Зарождение жизни в буферных растворах

[dan14444]

На чистой воде и посуде работать надо - и ничего не заведётся. Бактериям много чего для жизни нужно, кроме энергии. Если нет, скажем, фосфора - и бактерий не будет.
Ну а если водопроводная вода и посуда, мытая фейри... Тады не надо удивляться.

Выделено отсюда

[Sokolov]

Про фосфор - на 100% верно. Сам не раз видел, как в фосфатном буфере колонии каких-то микроорганизмов заводятся. А потом рН-метр такие фокусы выкидывает...

[dan14444]

Хе, в чистом PBSе ни одна сволочь не заведётся! Проверено! А те, кто буфера с азидами готовят или в холодильник ставят от жизни - просто грязнули!
Сколько меня убеждали, что без этого никак, что жизнь самозарождается и из стекла выгрызает все требуемые элементы... Холодным термоядом...

[Sokolov]

...А те, кто буфера с азидами готовят или в холодильник ставят от жизни - просто грязнули!

Принимается
А вообще-то, всем чудесам всегда можно найти логическое объяснение. Без самозарождающейся за счет холодного термояда жизни. Просто со всеми этими voodoo-штуками жить как-то веселее. Романтичней, что ли...

[avor]

Хе, в чистом PBSе ни одна сволочь не заведётся! Проверено! А те, кто буфера с азидами готовят или в холодильник ставят от жизни - просто грязнули!

Собственноручно выковыривал плесень из дистиллята(прозрачные такие, в воде практически незаметные сопельки). Тут даже тема была чем помыть тару под дистиллят мной заведена, я мыл сернягой с перекисью нужна была мочалка, выдерживающая действие сей жидкости. После принятых дополнительных мер (после промывки окуривание формалином) тара не зарастает. Но сам факт зароста говорит о том, что этой мерзости вполне хватает амиамка и СО2 из воздуха и серы и фосфора из пыли, стекла и воздуха.
А чистого ПБС не бывает, после того как вы его пооткрывали и полазили туда пипеткам, он уже не чистый, а обсемененный и со временем в нем может и расти начать. Вы можете в этом убедится, сделав посев из ПБС на богатую среду в чашки Петри. А сам ПБС надо отцентрифугировать невидимый осадок мазнуть на предметное стекло и покрасить метиленкой после прокаливания и под микроскоп. А потом уже говорить, что в нем ничего не растет.

[зыркало1]

На чистой воде и посуде работать надо - и ничего не заведётся. Бактериям много чего для жизни нужно, кроме энергии. Если нет, скажем, фосфора - и бактерий не будет.
Ну а если водопроводная вода и посуда, мытая фейри... Тады не надо удивляться.

В том то и дело, что фосфор есть. Теперь последнюю стадию делают в "чистой зоне"...

[зыркало1]

Хе, в чистом PBSе ни одна сволочь не заведётся! Проверено! А те, кто буфера с азидами готовят или в холодильник ставят от жизни - просто грязнули!
Сколько меня убеждали, что без этого никак, что жизнь самозарождается и из стекла выгрызает все требуемые элементы... Холодным термоядом...

А то, что бациллы в воздухе летают, Вы не слыхали?

[dan14444]

Но сам факт зароста говорит о том, что этой мерзости вполне хватает амиамка и СО2 из воздуха и серы и фосфора из пыли, стекла и воздуха.

Серы и фосфора в "стекле и воздухе" нет. А если в буфер пыль летит - значит кто-то грязно работает. Или в данном случае - дистиллятор грязный или кривой.

А чистого ПБС не бывает, после того как вы его пооткрывали и полазили туда пипеткам, он уже не чистый, а обсемененный и со временем в нем может и расти начать.

Э... Лазить в сток буфера пипеткой - крайне порочная практика. Всё равно, что в сток реактива - шпателем, для каждой реакции.

А то, что бациллы в воздухе летают, Вы не слыхали?

"А вы не путайте свою шерсть и государственную" ©. В нестерильном, но чистом растворе - что бы туда ни попало - не размножится, ибо жрать нечего. А если туда столько попало, что жизнь развивается на трупах, то...

В общем, экспериментальный факт - у меня буфера годами при комнатной не заростают. За очень редкими исключениями, при которых хочется самому себе по рукам надавать...

А вообще хороший критерий - наличие или отсутствие в лабе фильтра на приточной вентиляции. Сразу и о многом говорит.

[Sokolov]

У нас прям над лабой - туалет деканата. И стояк, который мимо нас идет, лет пятьдесят не меняли. Вообщем, пахнет, бывает, неприлично. А вы говорите, фильтр на приточную вентиляцию...

