посчитать объем молекулы дендримера

[suprachemister]

Всем привет! Лазил по сайту Олдрича в поиске дендримеров и наткнулся на странное значение которое они там приводят для одного из них
volume 5054 Å3
http://www.sigmaaldrich.com/catalog/Pro ... KEY&F=SPEC
Интересно каким расчетом они получили такое значение?

[amge]

Возможно, это объем одной молекулы. Как его получили - вопрос. Если пересчитать из плотности, то получится другое значение,
1E24 / (1.01 / 3513.81 * 6.02E23) = 5780 ų, хотя и не так уж сильно отличающееся от 5,054 ų (запятая здесь - разделитель тысяч)

[suprachemister]

amge
взял для расчетов дендример попроще

Код: Выделить всё

http://www.sigmaaldrich.com/catalog/ProductDetail.do?D7=0&N5=SEARCH_CONCAT_PNO|BRAND_KEY&N4=460699|ALDRICH&N25=0&QS=ON&F=SPEC

DAB-Am-4, Polypropylenimine tetramine dendrimer, generation 1
написано что: volume 428 Å3
пересчитал по плотности:
1E24 / (0,96 /316.529 * 6.02E23) = 548 Å3 (завышенное значение)
попробовал полуэмпирический расчет в MarvinSketch(ChemAxon)

Код: Выделить всё

http://www.chemaxon.com/marvin/sketch/index.php

Geometry-->van der Waals volume = 358 Å3 (заниженное значение)
незнаю чему верить? у кого-то есть идеи?
попробую прикинуть еще в HyperChem

[starless]

А у них разве нет справки, в которой указан метод расчёта? Наверняка там что-то примитивное от ACD или подобной конторы, чем больше молекула, тем сильнее провирается и зависит от конформации

[Upstream]

Евгений, некоторые нюансы рассчёта мол.объёмов дендримеров можно найти на стр.257,302,336,614 в
Dendrimers and Other Dendritic Polymers. Fréchet J.M.J. & Tomalia D.A. (Eds) Wiley 2001.

Код: Выделить всё

http://www.wupload.com/file/w867/37602104/Dendrimers and other dendritic polymers 2001 - Frechet & Tomalia.pdf

Думаю, всё это хозяйство у тебя уже есть:
Dendrimer Chemistry: Concepts, Syntheses, Properties, Applications /F. Vögtle, G. Richardt, N. Werner (Eds) Wiley 2009
Dendrimers and Dendrons: Concepts, Syntheses, Applications 2001
Dendritic Molecules 1996
Dendrimers in Medicine and Biotechnology: New Molecular Tools. 2006
Star&Hyperbranched Polymers 1999
Supramolecular Polymers 2005
Dendrimer Catalysis 2006
Dendrimers I-V. in Tops In Curr.Chem. nn 197,212,....228