Что означает данная ошибка в Gaussian?

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Ксения312
Сообщения: 2
Зарегистрирован: Сб ноя 01, 2014 1:48 pm

Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Ксения312 » Сб ноя 01, 2014 2:10 pm

Здравствуйте! Проводим расчет в программе, расчет быстро "убивается". В логовском файле данная ошибка:


WARNING! Serious error in surface integrals.
Nuclear flux = 133.36 Qnuc = 132.00 Error in int = 0.00
It is probable that some of the solute is outside the cavity and/or
parts of the cavity surface cannot be reached from the origin.
Try more integration points or a different set of integration origins.


Подскажите, пожалуйста, что означает ошибка и что можно сделать для ее устранения?
Заранее спасибо.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13053
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Гесс » Сб ноя 01, 2014 2:18 pm

дайте инпут и аутпут

Вот некоторые пути, но отвечающий тоже указывает на необходимость аутпута. http://www.ccl.net/chemistry/resources/ ... 3.002-dir/
Вот еще одна рекомендация http://joaquinbarroso.com/2011/10/24/po ... del-pcm-2/ (в обсуждении внизу)

Ксения312
Сообщения: 2
Зарегистрирован: Сб ноя 01, 2014 1:48 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Ксения312 » Сб ноя 01, 2014 2:34 pm

Спасибо большое, будем изучать.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение VTur » Вс ноя 02, 2014 9:20 pm

Попробуйте увеличить размер пузырька
После отстоя требуйте долива

Reginmaister
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Пн дек 15, 2014 2:09 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Reginmaister » Чт дек 18, 2014 2:01 pm

Здравствуйте, уважаемые форумчане! Не раз сталкивался с ошибкой, когда тяжелый расчет умирает, причем последняя строчка
в output-файле "Initial convergence to 1.0D-05 achieved. Increase integral accuracy". Сейчас пробую посчитать геометрию и частоты
молекулы с учетом дисперсионных поправок IOP(3/124=30), но из-за этой ошибки ничего не выходит. Пробовал играть настройками SCF
(ставил MaxCycle от 700 до 1200, conver=8), но это не помогло решить проблему. Прошу совета у всех знающих!

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13053
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Гесс » Чт дек 18, 2014 2:05 pm

Аутпут. Или хотя бы больше строчек с конца.

Reginmaister
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Пн дек 15, 2014 2:09 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Reginmaister » Чт дек 18, 2014 2:13 pm

Вот финальная часть выходного

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13053
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Гесс » Чт дек 18, 2014 2:23 pm

Это далеко от начала оптимизации?
Если это первый шаг - то посчитайте в намного более дешевом метод/базисе и потом считайте guess.
Если нет - SCF c последней геометрии сходится? Если да - считайте его guess.
Без дисперсионной поправки работает? С слегка дистербнутой стартовой структуры работает? С альтернативными метод/базисом работает?

Reginmaister
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Пн дек 15, 2014 2:09 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Reginmaister » Чт дек 18, 2014 2:42 pm

Спасибо за уточняющие вопросы!
1) Это первый шаг оптимизации;
2) Координаты в инпуте из того же расчета, но без дисперсионных поправок;
3) Т.о., без дисперсии все работает, в т.ч. и в других сочетаниях метод/базис

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13053
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Гесс » Чт дек 18, 2014 3:07 pm

Какая версия (буква) гауссиана. Есть ли у вас доступ к другой?
В D версии были большие изменения в дисперсионных коррекциях.
1) Cделайте хотя бы SCF (думаю уже не получится).
2) Сделайте тот же расчет но из другой геометрии, скажем из стартовой для недисперсионного расчета, или из предпоследнего шага того расчета.
2) Попробуйте IOp(3/124)=20 и 40
3) Сделайте в Орке где оно заимплеменчено.
4) Примените DFT-D3 на результат недисперсионного расчета.

Reginmaister
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Пн дек 15, 2014 2:09 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Reginmaister » Чт дек 18, 2014 3:14 pm

Это мне пытались посчитать в G09-A.01. Мой G03 вряд ли сможет посчитать с дисп. поправками

Reginmaister
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Пн дек 15, 2014 2:09 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Reginmaister » Чт дек 18, 2014 3:17 pm

Спасибо! Оба вторых совета сейчас попробую:) (4) - это как раз то, что я и делал. Орке никогда не пользовался,
но если может помочь - буду разбираться!

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13053
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Гесс » Чт дек 18, 2014 3:35 pm

Reginmaister писал(а):Спасибо! Оба вторых совета сейчас попробую:) (4) - это как раз то, что я и делал. Орке никогда не пользовался,
но если может помочь - буду разбираться!
Орка бесплатная и параллельная, много интересных фич, хотя лично я ее нелюблю. Впрочем по ней есть самостоятельная тема.
Относительно гауссиана - а молекулу воды/метана/пофиг_чего ваша версия гауссиана с этим IOPом считает? Может все настолько просто?

Reginmaister
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Пн дек 15, 2014 2:09 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Reginmaister » Ср фев 18, 2015 4:26 pm

Оказалось, что с дисперсией DFT-D3 можно посчитать только в g09-D, или в GAMESS.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13053
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Что означает данная ошибка в Gaussian?

Сообщение Гесс » Ср фев 18, 2015 4:28 pm

Reginmaister писал(а):Оказалось, что с дисперсией DFT-D3 можно посчитать только в g09-D, или в GAMESS.
DFT-D3 это самостоятельный код. Ему неважна версия гауссиана, ему вообще ничего ненадо кроме геометрии и указания базиса. Но разумеется только синглпоинт.
Еще раз посмотрел манкал орки - есть там оптимизация с дисперсионными коррекциями.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 8 гостей