посоветуйте ПО для QSAR

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
ruderal
Сообщения: 91
Зарегистрирован: Пн авг 22, 2011 5:03 pm

посоветуйте ПО для QSAR

Сообщение ruderal » Ср окт 28, 2015 8:26 pm

провел расчет дескрипторов и построил модель с помощью Spartan 14 и Discovery Studio 2.5. С удивлением обнаружил что нет функции leave one out cross validation. Возможно просто не нашел, тогда пжлст подскажите кто знает.
Или посоветуйте ПО где данная функция есть.
Спасибо

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: посоветуйте ПО для QSAR

Сообщение uchebnik fiziki » Ср окт 28, 2015 10:58 pm

Если уже есть модель, кросс-валидацию сделать не получится. Это реализовано непосредственно в qsar-ных программах. У Биовии есть QSAR Workbench, например. Хотя и в DS это реализовано:
Analyze and validate models using model applicability domains (MAD), automatic test set validation, cross validation and statistical metrics
И да, LOO -- зло.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

ruderal
Сообщения: 91
Зарегистрирован: Пн авг 22, 2011 5:03 pm

Re: посоветуйте ПО для QSAR

Сообщение ruderal » Чт окт 29, 2015 5:02 pm

uchebnik fiziki писал(а):в DS это реализовано:

Analyze and validate models using model applicability domains (MAD), automatic test set validation, cross validation and statistical metrics
для MLR и PLS моделей, насколько я понял, это не так. Кросс-валидация реализована, например, для протокола Bayeseian model.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 5 гостей