Прошу прощения, что сразу не написал.
Кое-что уже излагал раньше, но далеко не по всем вопросам нашел понимание.
Vit Nhoc писал(а):1) Какие программы для расчётов вы используете, и что можно добавить в Chemcraft в области визуализации данных из выходных файлов этих программ?
Priroda, Firefly, Quantum Espresso (PWSCF, NEB).
Добавить следует, собственно, визуализацию файлов Quantum Espresso (с ними, в принципе, работает XCrySDen, сорцы его доступны, но он много чего не умеет).
Хотелось бы иметь возможность сохранения всех видов картинок (молекулярные структуры, графики) в векторном виде в eps и pdf, чтобы можно было без лишних конвертаций вставлять в LaTeX.
Vit Nhoc писал(а):
3) Используете ли вы в работе Z-матрицы? Для каких целей?
В последнюю версию Chemcraft добавлена автоматическая генерация Z-матриц, только я, честно говоря, сам пока не очень представляю для каких целей она может пригодиться.
В настоящее время - нет.
Vit Nhoc писал(а):
4) Нужен ли вам интерфейс (GUI) для создания входных файлов? Если да, для каких программ для расчётов (Gaussian/Gamess/…)?
У меня вообще создалось ощущение, что опытные квантовые химики пользуются не такими GUI, а базой входных файлов для разных расчётов, которые они правят для своих задач. В Chemcraft есть такая небольшая база (/Chemcraft/Jobsbase), мне бы очень хотелось её дополнить новыми файлами.
Лишним, конечно, не будет, хотя я лично привык копипастить координаты, а все остальное править ручками.
Vit Nhoc писал(а):
5) Сейчас Chemcraft может рисовать двумерный график ППЭ, построенный по данным из выходного файла со сканирование ППЭ. Бывает ли нужен трёхмерный график (т.е. если сканирование идёт по двум координатам)?
Красивые картинки, конечно, получить можно, но, наверное, это не самая важная задача.
Vit Nhoc писал(а):
6) Нужна ли визуализация “нерелаксированного” сканирования ППЭ (обычно я имею дело с relaxed PES scan – когда один параметр зафиксирован и пошагово меняется, на каждом шаге все остальные параметры оптимизируется). У меня создалось ощущение, что non-relaxed PES scan вообще никогда не нужен, поэтому его визуализации пока в Chemcraft нет.
Мне не приходилось таким пользоваться. Но раз такие расчеты существуют, значит, для чего-то они нужны.
Vit Nhoc писал(а):
В Chemcraft есть утилита для быстрого создания входных файлов Gamess (точнее, участков этих файлов) с нестандартными базисными наборами, взятыми с сайта PNNL. Нужна ли эта возможность для Gaussian и других программ?
В Природе свои базисы, в PWSCF - базисы плоских волн, а вот для Gamess/FireFly было бы неплохо иметь возможность брать базисы напрямую с
https://bse.pnl.gov/bse/portal (ну и заодно кешировать уже взятые, чтобы каждый раз не качать)
Vit Nhoc писал(а):
9) Используете ли вы возможность перевести молекулярные орбитали из одного формата в другой? Нужно ли это развивать дальше?
Пока не использую.
Vit Nhoc писал(а):
10) В последней версии программы есть утилита для создания скриптов, например очереди Gaussian или Gamess-расчётов? Можно ли сделать аналогичную утилиту для Molpro, NWchem и т. д.?
Неплохо бы еще аналогичные скрипты для Linux делать, наверное, а то пока вижу только для винды.
Vit Nhoc писал(а):
11) Любые другие предложения, замечания, сообщения о багах.
Во вкладке Coord нужно предусмотреть возможность блочного выделения (при подготовке файлов QE это зачастую бывает важно, т.к. иногда атомы одного элемента имеют разные спины и разные обозначения, и в input надо копипастить только координаты).
В базе фрагментов нет достаточно простых молекул, которые иногда бывают нужны (H
2, O
2, O
3, CO), органику неплохо бы отделить от неорганики. Ну и еще добавить, скажем, B
2H
6, дивинил, винилацетилен, BF
3, HBF
4, тропилий, пентадиенилий, тетралин, декалин.
Хотелось бы в crystallography tools возможность строить не только суперячейки, но и индексные поверхности с заданной (в количестве слоев) толщиной, а также добавлять вакуум по заданной оси после построения поверхности и уже после этого строить суперячейку.
Пока не понял, сохранился ли баг, который у меня исправно воспроизводится начиная с года так 2005 под Win 2K SP4, и кончая билдом 395 под Win 7 Prof x64 (Chemcraft 32-bit): после скольких-то часов, или, скорее, суток работы процесса точки в качестве десятичного разделителя заменяются запятыми, и это вызывает ошибки (раньше это случалось одновременно во всех окнах и приводило к вылету, сохранить файл также не удавалось, сейчас только в одном окне, а в остальных все хорошо, но баг все равно есть).
Почему-то отдельный ключ для 64-битной версии у меня упорно не хотел срабатывать, так что пришлось на 32-битной остаться...
