ЭПР-спектры, чем открыть

Вопросы, связанные с химией вообще. Вы можете задать здесь свой вопрос, и мы постараемся на него ответить.
General chemical questions go here
Ответить
Аватара пользователя
Vittorio
Сообщения: 14670
Зарегистрирован: Вс мар 25, 2007 2:33 am

ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Vittorio » Сб янв 14, 2017 7:02 pm

Добрый день, коллеги!

Подсоветуйте, пожалуйста, фриварный (но можно и платный), интуитивно понятный софт для обработки ЭПР спектров, совместимый с Вин7 или 8.
Задача - есть приборные файлы ЭПР спектров, которые надо открыть и сделать из них картинку. Спектроскопист любезно поделился дистрибутивом своей проги, но она не хочет становиться ни на один из компов из числа опробованных. :dontknow: Я так понимаю, проблема в совместимости с виндой. Спектрометр - JES-FA300 ESR, Джеоловский. Архив с приборным файлом прилагаю.
Спасибо всем откликнувшимся!
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Гесс » Сб янв 14, 2017 9:29 pm

а что у спектроскописта за прога?

Файл очевидно бинарник и без проги я сомневаюсь что из него можно хоть чтото выяснить.

Аватара пользователя
Vittorio
Сообщения: 14670
Зарегистрирован: Вс мар 25, 2007 2:33 am

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Vittorio » Вс янв 15, 2017 9:54 pm

есть файл cwESr.exe. Так как прога не становится, то сказать ничего не могу.

Аватара пользователя
chaus
Сообщения: 3135
Зарегистрирован: Вт дек 24, 2013 2:37 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение chaus » Ср янв 18, 2017 12:01 pm

Видимо, это спектр, записанный во внутреннем формате самого прибора. Прога, его открывающая, поставляется вместе с прибором и ставится на комп, аппаратно соединённый с прибором. Скорее всего, прога лицензируется тоже только вместе с прибором.

Попросите прибориста сохранить спектр в ascii или ином текстовом формате как txt, dat или что-то в этом роде, тогда можно будет прочитать на нормальном софте и построить картинки Qtiplot-ом, Excel-ем или чем-то другим, тоже нормальным.
When you open your heart to patriotism, there is no room for prejudice.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Гесс » Ср янв 18, 2017 1:08 pm

Пока найден
http://www-users.york.ac.uk/~vc4/downloads.html который должен уметь читать внутренний джеоловский формат esr, но который не удается найти и скачать плюсовую версию. Возможно напишу Erwin Timmerman если найду адекватный имейл.
и
http://www.effemm2.de/info/info_free_sw.html с кучей разных прог.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Shorku » Вт янв 24, 2017 11:20 am

С джеолом дела не имел, но по идее EasySpin должен (судя по документации) читать и их формат.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Гесс » Вт янв 24, 2017 4:38 pm

Shorku писал(а):
Вт янв 24, 2017 11:20 am
С джеолом дела не имел, но по идее EasySpin должен (судя по документации) читать и их формат.
Чувствуется что писали люди с линуксоидным подходом...
На данный момент я смог скомпилить easyspin в матлабе.
EasySpin is now compiled for this platform.

==================================================================
Release: 5.1.9 (2017-01-12)
Expiry date: 31-Dec-2017
Folder: C:\Users\User\Downloads\easyspin-5.1.9\easyspin
MATLAB version: 7.13.0.564 (R2011b)
Platform: Microsoft Windows [Version 6.1.7601]
mex-files: mexw32, ok
System date: 24-Jan-2017 14:25:00
Temp dir: C:\Users\User\AppData\Local\Temp\
==================================================================


И че дальше?

Обалдеть, у нас теперь и кат не работает? Ладно, зачеркнем...

Если создать дополнительную функцию на основе http://easyspin.org/forum/viewtopic.php ... =JEOL#p282
и запустить ее то можно открыть файлы с джеоловским esr разрешением. Ну добавить разрешение файлу непроблема, но результат как то совсем не впечатляет.
Screenshot_10.jpg
Так что возможно что это вообще и не esr.


Vittorio - На данный момент мне предложили тупой но надежный спсособ - сделать образ с машины где ваша прога стоит и поставить его на виртуалку куда-нибудь.

Еще одна идея - закинуть файл на форум easyspin (с указанием его джеольнутости) и попросить чтото придумать. Я опять потратил несколько часов на то чтобы скачать и поставить все необходимые для изиспина костыли и сам изиспин поэтому у меня опять отпало желание морочить с этим голову дальше.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Shorku » Вт янв 24, 2017 5:44 pm

Гесс писал(а):
Вт янв 24, 2017 4:38 pm
Чувствуется что писали люди с линуксоидным подходом...
На данный момент я смог скомпилить easyspin в матлабе.
EasySpin is now compiled for this platform.
1.jpg
что я делаю не так?

ЗЫ я понял в чем у Вас был затык, там все парсится исходя из расширения файла со спектром, у джеола расширения не предполагается в принципе. Поддержка большинства бинарных форматов у них сейчас из коробки =)
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Гесс » Вт янв 24, 2017 7:03 pm

Ишь ты!
Оказывается из окна вызываемого eprload можно открыть файл по имени даже если его в этом окне не видно (в имеющейся у меня версии вроде последней можно выбрать только файлы с конкретными расширениями, а традиционной кнопки "все файлы", "*.*" нет. Но работает.
Screenshot_13.jpg
Screenshot_12.jpg
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Shorku » Вт янв 24, 2017 7:15 pm

Можно гораздо проще (и привычнее) набрать
[B,spc] = eprload('myspectrum');
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Vittorio
Сообщения: 14670
Зарегистрирован: Вс мар 25, 2007 2:33 am

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Vittorio » Вт янв 24, 2017 10:29 pm

Коллеги, спасибо преогромнейшее!!!!!!!!!!!!!!!

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: ЭПР-спектры, чем открыть

Сообщение Гесс » Вт янв 24, 2017 10:46 pm

Shorku писал(а):
Вт янв 24, 2017 7:15 pm
Можно гораздо проще (и привычнее) набрать
[B,spc] = eprload('myspectrum');
Ну я эту строку в документации изиспина увидел, но черт же его знает в каком виде там нужно путь к файлу указывать. Я вообще в матлабе раньше не работал, так что глазки выпучил и забарабанил по кнопкам.

Ответить

Вернуться в «общехимические вопросы / general chemical issues»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 8 гостей