Её надо вручную устанавливать. Т.к. я умею только автоматически через менеджер, то пардонте..../Chemcraft: error while loading shared libraries: libgdk_pixbuf-2.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Прога потребовала старую версию графической библиотеки
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
У меня работает (openSUSE Leap 42.2, 64 bit).
Есть варнинги, но они, вроде, не мешают.
Код: Выделить всё
Gtk-Message: Failed to load module "atk-bridge"
WARNING: obsolete call to RecreateWnd for TInitForm
Warning: TWinControl.DestroyHandle InitForm:TInitForm Handle not Allocated
[TGtk2WidgetSet.Destroy] WARNING: There are 2 unreleased DCs, a detailed dump follows:
[TGtk2WidgetSet.Destroy] DCs: F626F8C0 F626F750
-
- Сообщения: 2
- Зарегистрирован: Пн янв 23, 2017 9:05 pm
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Очевидно, что не хватает пакета gdk-pixbuf второй версии../Chemcraft: error while loading shared libraries: libgdk_pixbuf-2.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
Какой дистрибутив Linux используете ?
Список библиотек, без которых не запустится, либо после запуска будет не корректно работать программа:
Код: Выделить всё
linux-gate.so.1 => (0xb7734000)
libdl.so.2 => /lib/libdl.so.2 (0x4c3b4000)
libpthread.so.0 => /lib/libpthread.so.0 (0x4c3bb000)
libX11.so.6 => /lib/libX11.so.6 (0x4c825000)
libgdk_pixbuf-2.0.so.0 => /lib/libgdk_pixbuf-2.0.so.0 (0x4cee9000)
libgtk-x11-2.0.so.0 => /lib/libgtk-x11-2.0.so.0 (0x4d347000)
libgdk-x11-2.0.so.0 => /lib/libgdk-x11-2.0.so.0 (0x4d809000)
libgobject-2.0.so.0 => /lib/libgobject-2.0.so.0 (0x4c64e000)
libglib-2.0.so.0 => /lib/libglib-2.0.so.0 (0x4c512000)
libgthread-2.0.so.0 => /lib/libgthread-2.0.so.0 (0x4cdad000)
libgmodule-2.0.so.0 => /lib/libgmodule-2.0.so.0 (0x4c6a2000)
libpango-1.0.so.0 => /lib/libpango-1.0.so.0 (0x4d04d000)
libcairo.so.2 => /lib/libcairo.so.2 (0x4d17b000)
libatk-1.0.so.0 => /lib/libatk-1.0.so.0 (0x4d021000)
libc.so.6 => /lib/libc.so.6 (0x4c1f4000)
/lib/ld-linux.so.2 (0x4c1cb000)
libxcb.so.1 => /lib/libxcb.so.1 (0x4c98e000)
libgio-2.0.so.0 => /lib/libgio-2.0.so.0 (0x4c6a9000)
libpng16.so.16 => /lib/libpng16.so.16 (0x4c9b4000)
libm.so.6 => /lib/libm.so.6 (0x4c3d8000)
libpangocairo-1.0.so.0 => /lib/libpangocairo-1.0.so.0 (0x4cffc000)
libXfixes.so.3 => /lib/libXfixes.so.3 (0x4cf12000)
libpangoft2-1.0.so.0 => /lib/libpangoft2-1.0.so.0 (0x4d2e7000)
libfontconfig.so.1 => /lib/libfontconfig.so.1 (0x4cdb2000)
libXrender.so.1 => /lib/libXrender.so.1 (0x4cd8d000)
libXinerama.so.1 => /lib/libXinerama.so.1 (0x4cda7000)
libXi.so.6 => /lib/libXi.so.6 (0x4cdf0000)
libXrandr.so.2 => /lib/libXrandr.so.2 (0x4cd9a000)
libXcursor.so.1 => /lib/libXcursor.so.1 (0x4cfc9000)
libXcomposite.so.1 => /lib/libXcomposite.so.1 (0x4d00b000)
libXdamage.so.1 => /lib/libXdamage.so.1 (0x4cff6000)
libXext.so.6 => /lib/libXext.so.6 (0x4cb9b000)
libffi.so.6 => /lib/libffi.so.6 (0x4c645000)
libpixman-1.so.0 => /lib/libpixman-1.so.0 (0x4cf1a000)
libfreetype.so.6 => /lib/libfreetype.so.6 (0x4cbc5000)
libEGL.so.1 => /lib/libEGL.so.1 (0x4d0b5000)
libxcb-shm.so.0 => /lib/libxcb-shm.so.0 (0x4d011000)
libxcb-render.so.0 => /lib/libxcb-render.so.0 (0x4d0a8000)
libz.so.1 => /lib/libz.so.1 (0x4c421000)
libGL.so.1 => /lib/libGL.so.1 (0x4ce08000)
librt.so.1 => /lib/librt.so.1 (0x4c43a000)
libXau.so.6 => /lib/libXau.so.6 (0x4c81f000)
libselinux.so.1 => /lib/libselinux.so.1 (0x4c4b2000)
libresolv.so.2 => /lib/libresolv.so.2 (0x4c4d8000)
libharfbuzz.so.0 => /lib/libharfbuzz.so.0 (0x4d0e1000)
libexpat.so.1 => /lib/libexpat.so.1 (0x4cd62000)
libX11-xcb.so.1 => /lib/libX11-xcb.so.1 (0x4ce03000)
