Расчет в Gaussian, в чем ошибка?

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Rupreht
Сообщения: 374
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 9:34 pm

Расчет в Gaussian, в чем ошибка?

Сообщение Rupreht » Вт апр 26, 2016 1:36 pm

Всем доброго дня.
подскажите пожалуйста, задаю расчет в гауссиан09 через некоторое время (2-3 дня) расчет вылетает. Может кто подскажет в чем закралась ошибка?! Gjf и log прилагаю. Спасибо.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Расчет в Gaussian, в чем ошибка?

Сообщение Гесс » Вт апр 26, 2016 2:26 pm

Почему конкретно падает сказать не могу судя по отсутствию жалобы в конце файла причина в чем то внешнем - нехватка памяти, таймлимит или еще чтото такое.
На мой взгляд такую межмолекулярку надо считать с дисперсионными коррекциями. Соответственно нужен D-релиз Gауссиана или Orca.
И чисто на всякий случай - конформация из чего то типа конформационного поиска или МД или "наобум"?

Rupreht
Сообщения: 374
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 9:34 pm

Re: Расчет в Gaussian, в чем ошибка?

Сообщение Rupreht » Вт апр 26, 2016 2:46 pm

модель взята после оптимизации в мопаке. Вариант без растворителя досчитался до спектра. Этот вариант уже 3 раза запускал, но постоянно вылетает.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Расчет в Gaussian, в чем ошибка?

Сообщение Гесс » Вт апр 26, 2016 2:58 pm

Rupreht писал(а):Вариант без растворителя досчитался до спектра.
Всмысле без ацетона? Судя по сходимости оно у вас не очень то намеренно сходться. И я грешу именно на неучет нековалентного взаимодействия с ацетоном.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2047
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Расчет в Gaussian, в чем ошибка?

Сообщение amge » Вт апр 26, 2016 3:56 pm

Гесс писал(а):И чисто на всякий случай - конформация из чего то типа конформационного поиска или МД или "наобум"?
Вопрос правомерный. Поскольку я фанат поиска конформеров, запустил его у себя (без ацетона, разумеется) молекулярной механикой тинкером. На первых же шагах нашелся конформер на 7 ккал более стабильный, чем стартовый. Но полный поиск будет только завтра (надеюсь).

Так что если стартовая конформация была взята "наобум" (не из рентгена, например, а просто нарисована), то, боюсь, счет квантами был в значительной мере бессмысленным.

PS Поиск завершился, выкладываю (первая сотня самых стабильных конформеров и исходный (в конце). Конкатенированный xyz).
PS4_conf.xyz
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 25 гостей