[anatoliy]

А вообще хороший критерий - наличие или отсутствие в лабе фильтра на приточной вентиляции. Сразу и о многом говорит.

А вообще есть еще критерий - наличие или отсутствие в лабе приточной вентиляции.
И еще - наличие или отсутствие в лабе вентиляции.

[avor]

--Серы и фосфора в "стекле и воздухе" нет.

безаппеляционно

---А если в буфер пыль летит - значит кто-то грязно работает.

Либо вы кривите душой, либо у вас очень наивные представления о пыли в лаборатории.

---Э... Лазить в сток буфера пипеткой - крайне порочная практика. Всё равно, что в сток реактива - шпателем, для каждой реакции.

Спросите любого микробиолога, он вам объяснит, что более рисковано с точки зрения контаминации, залезть в колбу стерильной пипеткой или лить через край.

Что вы предлагаете вместо пипетки?

---В нестерильном, но чистом растворе - что бы туда ни попало - не размножится, ибо жрать нечего.

В буфере? Так уж нечего? А много ли надо?

--В общем, экспериментальный факт - у меня буфера годами при комнатной не заростают.

Вы это проверяли? Посев хоть раз делали? Внешнее впечатление обманчиво. Микроб на то иесть микроб, что не вооруженным взглядом не виден.
Буфер буферу рознь. Бораты не зарастают, с ЭДТА не зарастают. А ацетаты, фосфаты, аминоорганика на раз. Опять же от рН и ионной силы зависит.

-----А вообще хороший критерий .... Сразу и о многом говорит.

И о чем многом говорит? В помещении знаете обычно еще окна бывают. Очень важно наличие фильтров Петрянова на окнах это о многом говорит

[dan14444]

---А если в буфер пыль летит - значит кто-то грязно работает.
Либо вы кривите душой, либо у вас очень наивные представления о пыли в лаборатории.

Нет, просто стараюсь работать нам, где такие представления адекватны.

---Э... Лазить в сток буфера пипеткой - крайне порочная практика. Всё равно, что в сток реактива - шпателем, для каждой реакции.
Спросите любого микробиолога, он вам объяснит, что более рисковано с точки зрения контаминации, залезть в колбу стерильной пипеткой или лить через край.

Вы опять путаете контаминацию жизнью и едой.

Что вы предлагаете вместо пипетки?

Дело не в пипетке, если её нормально мыть каждый раз (от того же хромпика отмываться надо долго, а мыло - вообще смерть стеклу) или правильно хранить выделенную - всё нормально. Хотя и "через край" обычно нормально, если "край" пыль и пальцЫ не собирает.
Главное - отбирается то, что нужно на день-другой - и избыток выливается. Сток должен открываться редко и аккуратно.

---В нестерильном, но чистом растворе - что бы туда ни попало - не размножится, ибо жрать нечего.
В буфере? Так уж нечего? А много ли надо?

Много. Раз того, что у меня попадает - недостаточно .

--В общем, экспериментальный факт - у меня буфера годами при комнатной не заростают.

Вы это проверяли? Посев хоть раз делали? Внешнее впечатление обманчиво. Микроб на то иесть микроб, что не вооруженным взглядом не виден.
Буфер буферу рознь. Бораты не зарастают, с ЭДТА не зарастают. А ацетаты, фосфаты, аминоорганика на раз. Опять же от рН и ионной силы зависит.

В моём капиллярнике бактерии видны были сразу. Под микроскопом - аналогично. Дополнительных ядер кристаллизации - нет. А если там лежит пара фемтограмм жизни, которой жрать нечего - мне это фиолетово, я не микробиолог, культуры беру готовыми.
(говорю про фосфаты и ТЭА, с ацетатами работал мало)

-----А вообще хороший критерий .... Сразу и о многом говорит.

И о чем многом говорит? В помещении знаете обычно еще окна бывают. Очень важно наличие фильтров Петрянова на окнах это о многом говорит

Открытые окна в лабе - нонсенс. Лаба - не офис.

[avor]

-Нет, просто стараюсь работать нам, где такие представления адекватны.
Срочно увольняйтесь, от вас скрыли часть информации.

-Много. Раз того, что у меня попадает - недостаточно .
Убедил себя, но не меня.

-Вы опять путаете контаминацию жизнью и едой.
Нет, не путаю. Обыкновенная пыль содержит, как минеральные(К,Na,Mg,Ca,C,P,Si,N,Fe) так и органические мертвые компоненты. Про живые отдельная песня. Воздух в помещениях, в которых работают живые люди, всегда содержит азот(аминный), кислород, углерод и серу.

