как делать DFT-D
как делать DFT-D
Здравствуйте, я тут непрофессионал, мало что понял из прочитанного, но мне очень интересно, есть ли в Гауссиан-е, Gamess, NWChem это самое DFT-D? Если есть, какие keyword-ы? Мне ведь надо как-то моделировать водородную связь.
Последний раз редактировалось Гесс Ср июн 10, 2015 4:33 pm, всего редактировалось 1 раз.
Причина: Тема отделена из темы о смысле DFT-D
Причина: Тема отделена из темы о смысле DFT-D
Re: DFT-D
в гауссиане точно есть, вызывается либо при использовании функционалов типа wB97XD или B2PLYPD, либо отдельным кейвордом GD3, GD3BJ для тех функционалов, для которых есть встроенные параметры.Vit Nhoc писал(а):Здравствуйте, я тут непрофессионал, мало что понял из прочитанного, но мне очень интересно, есть ли в Гауссиан-е, Gamess, NWChem это самое DFT-D? Если есть, какие keyword-ы? Мне ведь надо как-то моделировать водородную связь.
Make quantum chemistry, not war
Re: DFT-D
Если не ошибаюсь то это начиная с С а то и D релиза.Shorku писал(а):в гауссиане точно есть, вызывается либо при использовании функционалов типа wB97XD или B2PLYPD, либо отдельным кейвордом GD3, GD3BJ для тех функционалов, для которых есть встроенные параметры.Vit Nhoc писал(а):Здравствуйте, я тут непрофессионал, мало что понял из прочитанного, но мне очень интересно, есть ли в Гауссиан-е, Gamess, NWChem это самое DFT-D? Если есть, какие keyword-ы? Мне ведь надо как-то моделировать водородную связь.
Vit Nhoc - какой у вас релиз гауссиана?
См также https://www.researchgate.net/post/Which ... 09_program
Re: DFT-D
Затрудняюсь ответить, в Help/About написано просто Version 7.0Vit Nhoc - какой у вас релиз гауссиана?
Re: DFT-D
В первых строках аутпута:Vit Nhoc писал(а):Затрудняюсь ответить, в Help/About написано просто Version 7.0Vit Nhoc - какой у вас релиз гауссиана?
чуть ниже:Cite this work as:
Gaussian 09, Revision A.02,
В архивном блоке******************************************
Gaussian 09: EM64L-G09RevA.02 11-Jun-2009
Либо например,0.\\Version=EM64L-G09RevA.02\State=1-A1G\HF=-302.2246003\MP2=-303.414
Cite this work as:
Gaussian 09, Revision D.01,
Gaussian 09: ES64L-G09RevD.01 24-Apr-2013
7.9132316231,1.375018496\\Version=ES64L-G09RevD.01\State=1-A\HF=-3777.
Re: как делать DFT-D
В NWChem задается строкой "disp vdw 3" в блоке dft:
....
dft
xc b3lyp
disp vdw 3
direct
iterations 300
grid fine
mult 1
end
....
....
dft
xc b3lyp
disp vdw 3
direct
iterations 300
grid fine
mult 1
end
....
А.П.
Re: как делать DFT-D
В Гамессе есть. Управляющая карта $DFT
Я только добавляю $DFT DC=.T. $END и всё
DC - dispersion correction
Я только добавляю $DFT DC=.T. $END и всё
DC - dispersion correction
Re: как делать DFT-D
Используйте m062x.Vit Nhoc писал(а):Здравствуйте, я тут непрофессионал, мало что понял из прочитанного, но мне очень интересно, есть ли в Гауссиан-е, Gamess, NWChem это самое DFT-D? Если есть, какие keyword-ы? Мне ведь надо как-то моделировать водородную связь.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.
Re: как делать DFT-D
Я понимаю что миннесотовские функционалы постоянно рекламируются как замечательно описывающие нековалентное взаимодействие, однако если смотреть наYurii писал(а):Используйте m062x.Vit Nhoc писал(а):Здравствуйте, я тут непрофессионал, мало что понял из прочитанного, но мне очень интересно, есть ли в Гауссиан-е, Gamess, NWChem это самое DFT-D? Если есть, какие keyword-ы? Мне ведь надо как-то моделировать водородную связь.
Validation of electronic structure methods for isomerization reactions of large organic molecules то M06-2X далеко не лучший вариант даже после улучшения опять же коррекциями гримме (хорошим назван wB97X-D), а исходя из The accuracy of quantum chemical methods for large noncovalent complexes. M06-2X вообще ужас и страх с погрешностью на уровне полуэмпирики (40% для M06-2X/def2-svp)
Re: DFT-D
Как я понимаю, в wB97XD всё-таки есть DFT-D уже на Gaussian09 A (во-первых, по названию, во-вторых, в выдаче с этим функционалом есть строка R6Disp: Dispersion energy = , которой нет с другими функционалами).Гесс писал(а):Если не ошибаюсь то это начиная с С а то и D релиза.Shorku писал(а):в гауссиане точно есть, вызывается либо при использовании функционалов типа wB97XD или B2PLYPD, либо отдельным кейвордом GD3, GD3BJ для тех функционалов, для которых есть встроенные параметры.Vit Nhoc писал(а):Здравствуйте, я тут непрофессионал, мало что понял из прочитанного, но мне очень интересно, есть ли в Гауссиан-е, Gamess, NWChem это самое DFT-D? Если есть, какие keyword-ы? Мне ведь надо как-то моделировать водородную связь.
Re: как делать DFT-D
А DFT - это и есть, по большому счету, полуэмпирика. m062x для широкого круга задач дает прекрасные результаты: в наших расчетах сравнение электронографических результатов и расчетов по mp2 и m062x дает для нашего круга задач прекрасные совпадения, разумеется, в хороших базисах (и не только в геометриях конформеров, а например, в процентном содержании конформеров). И для каждого DFT можно подобрать такие системы, что результаты будут просто ужасными.Гесс писал(а):на уровне полуэмпирики
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.
Re: DFT-D
Я неправильно выразился. Я говорил о самостоятельной D или D3 коррекции, подвешиваемой к различным функционалам. У них в названии -D обычно отделено переносом.Vit Nhoc писал(а):Как я понимаю, в wB97XD всё-таки есть DFT-D уже на Gaussian09 A (во-первых, по названию, во-вторых, в выдаче с этим функционалом есть строка R6Disp: Dispersion energy = , которой нет с другими функционалами).
Функционалы изначально созданные с той же гримме поправкой есть в гауссиане давно, их сравнительно немного и они обычно заканчиваются на D без тире (B97D).
Да, вы поняли правильно выбранный вами функционал работает.
Ну на этот счет есть различные мнения, http://ccl.net/chemistry/resources/mess ... index.html но имхо это не очень принципиально, а с тем что каждый функционал имеет ограниченную область применения я разумеется согласен.Yurii писал(а):А DFT - это и есть, по большому счету, полуэмпирика. ..
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 4 гостя