взбрыкивает.

Добавлено: Сб дек 22, 2007 9:59 pm
Ivan110
на всякий случай ссылка на ISIS/Base 2.1.4 (17487 кб):

Код: Выделить всё

http://chemister.pp.ru/Download/ISIS.zip

Добавлено: Вс дек 23, 2007 4:03 pm
Vladimir1980
Еще раз огромное спасибо Вам IVAN, за Ваш труд, который трудно переоценить! Спасибо за SPRESI, Scien*ce of synt*sis, за свежие выпуски журналов и мн.др.! А по какому принципу скачан этот кусок? По годам? Если, да, то с какого года по какой?

Добавлено: Вс дек 23, 2007 4:15 pm
Ivan110
по номеру реакции: SPRESI_ID от 1 до 190000. (До заполнения базы в ISIS - к сожалению она поддерживает
максимальный объём 128 Mb, если туда догрузить ещё то выдаст ошибку и больше не будет работать)

Добавлено: Пн дек 24, 2007 6:30 am
pH<7
Я что-то не очень в теме... А что там можно найти?

Добавлено: Пн дек 24, 2007 9:52 am
Ivan110
Можно посмотреть идёт та или иная реакция в общей схеме или с конкретными
заместителями. Eсли идёт, то какие выходы и условия реакции, где описана
в литературе. Полная версия на сайте SPRESI содержит примерно 4 млн.
реакций и охватывает период 1974-2005 годы. Тут кусок первых 190000 реакций -
столько сколько можно ввести в одну базу ISIS.

Добавлено: Чт дек 27, 2007 9:29 am
Ivan110
В exchange следующие 190000 реакций из базы (SPRESI_ID: 190001-400000).

Добавлено: Чт дек 27, 2007 11:21 am
Vladimir1980
Спасибо! Вы как очень щедрый Дед Морозподарок за подарком раздаете! :D А эти базы как-нибудь объединять в одну можно?

Добавлено: Чт дек 27, 2007 6:46 pm
N oxide
как работать с базой??
чой-то не очень понятно... :cry:
пытаюсь открыть SPRESI_01 под ISIS base - не хочет, говорит "file not found".
Мож чего не так делаю?? подскажите :oops:

p.s. скачал ISIS/Base 2.1.4

Добавлено: Чт дек 27, 2007 7:15 pm
Abwer
N oxide писал(а):как работать с базой??
чой-то не очень понятно... :cry:
пытаюсь открыть SPRESI_01 под ISIS base - не хочет, говорит "file not found".
Мож чего не так делаю?? подскажите :oops:

p.s. скачал ISIS/Base 2.1.4
Надо поместить файл на диск С... и чтобы в пути не было русских букафф, а то айсис может не понимать указаного пути

Добавлено: Чт дек 27, 2007 9:37 pm
Ivan110
Объеденить в одну можно используя программу ISIS/Host - там нет ограничений по объёму баз.

Добавлено: Пт дек 28, 2007 12:48 am
Vitka
А на какой-нибудь торрент-трекер выложить можно? Удобнее будет

Добавлено: Пт дек 28, 2007 8:13 am
Wolf1
Vitka писал(а):А на какой-нибудь торрент-трекер выложить можно? Удобнее будет
Кому как. Когда трафик строго регламентирован проще малыми фрагментами.

Спасибо, Иван!!

Добавлено: Пт дек 28, 2007 8:24 am
Wolf1
Кстати Иван, а где нибудь есть в свободно доступе ISIS/Host ?

Добавлено: Пт дек 28, 2007 9:12 am
Ivan110
Даже если найти ISIS/Host его поставить достаточно сложно. Сперва надо
поставить Oracle Enterprise Server for Windows. Та версия которая есть на
сайте Oracle очень требовательна к програмной и аппаратной части. Для неё
нужна 64-битная операционная среда Windows 2003 Server Enterprise (или
Datacenter Edition) и кроме того из аппаратных требований: не менее 2-х
64-бит. процессоров (двухядерные не подходят, нужна именно плата с 2 процес-
сорами). Я тут поспрашивал, в Москве никого не нашёл у кого Oracle стоит на
виндах. Eсли есть то установлено на Sun Solaris, а это уже нужен комп вообще
с другой архитектурой.

Добавлено: Пт дек 28, 2007 9:45 am
Wolf1
Да, действительно менять из-за программы комп. не серьезно.

Но вот такой вопрос, а ChemFinder из ChemOffice 2005 может с такими базами работать?

Добавлено: Пт дек 28, 2007 10:02 am
Ivan110
Загружал в ChemFinder 10.0 из ChemOffice Ultra 2006 ver 10.0, работает -
но тормозит со страшной силой...