Название структур

Вопросы, связанные с химией вообще. Вы можете задать здесь свой вопрос, и мы постараемся на него ответить.
General chemical questions go here
Ответить
Ptizza

Название структур

Сообщение Ptizza » Пт окт 09, 2009 12:34 am

Почему-то ACD labs, ISIS, Symyx выдают разные названия предолженным структурам. Судя по ACD и Symyx названия по ИЮПАК, хотя довольно разные. Что лучше делать в таком случае?
У меня шеф очень щепетильный к названиям... Не знаю вариант какой программы лучше выбрать. Может кто-нибудь сталкивался с подобным.
Заранее огромное спасибо!!
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Marxist

Re: Название структур

Сообщение Marxist » Пт окт 09, 2009 12:59 pm

Номенклатура ИЮПАК однозначна только в одну сторону -- рисования соединения по названию. В другую сторону она неоднозначна. Я бы советовал взять любую рисовалку с функцией name to structure и воспользоваться ей. Если рисует правильно -- всё в порядке.

Ptizza

Re: Название структур

Сообщение Ptizza » Пт окт 09, 2009 7:41 pm

Спасибо, так и сделаю

Аватара пользователя
ИСН
Робин Гуд
Сообщения: 8531
Зарегистрирован: Пт окт 10, 2003 5:32 pm
Контактная информация:

Re: Название структур

Сообщение ИСН » Пт окт 09, 2009 7:48 pm

Marxist писал(а):Я бы советовал взять любую рисовалку с функцией name to structure
Например, можно человека (только не видевшего этой структуры в лицо). :D Если сойдётся, то ОК.

Marxist

Re: Название структур

Сообщение Marxist » Пт окт 09, 2009 8:54 pm

И да, у меня есть смутные сомнения в июпаковости названия "стирил".

Set O. Lopata
Сообщения: 3
Зарегистрирован: Ср июл 02, 2008 1:36 pm

Re: Название структур

Сообщение Set O. Lopata » Ср окт 14, 2009 2:40 pm

Сомнения напрасны.
В отличии от CA, правила ИЮПАК достаточно либеральны в этом отношении.
Ими рекомендуется писать -стирил вместо -2-фенилэтенил.

Аватара пользователя
лава
Сообщения: 244
Зарегистрирован: Пт фев 27, 2009 5:27 pm

Re: Название структур

Сообщение лава » Ср окт 14, 2009 3:19 pm

Marxist писал(а): Я бы советовал взять любую рисовалку с функцией name to structure и воспользоваться ей.
А какие? :shuffle:

Marxist

Re: Название структур

Сообщение Marxist » Ср окт 14, 2009 4:47 pm

Точно есть такая функция у ChemDraw. Только она не всегда может построить соединение по названию, которая сама предложила.

Аватара пользователя
vitaki
Сообщения: 2251
Зарегистрирован: Вт авг 19, 2008 6:19 pm

Re: Название структур

Сообщение vitaki » Чт окт 15, 2009 1:33 am

В ACD шестой версии точно есть эта функция.
…Порядочный химик в двадцать раз полезнее всякого поэта. / И. С. Тургенев.

shadowman
Сообщения: 2
Зарегистрирован: Чт окт 15, 2009 6:24 pm
Контактная информация:

Re: Название структур

Сообщение shadowman » Чт окт 15, 2009 6:46 pm

Ptizza писал(а):Почему-то ACD labs, ISIS, Symyx выдают разные названия предолженным структурам. Судя по ACD и Symyx названия по ИЮПАК, хотя довольно разные. Что лучше делать в таком случае?
У меня шеф очень щепетильный к названиям... Не знаю вариант какой программы лучше выбрать. Может кто-нибудь сталкивался с подобным.
Заранее огромное спасибо!!
Вообще все проги назвали правильно.... формально.
Формальнее всего подошла Symyx, и у неё получилось самое громоздкое.
ACD labs и ISIS выдали более удобоваримые варианты.
Пользоваться можно любыми из вариантов названия, но название от ISIS составлено наиболее верно, следуя указаниям и рекомендациям IUPAC.
Название от ACD Labs не совсем отвечает рекомендациям IUPAC, так как за основу взят меньший гетероцикл и к нему приконденсировал бОльший.
У ISIS за основу взят остов соединения (пурин), максимально покрывающий главную часть молекулы, к нему приконденсирован меньший гетероцикл (имидазол), и на полученную основную часть молекулы навешены различные заместители.

Аватара пользователя
vitaki
Сообщения: 2251
Зарегистрирован: Вт авг 19, 2008 6:19 pm

Re: Название структур

Сообщение vitaki » Пт окт 16, 2009 1:34 am

Название от ACD Labs не совсем отвечает рекомендациям IUPAC, так как за основу взят меньший гетероцикл и к нему приконденсировал бОльший.
Как раз наоборот: в названии от АCD за основу взята наибольшая матрица - пурин.
Считаю это название предпочтительным.
ACD Labs 6.0 версии рисует именно эту структуру именно по этому названию.
…Порядочный химик в двадцать раз полезнее всякого поэта. / И. С. Тургенев.

shadowman
Сообщения: 2
Зарегистрирован: Чт окт 15, 2009 6:24 pm
Контактная информация:

Re: Название структур

Сообщение shadowman » Пт окт 16, 2009 10:42 am

vitaki писал(а):Как раз наоборот: в названии от АCD за основу взята наибольшая матрица - пурин.
Считаю это название предпочтительным.
ACD Labs 6.0 версии рисует именно эту структуру именно по этому названию.
Ээээ... да! Спасибо что поправили!
Разумеетсяя, предпочтительнее версия ACD.
Это у меня в конце дня голова совсем плохо соображает что я так перепутал...

Ответить

Вернуться в «общехимические вопросы / general chemical issues»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 29 гостей