CASSCF и MRCI в Орке

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
Vinianel
Сообщения: 49
Зарегистрирован: Пт ноя 25, 2011 12:32 pm

CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение Vinianel » Ср мар 08, 2017 3:51 pm

Уважаемые коллеги, искренне надеюсь, что сюда еще заглядывают специалисты по мультиреференсу и им сочувствующие, ибо я не могу понять в чем причина ошибки.
Считаю молекулу кислорода в Орке по вот этому вот мануалу: https://sites.google.com/site/orcainput ... -selection.

CASCSF расчет сошелся и выдал чудные орбитальки, согласующиеся с моим представлением о системе:

Код: Выделить всё

CASSCF RESULTS
--------------

Final CASSCF energy       : -149.553418703 Eh   -4069.5554 eV

Orbital   Occ.   Energy(Eh)   Energy(eV):
    0:  2.000000      -20.695639   -563.1570 
    1:  2.000000      -20.695135   -563.1432 
    2:  2.000000       -1.434537    -39.0357 
    3:  2.000000       -1.070625    -29.1332 
    4:  1.959516       -0.887894    -24.1608 
    5:  1.949049       -0.684561    -18.6279 
    6:  1.949049       -0.684561    -18.6279 
    7:  1.050285       -0.221058     -6.0153 
    8:  1.050285       -0.221058     -6.0153 
    9:  0.041815        0.627905     17.0862 
   10:  0.000000        0.975264     26.5383 
   11:  0.000000        0.989233     26.9184 
   12:  0.000000        1.116917     30.3929 
   13:  0.000000        1.116917     30.3929 
   14:  0.000000        1.174233     31.9525 
   15:  0.000000        1.222064     33.2541 
   16:  0.000000        1.222064     33.2541 
   17:  0.000000        1.396685     38.0057 
   18:  0.000000        2.435052     66.2611 
   19:  0.000000        2.435052     66.2611 
   20:  0.000000        2.729386     74.2704 
   21:  0.000000        2.729386     74.2704 
   22:  0.000000        3.031787     82.4991 
   23:  0.000000        3.031787     82.4991 
   24:  0.000000        3.133875     85.2771 
   25:  0.000000        3.680184    100.1429 
   26:  0.000000        3.680184    100.1429 
   27:  0.000000        4.220049    114.8334 
Это пункт 3 в вышеприведенном мануале. Далее я хочу сделать MRCI расчет, как в п. 4. Копирую шапочку инпута, а так же .gbw полученный в п.3. Запускаю расчет. И происходит следующее:

Код: Выделить всё

!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
!! SERIOUS WARNING: The orbitals and populations did NOT !!
!!                  come from a CONVERGED calculation    !!
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

THE WAVEFUNCTION AND DENSITY WILL STILL BE STORED BUT BE CAREFUL
MAKE SURE THAT WHAT YOU INPUT MAKES ACTUALLY SENSE!

             **** DENSITY FILE WAS UPDATED (/cluster/scratch/tsybizoa/Orca/CASSCF_test/4/job4.scfp.tmp) ****
----------------
ORBITAL ENERGIES
----------------

  NO   OCC          E(Eh)            E(eV) 
   0   2.0000     -20.695639      -563.1570 
   1   2.0000     -20.695135      -563.1432 
   2   2.0000      -1.434537       -39.0357 
   3   2.0000      -1.070625       -29.1332 
   4   1.9595      -0.887894       -24.1608 
   5   1.9490      -0.684561       -18.6279 
   6   1.9490      -0.684561       -18.6279 
   7   1.0503      -0.221058        -6.0153 
   8   1.0503      -0.221058        -6.0153 
   9   0.0418       0.627905        17.0862 
  10   0.0000       0.975264        26.5383 
  11   0.0000       0.989233        26.9184 
  12   0.0000       1.116917        30.3929 
  13   0.0000       1.116917        30.3929 
  14   0.0000       1.174233        31.9525 
  15   0.0000       1.222064        33.2541 
  16   0.0000       1.222064        33.2541 
  17   0.0000       1.396685        38.0057 
  18   0.0000       2.435052        66.2611 
  19   0.0000       2.435052        66.2611 
  20   0.0000       2.729386        74.2704 
  21   0.0000       2.729386        74.2704 
  22   0.0000       3.031787        82.4991 
  23   0.0000       3.031787        82.4991 
  24   0.0000       3.133875        85.2771 
  25   0.0000       3.680184       100.1429 
  26   0.0000       3.680184       100.1429 
  27   0.0000       4.220049       114.8334 

