convert .cif to .inp

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
sinigin
Сообщения: 126
Зарегистрирован: Ср июл 31, 2013 9:15 am

convert .cif to .inp

Сообщение sinigin » Вс фев 01, 2015 5:23 pm

Можно ли из .cif файла аккуратно "выдернуть" координаты атомов и состряпать .inp для firefly или Gaussian? Такие конверторы, как Babel судя по всему не подходят (в .out большинство координат зануляется).

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: convert .cif to .inp

Сообщение amge » Пн фев 02, 2015 5:48 am

Например, открыть cif в mercury, при необходимости достроить ячейку и сохранить в xyz. Из xyz сделать инпут уже не проблема.

endlesslake
Сообщения: 209
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: convert .cif to .inp

Сообщение endlesslake » Пн фев 02, 2015 3:06 pm

странно, у меня openbabel отлично преобразовывал cifы. Кстати, припоминаю, были глюки с ним, когда из-за неправильной локали(кажется), он запятую вместо точки в числах ожидал.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 12 гостей