Добрый день, уважаемые форумчане. Встала задача смоделировать π-π стекинг между геликатом и бензолом. На ум приходит только вставить 2 молекулы и прогнать их молекулярным моделированием, а потом то, что получится уже дальше оптимизировать, скажем DFT.
Скорее всего, я не прав:( Подскажите, каким образом можно реализовать поставленную задачу.
π-π стекинг
π-π стекинг
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: π-π стекинг
молекулярное моделирование = молекулярная механика? она стекинг не почувствует, там даже фенилы бывают неплоские иногда... лучше бензол для начала ближе к какому-нибудь кольцу параллельно расположите на расстоянии 3,5-5 А да попробуйте оптимизировать. если не прокатит, попробуйте перпендикулярно - может, в вашем случае Т-образный стекинг выгоднее. а вообще можно и просто взять в вашем случае, наверное, какой-нибудь замещённый пиррол для начала (чтобы время просто сэкономить).
тут вот есть тоже стекинг с бензолом, но кристалл был у них, РСА, и бензол к бензолу всяко лучше конечно будет подходить.. (см. вложение).
тут вот есть тоже стекинг с бензолом, но кристалл был у них, РСА, и бензол к бензолу всяко лучше конечно будет подходить.. (см. вложение).
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: π-π стекинг
Спасибо.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 8 гостей