вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
SHU
Сообщения: 1471
Зарегистрирован: Пн июн 04, 2007 9:33 am

вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение SHU » Чт авг 18, 2016 9:38 am

Доброе утро!
За помощью к Вам.
Понадобилось вычислить дипольный момент вот такой молекулы: п- бутоксибензилового эфира L(-) ментола.
Может, теперь есть какие-то программы для вычисления таких моментов? А то не хочется считать вручную по групповым.
В справочниках вряд ли найду готовый момент ,т к молекула "варилась" на заказ.
Заранее спасибо! :deal:

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение VTur » Пт авг 19, 2016 5:59 pm

Эмпирикой из дипольных моментов связей
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение Shorku » Сб авг 20, 2016 12:29 am

Да не такая уж и большая. Любой пакет, умеющий DFT или MP2 подойдет.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение Гесс » Сб авг 20, 2016 12:29 am

можно сделать реальные кванты с усреднением по конформерам, из конформационного поиска или МД.
Полуэмпирикой или ДФТ.
А какое нужно какчество - где используется цифра?
И какова срачность? я ближайшую неделю не буду считать ничего.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение Гесс » Сб авг 20, 2016 12:30 am

МП2 - один расчет - да, а с сотней уже задолбесся.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение Shorku » Сб авг 20, 2016 12:35 am

Нуу, RI-MP2 не так уж и тяжел, скажем. Да и речи про MD и стопиццот структур здесь, видимо, пока не идет
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
SHU
Сообщения: 1471
Зарегистрирован: Пн июн 04, 2007 9:33 am

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение SHU » Сб авг 20, 2016 9:39 am

VTur писал(а):Эмпирикой из дипольных моментов связей
Да это понятно.

Аватара пользователя
SHU
Сообщения: 1471
Зарегистрирован: Пн июн 04, 2007 9:33 am

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение SHU » Сб авг 20, 2016 9:41 am

Shorku писал(а):Да не такая уж и большая. Любой пакет, умеющий DFT или MP2 подойдет.
Shorku, записала)) Премного благодарна

Аватара пользователя
SHU
Сообщения: 1471
Зарегистрирован: Пн июн 04, 2007 9:33 am

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение SHU » Сб авг 20, 2016 9:46 am

Гесс писал(а):можно сделать реальные кванты с усреднением по конформерам, из конформационного поиска или МД.
Полуэмпирикой или ДФТ.
А какое нужно какчество - где используется цифра?
И какова срачность? я ближайшую неделю не буду считать ничего.
Да-да, по поводу метода поняла, лучше с усреднением по конформерам ,там их немного.
По поводу точности мне ничего не сказали, но эта молекула будет применяться как хиральная добавка в антибликовых экранах на танках :shuffle:
Если поможете посчитать, очень меня выручите :congratulations:

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение Гесс » Сб авг 20, 2016 10:26 am

Пинайте меня через неделю, ногами, потому что память у меня как у рыбки из "в поисках Немо". Можно в ЛС и отуда я дам свои более осязаемые контакты.
Сам по себе единичный расчет - много ума не надо, а вот с сопутствующими нюансами можно задолбаться.
Например: доля конформеров в смеси различается, соответственно суммарный дипольный момент Д это не (Д1+Д2+Д3)/3 а чтото типа (0.5*Д1+0.3*Д2+0.2*Д3). Причем реальные коэффициенты слишком чувствительно связаны с энергией конформеров (которая считается с некоторой конечной (и недостаточной для этого) точностью) и даже не только с ней - конформеры в газе мало связаны с конформерами в твердой фазе (ибо самоорганизация). Если дипольные моменты близки между собой то проблема мала. Но если разница велика - то да, это проблема.
Другой проблемой будет используемый метод. ДФТ знаменит тем что правильным подбором функционала и базиса можно получить любую желаемую цифру. Так что желательно проводить еще сравнения с сравнимыми веществами для которых дипольный момент надежно известен (это будет общей верификацией метода).

Аватара пользователя
SHU
Сообщения: 1471
Зарегистрирован: Пн июн 04, 2007 9:33 am

Re: вычислить дипольный момент большой оргмолекулы

Сообщение SHU » Пн авг 22, 2016 10:24 am

хиральная добавка.doc
Гесс, спасибооооооооооооо!!!!!!!!!1Не представляете ,как выручите. Напишу через неделю.
меня вполне устроит единичный расчет, а что касается конформеров ,можно просто выбрать самый стабильный и по нему посчитать. Попробую, конечно ,еще поискать литературные данные по дипольным моментам подобных соединений, скорее всего ,в справочниках таких данных нет, если только в статьях найду
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 5 гостей