Здравствуйте!
Возникла необходимость для парочки соединений провести оценку энергии разрыва связи (элемент-водород) и ионизационного потенциала. С помощью каких программ это можно сделать? Будет достаточно оценки ΔE в виде < или > 10 ккал/моль, а ΔИП в виде < или > 36 ккал/моль.
Заранее благодарен за помощь.
Оценка энергии разрыва связи и ИП
-
- Сообщения: 22
- Зарегистрирован: Пт июн 07, 2013 10:14 am
Re: Оценка энергии разрыва связи и ИП
Разрыва - гомолитического?gliclazid2013 писал(а):Здравствуйте!
Возникла необходимость для парочки соединений провести оценку энергии разрыва связи (элемент-водород) и ионизационного потенциала. С помощью каких программ это можно сделать? Будет достаточно оценки ΔE в виде < или > 10 ккал/моль, а ΔИП в виде < или > 36 ккал/моль.
Заранее благодарен за помощь.
Ионизация - вертикальная или адиабатическая?
Да почти в чем угодно. Бесплатное - орка, природа, вероятно гамес (я в нем не работал), платное - гауссиан, адф, молпро.
Качество результата зависит от дороговизны используемых методов (разумеется не всегда "больше значит лучше", но для любого метода можно найти более дорогой который будет учитывать больше вещей и вероятно ближе к "правде"). Чем больших размеров молекулы вы намеряны считать и чем более крутыми методами - те мощнее должны быть ваши ресурсы.
Так как ресурсы у вас чем то ограничены да и размеры молекулы фиксированы - лучше обнародовать эти данные, тут есть умные люди которые смогут оценить что вам подойдет.
-
- Сообщения: 22
- Зарегистрирован: Пт июн 07, 2013 10:14 am
Re: Оценка энергии разрыва связи и ИП
Гесс, спасибо за ответ. Поясню немного свою задачу, может это вообще бред и нужно будет кинуть дурное .
Известно, что антиоксиданты могут дезактивировать радикалы по двум основным механизмам: HAT (как переносчики атома водорода) и SET (как переносчики свободного электрона). В различных моделях оценки антиоксидантной активности, реализуется один из вышеперечисленных механизмов или оба. Два важнейших фактора, которые определяют механизм и эффективность антиоксидантов-энергия разрыва связи (E) и потенциал ионизации (ИП). Вот и возникла мысль, попробывать провести оценку для парочки соединений, для которых у нас есть экспериментальные данные, и посмотреть будет ли то, что мы получим рассчетно, приближаться к тому, какой механизм нами предположен исходя из эксперимента. Например, известно , что относительная реакционная способность в HAT-методах определяется энергией разрыва связи элемент-водород в потенциальном антиоксиданте, доминируя для компонентов с E -10 ккал/моль и ионизационным потенциалом (ИП) < -36 ккал/моль. Вот и возник вопрос: как все это посчитать и с помощью чего ? Например, для гиперозида (формула прикреплена).
Известно, что антиоксиданты могут дезактивировать радикалы по двум основным механизмам: HAT (как переносчики атома водорода) и SET (как переносчики свободного электрона). В различных моделях оценки антиоксидантной активности, реализуется один из вышеперечисленных механизмов или оба. Два важнейших фактора, которые определяют механизм и эффективность антиоксидантов-энергия разрыва связи (E) и потенциал ионизации (ИП). Вот и возникла мысль, попробывать провести оценку для парочки соединений, для которых у нас есть экспериментальные данные, и посмотреть будет ли то, что мы получим рассчетно, приближаться к тому, какой механизм нами предположен исходя из эксперимента. Например, известно , что относительная реакционная способность в HAT-методах определяется энергией разрыва связи элемент-водород в потенциальном антиоксиданте, доминируя для компонентов с E -10 ккал/моль и ионизационным потенциалом (ИП) < -36 ккал/моль. Вот и возник вопрос: как все это посчитать и с помощью чего ? Например, для гиперозида (формула прикреплена).
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Оценка энергии разрыва связи и ИП
Энтальпию разрыва связи такой зверюги лучше рассчитать каким-нибудь феноменологическим методом. Но потребуется энтальпия радикала.
Я не уверен, можно ли ее оценить аддитивным методом. Смотрите схемы макроинкрементирования.
Я не уверен, можно ли ее оценить аддитивным методом. Смотрите схемы макроинкрементирования.
После отстоя требуйте долива
Re: Оценка энергии разрыва связи и ИП
viewtopic.php?f=71&t=88168 там малая система
viewtopic.php?f=71&t=71968 там сложный случай
viewtopic.php?f=71&t=98916 там срач
viewtopic.php?f=71&t=99050 на G4 есть только в гауссиане, а на него нужна лицензия; не берите гиперхем если хотите чего то хорошего уровня.
viewtopic.php?f=71&t=71968 там сложный случай
viewtopic.php?f=71&t=98916 там срач
viewtopic.php?f=71&t=99050 на G4 есть только в гауссиане, а на него нужна лицензия; не берите гиперхем если хотите чего то хорошего уровня.
Re: Оценка энергии разрыва связи и ИП
Очень важный момент -- учет среды. Энергии разрыва связей и отрыва электрона сильно зависят от среды и намного отличаются от таковых в вакууме. По-минимуму -- нужно включить PCM. По-хорошему -- учесть всю водородно-связанную воду либо явно, квантовохимически (включив в расчет соотв. кол-во молекул воды), либо в виде эффективных фрагментов (EFP). Совсем уж по-хорошему -- скомбинировать оба подхода: первую сольватную оболочку сделать дискретной (с "живой" или EFP-шной водой) и все это погрузить в континуум. Работа не для новичка.
Просто в вакууме посчитать можно, но это никак не будет соотноситься с наблюдаемым в реальности в водной среде.
Просто в вакууме посчитать можно, но это никак не будет соотноситься с наблюдаемым в реальности в водной среде.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 40 гостей