                    ********************************
                    * MULLIKEN POPULATION ANALYSIS *
                    ********************************

      **** WARNING: MULLIKEN FINDS   14.9078996 ELECTRONS INSTEAD OF 16 ****
-----------------------
MULLIKEN ATOMIC CHARGES
-----------------------
   0 O :    0.546050
   1 O :    0.546050
Sum of atomic charges:    1.0921004

и еще через несколько времени расчет умирает со словами "An error has occured in the MRCI module". Аутпут файл прилагаю на всякий случай. Я не могу понять, что я упускаю? Почему такие странные предупреждения от Орки? А, главное, как это лечить? Буду рада любым советам.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

M.Sh.
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Чт янв 30, 2014 10:48 pm

Re: CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение M.Sh. » Ср мар 08, 2017 6:36 pm

Несколько лет назад у меня была похожая проблема. На форуме Орки ответили, что под windows MRCI на тот момент был не полный и предложили использовать linux. Так что если у Вас windows, возможно, дело в этом. Попробуйте решить эту задачу в Firefly.

Аватара пользователя
Vinianel
Сообщения: 49
Зарегистрирован: Пт ноя 25, 2011 12:32 pm

Re: CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение Vinianel » Ср мар 08, 2017 7:13 pm

M.Sh., спасибо. Для расчетов использую кластер на Линуксе, так что проблема явно не в этом. Попробовать Firefly у меня стоит следующим пунктом, однако пока, по не зависящим от меня причинам, не могу получить лицензию. Это будет решаться в будущем, но пока вот решила Орку попробовать, что бы хотя бы понять, как и что.

endlesslake
Сообщения: 191
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение endlesslake » Ср мар 15, 2017 3:59 pm

SERIOUS WARNING, насколько я понимаю, можно и нужно проигнорировать в данном случае.

а там где оно запускалось есть 800Gb оперативной памяти?

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13062
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение Гесс » Ср мар 15, 2017 5:51 pm

35584 обычно связано с памятью, но вроде у кого то было что с числом процов.
Так как мы говорим о 2 атомной молекуле - я предлагаю сильно урезать обоих осетров: снизить число процов скажем до 4, а maxcore до ну скажем 12000, что даст нам в результате 48гигов оперативы.

Аватара пользователя
Vinianel
Сообщения: 49
Зарегистрирован: Пт ноя 25, 2011 12:32 pm

Re: CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение Vinianel » Чт мар 16, 2017 2:03 pm

Миль пардон, 50Gb per core - ошибка "копипаста". :very_shuffle:
С коммандной строки вводились 16 cores и 8Gb per core, чисто с целью попасть в очередь "bigmemory" на кластере, чтобы быстрее запустить расчет. Задачи на 48 Gb оперативки попадают в очередь "normal" и могут висеть днями.
Попробовала последовать совету Гесса - та же ошибка.

endlesslake
Сообщения: 191
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение endlesslake » Ср мар 22, 2017 12:24 am

я могу ошибаться, но такой вариант использования mrci в орке, кажется, не корректен. во всех примерах которые мне попадались или присутствует %casscf блок, или в %mrci блоке newblock заданы в явном виду.

например, рабочие с технической точки зрения варианты

Код: Выделить всё

! MRCI def2-SVP Normalprint MOREAD Allowrhf NoIter
%moinp "casscf_test.gbw"
%mrci
        newblock 1 *
                nroots 1
                refs cas(4,3) end
        end
end
*xyz 0 1
8        0.000000000      0.000000000      0.611380000
8        0.000000000      0.000000000     -0.611380000
*
или

Код: Выделить всё

! def2-SVP Normalprint MOREAD NoIter
%moinp "casscf_test.gbw"
%casscf
trafostep ri
nel 4
norb 3
mult 1
end
%mrci
end
*xyz 0 1
8        0.000000000      0.000000000      0.611380000
8        0.000000000      0.000000000     -0.611380000
*

Аватара пользователя
Vinianel
Сообщения: 49
Зарегистрирован: Пт ноя 25, 2011 12:32 pm

Re: CASSCF и MRCI в Орке

Сообщение Vinianel » Ср мар 22, 2017 1:07 pm

О, спасибо, попробую так

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 17 гостей