фиг ли начинает не с xjoda неясно, откуда и нафига там mpirun тоже.--invoking executable--
/Адрес/cfour_v2.00beta/bin/xinitenv
--------------------------------------------------------------------------
No executable was specified on the mpirun command line.
Aborting.
--------------------------------------------------------------------------
--executable xinitenv finished with status 256 in 0.01 seconds (walltime).
Гесс писал(а):господа, кому не жалко пары минут кластерного времени:
посмотрите плиз, работает ли у вас пример http://slater.chemie.uni-mainz.de/cfour ... zmat.ccsd1
У них достаточно живой форум.alien308 писал(а):Надо массу пользователей этих программ набирать и опыт объединять.
В копилку знаний - если вы пытаетесь СССС поставить параллельно и оно у вас становится без ошибок но при запуске выдает чтото типаalien308 писал(а):Как что разберётесь, если не трудно выкладывайте на форум, обсудим, попробуем. Надо массу пользователей этих программ набирать и опыт объединять.
то обьявите в своем пбс скрипте вышеупомянутый CFOUR_NUM_CORES--invoking executable--
/home/ляляля/cfour_v2.00beta/bin/xinitenv
--------------------------------------------------------------------------
No executable was specified on the mpirun command line.
Aborting.
--------------------------------------------------------------------------
--executable xinitenv finished with status 256 in 0.01 seconds (walltime).
например какYu/2 писал(а):Параллельный cfour собирается с MPI несколько нетрадиционным образом. Там прямо на этапе конфигурирования перед сборкой нужно указывать строку запуска программ cfour через mpirun. Эта строка намертво потом вкомпилируется и можно только рулить переменной окружения CFOUR_NUM_CORES. Соответственно запуск идет не как обычно $ mpirun -mp xxx program.ex, а просто $ xcfour >& log.
файл вывода приложилГесс писал(а):господа, кому не жалко пары минут кластерного времени:
посмотрите плиз, работает ли у вас пример http://slater.chemie.uni-mainz.de/cfour ... zmat.ccsd1
У меня затребовал MOL файл а после его получения (для получения был сделан расчет без Рамана, просто частоты, успешно), заявил что @RDDIR-F, I/O Error (IOSTAT = 37) on Unit 50. что насколько я понимаю соответствует "Dynamic memory allocation failure - out of memory."
Доведение аллокэйтнутой оперативы до 60 гигов никак не влияет на результат. (ну собственно и не планировалось, ему тут 1 гига должно быть много).
Код: Выделить всё
Ex Ey Ez
H #1 x -0.918973 0.000000 0.000000
H #1 y 0.000000 -0.918973 0.000000
H #1 z 0.000000 0.000000 -0.464133
B #2 x -5.081027 0.000000 0.000000
B #2 y 0.000000 -5.081027 0.000000
B #2 z 0.000000 0.000000 -5.535867
Evaluation of 1e integral derivatives required 0.00 seconds.
@RDDIR-F, I/O Error (IOSTAT = 37) on Unit 50.
@CHECKOUT-I, Total execution time : 0.0000 seconds.
ERROR ERROR ERROR ERROR ERROR ERROR
Job has terminated with error flag
ERROR ERROR ERROR ERROR ERROR ERROR
--executable xvdint finished with status 256
requested length of vector CMP2ZMAT is longer than actual
Actual -- 100 Requested -- 120
Ответа я незнаю, я только пару часов как поставил MRCC.kbob писал(а):Не могу посчитать частоты MRCC для самой тривиальной геометрии
MRCC это метод реализованный в CFOUR. Он же реализован еще и в NWChem и в Psi4. В отличие от последних в CFOUR реализован также его аналитический градиент (который не совпал с численным градииентом из NWChem).Гесс писал(а):Ответа я незнаю, я только пару часов как поставил MRCC.kbob писал(а):Не могу посчитать частоты MRCC для самой тривиальной геометрии
У мну вопрос:
можно ли в MRCC делать скажем оптимизацию и пр. без связки с CFOURом или альтернативным интерфейсом.
Ежели связка нужна то буду пользоваться CFOUR , но вообще как то странно.
О разних реализациях. Эта ссылка на реализациюГесс писал(а):Мы о разном MRCC? http://www.mrcc.hu/
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 23 гостя