-Главное - отбирается то, что нужно на день-другой - и избыток выливается. Сток должен открываться редко и аккуратно.
Это прописная истина ничего не гарантирует, лишь снижает вероятность зароста.

-Открытые окна в лабе - нонсенс. Лаба - не офис.
Им вовсе не надо быть открытыми. Герметичные окна в лабе носенс, если конечно это не высший класс опасности.

-А если там лежит пара фемтограмм жизни.
Обычный пророст это где-то микрограммы на литр. Я согласен растет медленно, хотя многое зависит от состава буфера, но растет - сука.

[Любитель_Манниха]

По ходу тему буферов надо выделять в отдельную
На работе хроматограферы (HPLC) очень беспокоились по поводу зарождения жизни в буферах, требовали выливать, если банка неделю постоит без дела. (аналитики они вообще беспокойные люди ) Вода - обратный осмос. Потом начальство сменилось, стало не такое дотошное, банки могли стоять и дольше недели Никакой порнографии (типа глюков базовой линии по УФ) выявлено не было. Но это аммиачно-гидрокарбонатный буфер. Про фосфатный слышал, что ОЧЕНЬ быстро зарастает, но сам никогда не видел.

[зыркало1]

Как мне кажется, dan14444 выдаёт желаемое за действительное...

[Любитель_Манниха]

Ну, хм, вобщем-то если в работе не мешает, то какая разница Коллега, а у Вас кстати, какого рода в-ва бактерии скушали?

[dan14444]

Им вовсе не надо быть открытыми. Герметичные окна в лабе носенс, если конечно это не высший класс опасности.

Э... Ну вот сейчас у меня - герметичные. До этого работал 3 этажа под землёй - там вообще вопрос не стоял .
И никаких особых опасностей - непатогенные вирусы, онкокультуры, обычные канцерогенчики как максимум... 2 класс байохазард в общем... На 4й не поехал - там кровь сдавать регулярно надо .

-А если там лежит пара фемтограмм жизни.
- Обычный пророст это где-то микрограммы на литр. Я согласен растет медленно, хотя многое зависит от состава буфера, но растет - сука.

У кого растёт, а у кого и нет

А ещё есть такая вещь, как чистые отсеки, с доп. фильтрами - в аспирантуре у меня такой был на четверть лабы, ну а щаз имеется в мини-варианте, зато термостатированный. А ещё есть полезная привычка пользовать щиток вместо очков. И много ещё чего.

Если же жизнь жрёт аммиак и сероводород из воздуха (ваш вариант), и этого хватает на миллиграммы (при контакте с воздухом раз в неделю) - вы, извиняюсь, не перепутали лабу с сортиром?...

З.Ы. Пару раз у мну съедали коллоидное золото... Цитратное потому как, и выложенное в общее пользование... Любопытные конструкции получались - они ж металл жрут, но почти не аггрегируют...

[avor]

Если же жизнь жрёт аммиак и сероводород из воздуха (ваш вариант), и этого хватает на миллиграммы (при контакте с воздухом раз в неделю) - вы, извиняюсь, не перепутали лабу с сортиром?...

пророст это где-то микрограммы на литр. Я согласен растет медленно, хотя многое зависит от состава буфера, но растет - сука.

-У кого растёт, а у кого и нет/
Речь не о том у кого, что растет. А о том, что расти в принципе может. А про фильтры, герметичность, УФ, спецодежду и переходные боксы не надо рассказывать, это все ОК! Но далеко не везде.

[antabu]

Если можно обойтись более простыми мерами - "зачем платить больше". В монографии Р.Бейтса. "Определение рН.Теория и практика" (viewtopic.php?f=35&t=41704&p=312891&hilit=%D0%B1%D0%B5%D0%B9%D1%82%D1%81#p312891)
вопросу топика уделяется внимание. Например, в битартратный буфер предлагается против плесени добавлять тимол. Связанная с этим погрешность не превысит 0,01 единицы рН. В моей практике была проблема живности в этом буфере (разводил на воде с удельным сопротивлением около МОм*см), а тимола под руками не было. Решил проблему приготовлением данного буфера на растворе AgCl, проверил - погрешность не превышает 0,1, что меня устроило.

[avor]

Если можно обойтись более простыми мерами - "зачем платить больше".

Так с этого все и началось.

производством тест-наборов, так они в большинство растворов добавляют азид натрия в качестве консерванта, чтобы не завелось ничего

Ну, а в ответ Дан начал: смотри первый пост этой ветки
Кстати, тимол можно было заменить фенолом - этот обычно всегда под рукой есть.