Форум химиков

Для интереса попробовал позагружать базу данных реакций из SPRESI.
В общем надо быть большим энтузиастом, чтобы всё закачать. В exchange
кусок примерно 190000 реакций. Для уменьшения трафика пришлось
оставить только поля: реакция, номер, выход, условия, ссылка, авторы
и название статьи. ISIS base не ниже Ver. 2.1. Так как выгружается в
виде RDF трафик составил 2.3 Гб. Поиск в ISIS-ной базе возможен по
подструктуре и по всем остальным полям.

абалдеть...

Спасибо за самоотверженный труд!!!

Простите мою безграмотность, а какой прогой эту базу принято открывать?

ISIS Base с версией не ниже 2.1, пробовал версию 2.0.6 - взбрыкивает.

на всякий случай ссылка на ISIS/Base 2.1.4 (17487 кб):

Еще раз огромное спасибо Вам IVAN, за Ваш труд, который трудно переоценить! Спасибо за SPRESI, Scien*ce of synt*sis, за свежие выпуски журналов и мн.др.! А по какому принципу скачан этот кусок? По годам? Если, да, то с какого года по какой?

по номеру реакции: SPRESI_ID от 1 до 190000. (До заполнения базы в ISIS - к сожалению она поддерживает
максимальный объём 128 Mb, если туда догрузить ещё то выдаст ошибку и больше не будет работать)

Я что-то не очень в теме... А что там можно найти?

Можно посмотреть идёт та или иная реакция в общей схеме или с конкретными
заместителями. Eсли идёт, то какие выходы и условия реакции, где описана
в литературе. Полная версия на сайте SPRESI содержит примерно 4 млн.
реакций и охватывает период 1974-2005 годы. Тут кусок первых 190000 реакций -
столько сколько можно ввести в одну базу ISIS.

В exchange следующие 190000 реакций из базы (SPRESI_ID: 190001-400000).

Спасибо! Вы как очень щедрый Дед Морозподарок за подарком раздаете! А эти базы как-нибудь объединять в одну можно?

как работать с базой??
чой-то не очень понятно...
пытаюсь открыть SPRESI_01 под ISIS base - не хочет, говорит "file not found".
Мож чего не так делаю?? подскажите

p.s. скачал ISIS/Base 2.1.4

N oxide писал(а):как работать с базой??
чой-то не очень понятно...
пытаюсь открыть SPRESI_01 под ISIS base - не хочет, говорит "file not found".
Мож чего не так делаю?? подскажите

p.s. скачал ISIS/Base 2.1.4

Надо поместить файл на диск С... и чтобы в пути не было русских букафф, а то айсис может не понимать указаного пути

Объеденить в одну можно используя программу ISIS/Host - там нет ограничений по объёму баз.

А на какой-нибудь торрент-трекер выложить можно? Удобнее будет

Vitka писал(а):А на какой-нибудь торрент-трекер выложить можно? Удобнее будет

Кому как. Когда трафик строго регламентирован проще малыми фрагментами.

Спасибо, Иван!!

Кстати Иван, а где нибудь есть в свободно доступе ISIS/Host ?

Даже если найти ISIS/Host его поставить достаточно сложно. Сперва надо
поставить Oracle Enterprise Server for Windows. Та версия которая есть на
сайте Oracle очень требовательна к програмной и аппаратной части. Для неё
нужна 64-битная операционная среда Windows 2003 Server Enterprise (или
Datacenter Edition) и кроме того из аппаратных требований: не менее 2-х
64-бит. процессоров (двухядерные не подходят, нужна именно плата с 2 процес-
сорами). Я тут поспрашивал, в Москве никого не нашёл у кого Oracle стоит на
виндах. Eсли есть то установлено на Sun Solaris, а это уже нужен комп вообще
с другой архитектурой.

Да, действительно менять из-за программы комп. не серьезно.

Но вот такой вопрос, а ChemFinder из ChemOffice 2005 может с такими базами работать?

Загружал в ChemFinder 10.0 из ChemOffice Ultra 2006 ver 10.0, работает -
но тормозит со страшной силой...