Металическая связь

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Sergey K
Сообщения: 3
Зарегистрирован: Пн ноя 13, 2017 4:09 pm

Металическая связь

Сообщение Sergey K » Пн дек 11, 2017 1:20 pm

Здравствуйте!

Еще один вопрос.

Вот захотелось мне нарисовать кластер из 5-6 атомов индия, допустим, и нагрев, посмотреть как он разваливается.

Встают вопросы:

1. Какой потенциал для моделирования лучше использовать?
2. Как собственно, в программах типа HyperChem или Gaussian задать эту металическую связь. Ковалентную понятно - линии нарисовал и ок, а металлическую? Или у объеков таких размеров еще не металлическая связь? \

Просвятите пожалуйста.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13055
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Металическая связь

Сообщение Гесс » Пн дек 11, 2017 3:40 pm

Используйте ДФТ и не будете иметь проблем со связями. Но не B3LYP, а скажем PBE.
Палочка на экране это больше эффект визуализации нежели реальный объект, ну или надо лезть в бейдеровский анализ. Так линии между атомами можете ставить сколько угодно и каких угодно, ДФТ и все более высокоуровневые методы их проигнорит. Полуэмпирика кстати тоже, но я бы не рассчитывал ни на что похожее на правду на полуэмпирике с металлическими кластерами. Как вы это намерены греть - тоже загадка, больше всего смахивает на abinitio MD, но тогда это не гиперхем и гауссиан, а чтото типа Terachem или VASP, впрочем я таким не занимаюсь.

ПросвЕщать - КультпросвЕт - освЯщать

mizuchi
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Металическая связь

Сообщение mizuchi » Пн дек 11, 2017 5:37 pm

Да, развал кластеров от температуры -- это мол.динамика. Случай простой, так что можно даже без ab initio обойтись. Насчет имплементации товарищ Гесс прав: TeraChem и VASP подходят. Но если хочется чего-то со свободной лицензией, то рассмотрите CP2K и NWChem.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Металическая связь

Сообщение Shorku » Ср дек 13, 2017 1:50 am

mizuchi писал(а):
Пн дек 11, 2017 5:37 pm
Случай простой, так что можно даже без ab initio обойтись.
А как без ab initio рвать какие-либо связи? :issue:
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Металическая связь

Сообщение EvgeniX » Чт дек 14, 2017 10:40 pm

mizuchi писал(а):
Пн дек 11, 2017 5:37 pm
Да, развал кластеров от температуры -- это мол.динамика. Случай простой, так что можно даже без ab initio обойтись. Насчет имплементации товарищ Гесс прав: TeraChem и VASP подходят. Но если хочется чего-то со свободной лицензией, то рассмотрите CP2K и NWChem.
Мощно ещё использовать ПРИРОДУ!

mizuchi
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Металическая связь

Сообщение mizuchi » Пт дек 15, 2017 8:17 pm

Shorku писал(а):
Ср дек 13, 2017 1:50 am
А как без ab initio рвать какие-либо связи? :issue:
Два примера:
https://www.cp2k.org/exercises:2017_ethz_mmm:pythonmd
https://www.cp2k.org/exercises:2017_eth ... lting_2017

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Металическая связь

Сообщение Shorku » Пт дек 15, 2017 10:24 pm

mizuchi писал(а):
Пт дек 15, 2017 8:17 pm
Shorku писал(а):
Ср дек 13, 2017 1:50 am
А как без ab initio рвать какие-либо связи? :issue:
Два примера:
https://www.cp2k.org/exercises:2017_ethz_mmm:pythonmd
https://www.cp2k.org/exercises:2017_eth ... lting_2017
ну да, ну да, минус все квантовые эффекты, характерные для маленьких кластеров =)
Make quantum chemistry, not war

mizuchi
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Металическая связь

Сообщение mizuchi » Пт дек 15, 2017 10:56 pm

Shorku писал(а):
Пт дек 15, 2017 10:24 pm
ну да, ну да, минус все квантовые эффекты, характерные для маленьких кластеров =)
Сомневаюсь, что человеку, который не знает, что "металлическая" связь проявляется только в периодической структуре, нужны эти квантовые эффекты. Сергей просто хочет посмотреть, как разваливается индиевый кластер, а не тратить кучу вычислительных ресурсов на какой-нибудь там CCSD(T), дабы увидеть размерно согласованный распад.

Впрочем, если кванты нужны, никто не запрещает взять качественные GTH псевдопотенциалы и PBE функционал для того же CP2K.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 23 гостя