libxcb-dri2.so.0 => /lib/libxcb-dri2.so.0 (0x4d2df000)
libxcb-xfixes.so.0 => /lib/libxcb-xfixes.so.0 (0x4d2be000)
libxcb-shape.so.0 => /lib/libxcb-shape.so.0 (0x4d2d8000)
libgbm.so.1 => /lib/libgbm.so.1 (0x4d017000)
libwayland-client.so.0 => /lib/libwayland-client.so.0 (0x4d09a000)
libwayland-server.so.0 => /lib/libwayland-server.so.0 (0x4d2c8000)
libglapi.so.0 => /lib/libglapi.so.0 (0x4d13b000)
libdrm.so.2 => /lib/libdrm.so.2 (0x4ced9000)
libxcb-glx.so.0 => /lib/libxcb-glx.so.0 (0x4cebc000)
libXxf86vm.so.1 => /lib/libXxf86vm.so.1 (0x4cc69000)
libpcre.so.1 => /lib/libpcre.so.1 (0x4c445000)
libgraphite2.so.3 => /lib/libgraphite2.so.3 (0x4cfd7000)
libudev.so.1 => /lib/libudev.so.1 (0x4cbb0000)
libgcc_s.so.1 => /lib/libgcc_s.so.1 (0x4c4f3000)
как использовать:
распаковать содержимое в папку Chemcraft, запустить fix.sh (из консоли запуск ./fix.sh)
пробуйте. но не факт, что ещё чего нибудь нехватает... от этого никак не уберечься. нельзя же весь линукс включить в пакет поставки Chemcraft
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
- uchebnik fiziki
- Сообщения: 4265
- Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Но нестандартные библиотеки можно.
Свобода, равенство, братство.
Или смерть.
Или смерть.
-
- Сообщения: 2
- Зарегистрирован: Пн янв 23, 2017 9:05 pm
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
uchebnik fiziki, например, какие ?
нестандартно, это когда я сам написал библиотеку, и ни один дистрибутив linux об этом не знает.
великое множество пакетов, лежат в репозиториях соответствующих дистрибутивов linux, все пакеты которые требует ChemCraft по-любому должны быть уже в дистрибутиве, либо в доступны для установки из репозиториев.
ChemCraft пробовал запускать на множестве различных дистрибутивах, везде работает сразу, ничего до устанавливать не нужно было.
работает даже с LiveDVD версий дистрибутивов, т.е. загружаемся с оптического диска в Linux и работаем в ChemCraft с флешечки, например.
нестандартно, это когда я сам написал библиотеку, и ни один дистрибутив linux об этом не знает.
великое множество пакетов, лежат в репозиториях соответствующих дистрибутивов linux, все пакеты которые требует ChemCraft по-любому должны быть уже в дистрибутиве, либо в доступны для установки из репозиториев.
ChemCraft пробовал запускать на множестве различных дистрибутивах, везде работает сразу, ничего до устанавливать не нужно было.
работает даже с LiveDVD версий дистрибутивов, т.е. загружаемся с оптического диска в Linux и работаем в ChemCraft с флешечки, например.
- uchebnik fiziki
- Сообщения: 4265
- Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Ну почему же? Если нужно привязаться к конкретной версии, зачастую включают её. Есть ещё библиотеки, не лежащие в основном репозитории, их тоже можно включать в пакет.
Свобода, равенство, братство.
Или смерть.
Или смерть.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
При визцализации как законченного так и незаконченного IRC расчета после последней посчитанной точки стоит Optimised geometry.
Для неоконченного расчета (расчет еще идет) а также для расчетов не дошедших туда куда они должны были дойти (смерть по таймлимиту, окончание с Maximum number of steps reached - типичная причина которого нехватило дефолтных 10 точек, фейлы связанные с x-delta) это просто некорректно.
Для оконченного расчета (если мы говорим о корректно завершившемся IRC пришедшем в район реального минимума) это тоже не очень точно: последняя полученная геометрия "гдето недалеко" от минимума (не больше чем stepsize), но все таки это не геометрия минимума.
Для неоконченного расчета (расчет еще идет) а также для расчетов не дошедших туда куда они должны были дойти (смерть по таймлимиту, окончание с Maximum number of steps reached - типичная причина которого нехватило дефолтных 10 точек, фейлы связанные с x-delta) это просто некорректно.
Для оконченного расчета (если мы говорим о корректно завершившемся IRC пришедшем в район реального минимума) это тоже не очень точно: последняя полученная геометрия "гдето недалеко" от минимума (не больше чем stepsize), но все таки это не геометрия минимума.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Просьба написать, у кого перестал открываться сайт chemcraftprog.com. Я сделал на сайте https и вроде начались проблемы.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
открываются обе версии
- Любитель_Манниха
- флудомастер
- Сообщения: 15138
- Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Если отключить показ атомов (водородов, например), то в координаты эти атомы тоже не выводятся, имхо это неправильно, ну или должно быть опционально - водороды можно убирать для лучшего вида всей молекулы, а координаты-то потом все нужны.
Да, и начиная с какой-то недавней версии, если открываешь out (речь о природе), в котором не завершился первый шаг оптимизации, chemcraft не выдаёт картинку и в названии окна программы пишет имя предыдущего открытого файла.
Да, и начиная с какой-то недавней версии, если открываешь out (речь о природе), в котором не завершился первый шаг оптимизации, chemcraft не выдаёт картинку и в названии окна программы пишет имя предыдущего открытого файла.
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Вы не могли бы прислать мне пример такого out файла?Любитель_Манниха писал(а): ↑Вт фев 28, 2017 2:02 amДа, и начиная с какой-то недавней версии, если открываешь out (речь о природе), в котором не завершился первый шаг оптимизации, chemcraft не выдаёт картинку и в названии окна программы пишет имя предыдущего открытого файла.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
1. Умеет ли ChemCraft визуализировать хим.сдвиги, рассчитанные в ПРИРОДе?
2. На softkey уже ChemCraft не продаёте? Гос.конторам легче через softkey покупать.
2. На softkey уже ChemCraft не продаёте? Гос.конторам легче через softkey покупать.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
1. Пока нет. Спасибо за файл, я этим займусь. Вы не могли бы прикрепить ещё какой-нибудь файл с разными атомами, включая атомы с названием из двух букв (вдруг для них положение цифр в строках будеть чуть другим).
2. Сейчас не продаю, поскольку деньги были очень маленькие (в том числе из-за двойного налогообложения). Мне проще продать программу за 1-2 тысячи без документов, когда покупатель пополняет мой телефон.
2. Сейчас не продаю, поскольку деньги были очень маленькие (в том числе из-за двойного налогообложения). Мне проще продать программу за 1-2 тысячи без документов, когда покупатель пополняет мой телефон.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Файлы:
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Вот еще файл с расчетом не только хим.сдвигов, но и экранирования в точках вне ядер (для NICS). Эти точки и экранирование в них тоже можно отображать.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Это мне довольно долго делать, поскольку обычно ЯМР сдвиги отображаются только для атомов, представленных в секции с координатами в выходном файле. Вы уверены, что такая фича нужна? Мне не очень понятно, зачем нужны ЯМР на фиктивных атомах, если экспериментально измеряются только хим.сдвиги на реальных ядрах.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Эммм, да, но скажем есть критерий ароматичности NICS (один из основных на сегодня), он меряется в точке в центре ароматической системы (иногда на некором удалении от него, если мы говорим о плоских кольцах). Так что отображать фиктивные атомы и свойства на них - это нормально. Кстати Bq атомы в гауссиане должны идти вместе с нормальными.
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
В гауссиане да, а в Природе печатается таблица " additional points:".
В каких ещё случаях эта таблица может быть полезна, кроме ЯМР?
В каких ещё случаях эта таблица может быть полезна, кроме ЯМР?
Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft
Вообще, экранирование на фиктивных атомах считают довольно часто. Только за последний год около 700 статей, в которых упоминается "NICS aromaticity". Но считают в основном гауссианом, доля Природы незначительна. Поэтому, возможно, и нет особой необходимости связываться, учитывая, что в out-файле Природы соответствующая информация действительно расположена неудобно для того, чтобы ее парсить: координаты в одном месте, экранирование в другом, и все не там, где координаты и сдвиги обычных атомов.Vit Nhoc писал(а): ↑Пт мар 03, 2017 12:22 pmЭто мне довольно долго делать, поскольку обычно ЯМР сдвиги отображаются только для атомов, представленных в секции с координатами в выходном файле. Вы уверены, что такая фича нужна? Мне не очень понятно, зачем нужны ЯМР на фиктивных атомах, если экспериментально измеряются только хим.сдвиги на реальных ядрах.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 18 гостей