Hints on NMR modelling

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
YuraM
Сообщения: 462
Зарегистрирован: Пн ноя 26, 2007 11:07 pm

Hints on NMR modelling

Сообщение YuraM » Пн окт 13, 2014 9:57 am

Dear all,

I have never calculated the NMR shifts before, and would be very grateful for any hint or advise. All I need is to reproduce the proton NMR spectra (chemical shifts) for some organometallic compounds.
Do I understand correctly that I should do the following:
1) optimize and calculate the NMR shielding constant for Si(CH3)4 with one protocol
2) optimize and calculate the NMR shielding constant for my complex with the same protocol
3) Subtract from proton NMR shielding constant for the standard the proton NMR shielding constant for my complex. It will give me a chemical shift.

Then, regarding the method. I consider the two codes:
1) Priroda - GIAO.
2) ORCA - IGLO.

I think in Priroda I cannot calculate the NMR with relativistic Hamiltonian => I have to use 3z basis or basis.in with ECP on the metal. Right?
In ORCA I can do it without ECP in relativistic DKH Hamiltonian.

Any recommendations?
Кто смел тот и съел

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2046
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Hints on NMR modelling

Сообщение amge » Пн окт 13, 2014 12:29 pm

Отсчитывать сдвиг от расчетного ТМС - вносить довольно большую систематическую ошибку. Обычно за 0 дельта принимают эмпирическую сигму, определенную на представительном тестовом наборе (для каждого метода/базиса значения разные). Например, для Природы PBE/L22 я использую 'C'=>172.94, 'H'=>31.148.

В Природе хим. сдвиги тяжелых атомов и ближайшего окружения воспроизводятся плохо. В Орке не знаю, но имейте в виду, что наличие в программе DKH Hamiltonian не означает автоматически, что и хим. сдвиги будут считаться с учетом релятивизма.

endlesslake
Сообщения: 209
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Hints on NMR modelling

Сообщение endlesslake » Пн окт 13, 2014 3:47 pm

Вроде в орке IGLO был реализован с ошибкой и из-за этого выключен в текущей версии.

С учетом скалярных релятивистских эффектов NWChem умеет химсдвиги считать (ZORA, GIAO).

YuraM
Сообщения: 462
Зарегистрирован: Пн ноя 26, 2007 11:07 pm

Re: Hints on NMR modelling

Сообщение YuraM » Пн окт 13, 2014 9:28 pm

Thank you for your replies. From what I understood the NMR shifts with scalar relativistic effects AND with spin-orbit contributions (ZORA) are only available in ADF. Is it correct?
What's gonna happen if you ignore spin-orbit contributions for calculation of NMR shifts for TM hydrides?

NWChem does not want to compute NMR shifts with SODFT... if there are no other alternatives - I;ll have to use adf. Just do not like the commercial software.
Кто смел тот и съел

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2046
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Hints on NMR modelling

Сообщение amge » Вт окт 14, 2014 5:02 am

Еще Dirac умеет релятивистский ЯМР. Это бесплатный софт.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 31 гость