Проблема с MALDI

Вопросы, связанные с химией вообще. Вы можете задать здесь свой вопрос, и мы постараемся на него ответить.
General chemical questions go here
Ответить
pirotex
Сообщения: 12
Зарегистрирован: Вт июн 08, 2010 10:38 am

Проблема с MALDI

Сообщение pirotex » Вс июн 05, 2011 7:12 pm

Специалисты по MALDI, прошу вашего совета.
Сделали модифицированный олигонуклеотид.
На нем, через линкер, висит тиоэфир замещенного тританола(1), пытаемся анализировать его методом MALDI, видим модифицированный олигонуклеотид (2), но упорно не получается получить сигнал от тритил-катиона(3). Если взять исходный реагент, которым модифицировали олигонуклеотид, сигнал тритильного катиона виден хорошо(до 0,1 пикомоль). С олига(100 пм.) сигнала нет.
Пробовали с разными матрицми(2,5-дигидроксибензойная, 3-гидроксиацетофенон), олиги лучше всего видны с ацетофеноном, исходные тритилы с 2,5-дигидроксибензойной.
С одного эксперимента удалось получить отличный сигнал, попросили повторить анализ той же точки на мишени - подтвердилось, вновь нанесли "удачный" образец на мишень, и нифига :( .
Есть соображение, что поскольку олиг после ВЭЖХ, в пробирке высокая концентрация ацетата аммония, может ли он мешать сигналу?
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Проблема с MALDI

Сообщение Upstream » Вс июн 05, 2011 9:16 pm

1. Любые соли загрубляют чувствительность MS и могут до неузнаваемости искажать картину. В Вашем конкретном случае для обессоливания нужно просто пару раз лиофилизовать раствор.
2. А с ацетофеноном, случайно, не в negative mode работают? Там катионы не видны.
3. Молекулы с лабильными связями, да и ещё поликислоты советую ловить в ESI-MS /negative mode. Там, возможно, Вы даже молекулярный многозарядник поймаете.
4. Если всё вышеупомянутое учтено, то проблема может быть в том, что стабильности ожидаемых ионов в газовой фазе различаются на много порядков. В таких случаях пик менее устойчивого можно потерять в шумах. Причём проявление его в исходнике говорит лишь о том, что его второй осколок ионизируется ещё хуже.
А не проще ли продемонстрировать присутствие в молекуле тритила старой доброй UV-VIS?

pirotex
Сообщения: 12
Зарегистрирован: Вт июн 08, 2010 10:38 am

Re: Проблема с MALDI

Сообщение pirotex » Пн июн 06, 2011 12:05 pm

1. Благодарю, будем знать:-)
2. Нет, с ацетофеноном в режиме положительных ионов мы детектируем олиги.
3. ESI - это конечно хорошо, но во-первых к нему нет доступа, а во-вторых, задача не доказать наличие тритила, а получить сигнал именно в МАЛДИ.

Ответить

Вернуться в «общехимические вопросы / general chemical issues»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 16 гостей