оптические изомеры

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1485
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

оптические изомеры

Сообщение surius » Ср июл 19, 2017 8:05 pm

Коллеги, вопрос технического характера:
У меня есть химическое соединение, в котором, как это не прискорбно, 4 оптически активных центра. Это обстоятельство дает нам 15 (16 конечно же) возможных изомеров (если я нигде не просчитался). Вопрос есть ли софтики какого лтбо рода которые могли бы такие изомеры сгенерировать?

Заранее спасибо
Последний раз редактировалось surius Ср июл 19, 2017 9:35 pm, всего редактировалось 1 раз.
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: оптические изомеры

Сообщение uchebnik fiziki » Ср июл 19, 2017 9:15 pm

OMEGA -- там есть функция flipper.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2021
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: оптические изомеры

Сообщение amge » Чт июл 20, 2017 10:19 am

MarvinSketch. Calculations-Isomers-Stereoisomers

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1485
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: оптические изомеры

Сообщение surius » Чт июл 20, 2017 11:19 am

uchebnik fiziki писал(а): OMEGA -- там есть функция flipper.
только, вроде бы, она коммерческая?
amge писал(а):MarvinSketch. Calculations-Isomers-Stereoisomers
Да тоже не него вчера наткнулся.

Но вообще, то что хотелось бы, так это програмку которая могла бы работать не с плоскими стректурами, а с любого вида .xyz Т.е. которая бы стартовала с 3D структуры и их же генерировала.
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2021
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: оптические изомеры

Сообщение amge » Чт июл 20, 2017 11:54 am

Не знаю, может ли Stereoisomers плагин работать с 3D структурами, но, сохранить то результат он может? (Проверить не могу, на этот плагин лицензия закончилась.) А дальше сам MarvinSketch - он точно умеет делать преобразования 2D в 3D и обратно с сохранением стереоизомерии. Еще там есть утилита cxcalc, с помощью которой все можно сделать в консольном режиме.

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: оптические изомеры

Сообщение uchebnik fiziki » Чт июл 20, 2017 12:47 pm

surius писал(а):
Чт июл 20, 2017 11:19 am
uchebnik fiziki писал(а): OMEGA -- там есть функция flipper.
только, вроде бы, она коммерческая?
Бесплатная для академиков.
surius писал(а):
Чт июл 20, 2017 11:19 am
Но вообще, то что хотелось бы, так это програмку которая могла бы работать не с плоскими стректурами, а с любого вида .xyz Т.е. которая бы стартовала с 3D структуры и их же генерировала.
OpenBabel. CDK ещё может, скорее всего, но на любителя.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей