Это не вопрос, не спам и даже не реальная возможность заработать.
Просто я наткнулся на програмулину, заинтересовавшую меня тем что она делает.
До функционала я пока не добрался, убив полдня на выяснение как ее запускать.
Собственно этим знанием я и хочу здесь поделиться.
Программа называется NCI Plot и поначалу я скачал ее отсюда http://www.chem.duke.edu/~yang/Software ... reNCI.html (размер архива 75 Мб).
В мануале утверждается что после распаковки достаточно сделать
Код: Выделить всё
ifort nciplot.f -o nciplot.x
Интеловского фортрановского компилятора у меня не было, я его ставил (он распространяется Интелом бесплатно), он матерился на библиотеки, отсутствие всякой фигни, при запуске вышеназванной команды создавал nciplot-1.0.о и убивал nciplot-1.0.x который изначально есть в архиве. Как оказалось все это абсолютно ненадо. Достаточно сделать имеющийся nciplot-1.0.x исполнительным. Однако в отчаяньи бродя по интернету я наткнулся на http://www.lct.jussieu.fr/pagesperso/co ... iplot.html с 2 другими версиями. Мануал у всех трех одинаковый, однако если версия 1 похожа на скачанную ранее (размер архива 337 метров, файл nciplot-1.0.x 1.7 Мб против 1.0 Мб) то версия 3 заметно отличается. В ее мануале точно также рассказано про ifort однако в README прописан метод для этой версии:
Код: Выделить всё
make mrproper
make
export NCIPLOT_HOME=/home/xxxx/src/nciplot
В этом виде установка проходит без мата.
На редкость неочевидным, несмотря на мануал, папку "тестов" и папку "упражнений" (http://www.lct.jussieu.fr/pagesperso/co ... cises.html) оказался запуск.
Несмотря на то что в простейшем случае проге просто скармливается 1 xyz файл, делается это с помощью еще одного файла, содержащего 2-3 строки:
1 строка - Количество xyz файлов которые следует прочесть
2-n строки - Имена xyz файлов которые следует прочесть
n+1 - Кейворды.
Вопреки написанному тут: http://quantumchemistryniser.wordpress. ... /nci-plot/ расширение этого уродства не имеет значения, во всяком случае у меня запустилось вообще без расширения.
Интересно что размеры куб-файлов и дат-файлов генерируемых "первой" и "третьей" неодинаковы для одного и того же инпута, скажем для димера бензола (геометрия взята из конца мануала) размеры дат-файлов 18 и 25 Мб соответственно для "первой" и "третьей" версий.
Еще раз повторюсь - я пока очень смутно представляю что программа может визуализировать. Если это кого то заинтересует - прошу по ссылкам выше или в статью NCIPLOT: A Program for Plotting Noncovalent Interaction Regions (DOI: 10.1021/ct100641a).