Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Здравствуйте, форумчане
Грубо говоря, хочу купить комплектующие для стационарного ПК, чтобы выжить максимум из gaussian Следовательно...
Хотел бы узнать ваше мнение по поводу выбора процессора, а именно AMD или Intel, какого поколения, кол-во ядер и тд (или других комплектующих) для расчетов в программе GAUSSIAN 09).
Как я знаю, процессорам на базе AMD нет равным в многоядерном режиме, а процессорам Intel - в одноядерном) Но не совсем знаю, как Gaussian использует мощности CPU. Поэтому интересно бы узнать ваше мнение, может быть кто-нибудь работал на обоих процах, сранивал их, или даже вдруг найдутся люди, которые подбирали комплектующие специально для расчетов... Интересно было бы мнение оверклокеров (нужно ли это для повседневных расчетов)..
P.S. веду расчеты геометрий хромофоров (30-40 атомов) и далее изучаю их электрические свойства методами MP2 и TD-DFT (мало ли кому интересно)
Грубо говоря, хочу купить комплектующие для стационарного ПК, чтобы выжить максимум из gaussian Следовательно...
Хотел бы узнать ваше мнение по поводу выбора процессора, а именно AMD или Intel, какого поколения, кол-во ядер и тд (или других комплектующих) для расчетов в программе GAUSSIAN 09).
Как я знаю, процессорам на базе AMD нет равным в многоядерном режиме, а процессорам Intel - в одноядерном) Но не совсем знаю, как Gaussian использует мощности CPU. Поэтому интересно бы узнать ваше мнение, может быть кто-нибудь работал на обоих процах, сранивал их, или даже вдруг найдутся люди, которые подбирали комплектующие специально для расчетов... Интересно было бы мнение оверклокеров (нужно ли это для повседневных расчетов)..
P.S. веду расчеты геометрий хромофоров (30-40 атомов) и далее изучаю их электрические свойства методами MP2 и TD-DFT (мало ли кому интересно)
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Оффтоп - а почему именно гауссиан и если гауссиан то почему именно 09?
Если лицензии нет и это не волнует то в сети есть 16ый, там какие то фишки с параллелизацией и линдой.
Если нет и это волнует - то возможно альтернативный пакет. Впрочем железо может оказаться весьма похожим.
Если лицензии нет и это не волнует то в сети есть 16ый, там какие то фишки с параллелизацией и линдой.
Если нет и это волнует - то возможно альтернативный пакет. Впрочем железо может оказаться весьма похожим.
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Если собирать рабочую машину для MP2-расчетов 30-40 атомов, включая тяжелые, на CPU, то, безотносительно используемого пакета, одни процессоры будут стоить минимум $1100, если брать два инженерника Xeon с ebay ядер на 18 каждый. Плюс куча памяти, ее Гауссиан глотает десятками гигабайт, плюс еще $600. Матплата, обвес, диски, если грубо, $600. Если бюджет меньше $2300, браться вообще не стоит.
А так рекомендации простые:
1. Идете на ebay, ищете там по запросу "Intel Xeon"
2. Из полученного списка выбираете образцы с количеством ядер от 18 и частотами от 2 ГГц, чем больше тем лучше. Поколение - Haswell (v3) или Broadwell (v4), идеальными в соотношении "цена-производительность" считаются E5-2686v3 (QS), но их хрен достанешь. Если бюджет позволяет, то E5-2699v4.
3. Заказываете пару камней, ждете. Попутно собираете по всяким Регардам остальной комп.
4. Некоторые старшие Haswell-EP умеют гнаться до 3.5 ГГц по всем ядрам. Не страшно спалить все к чертям? Охлад самый дорогой водяной? Матплата от ASUS? - вперед, мануалы в сети.
Есть еще способ получить вожделенные MP2 и TD-DFT с существенно меньшими (или большими?) затратами, просто отказавшись от CPU и продав душу (и не только)дьяволу NVIDIA.
А если монет сильно больше миллиона в деревянной валюте, а опыта нет, то пишите в л/с, соберем кластер
А так рекомендации простые:
1. Идете на ebay, ищете там по запросу "Intel Xeon"
2. Из полученного списка выбираете образцы с количеством ядер от 18 и частотами от 2 ГГц, чем больше тем лучше. Поколение - Haswell (v3) или Broadwell (v4), идеальными в соотношении "цена-производительность" считаются E5-2686v3 (QS), но их хрен достанешь. Если бюджет позволяет, то E5-2699v4.
3. Заказываете пару камней, ждете. Попутно собираете по всяким Регардам остальной комп.
4. Некоторые старшие Haswell-EP умеют гнаться до 3.5 ГГц по всем ядрам. Не страшно спалить все к чертям? Охлад самый дорогой водяной? Матплата от ASUS? - вперед, мануалы в сети.
Есть еще способ получить вожделенные MP2 и TD-DFT с существенно меньшими (или большими?) затратами, просто отказавшись от CPU и продав душу (и не только)
А если монет сильно больше миллиона в деревянной валюте, а опыта нет, то пишите в л/с, соберем кластер
-
- Сообщения: 168
- Зарегистрирован: Чт май 02, 2013 7:57 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Можно и за меньший бюджет собрать сносный комп за пол дня. Для 40 атомов вполне хватает i7 6ти или 8ми ядерные без графического ядра, кажется 5820 и 5960 модели по 3400 ггц без разгона. Не то что бы очень комфортно расчеты проводить, но за неимением лучшего и с бюджетом около 100к великодержавных вполне сносно получается. g09 под виндой не видит больше 4х ядер и 1700мб оперативки, поэтому лучше сразу g16 через ubuntu под виндой10 - минимум возни, если, конечно, нет фанатичного стремления сократить длительность расчетов аж на целых 15 минут.
Когда я подобный комп собирал пару лет назад особых требований к остальным комплектующим не было. Ну SSD m2 конечно же, скорость у них выше раз 6-7 чем у обычных, мать покрепче - я брал ASUS из TUF линейки с пассивным охлаждением (обшитую так называемой броней и с гарантией 5 лет). Никакого супер охлаждения, i7 не склонны к суициду и максимум что нужно это башенный кулер с 2мя вентиляторами. В целом, даже если на корпусе не скупиться и взять нормальный с шумоизоляцией, то обойдется системник максимум в 120к.
Хотя, стационарным ПК можно назвать и рабочую станцию под 4 или 6 процессоров, там уже один только корпус стоит около 70-90к + 6 Xeon E5-2699v4, хотя бы 128ггб оперативки, пара блоков питания и т.д. Уже кругленькая сумма получится.
Когда я подобный комп собирал пару лет назад особых требований к остальным комплектующим не было. Ну SSD m2 конечно же, скорость у них выше раз 6-7 чем у обычных, мать покрепче - я брал ASUS из TUF линейки с пассивным охлаждением (обшитую так называемой броней и с гарантией 5 лет). Никакого супер охлаждения, i7 не склонны к суициду и максимум что нужно это башенный кулер с 2мя вентиляторами. В целом, даже если на корпусе не скупиться и взять нормальный с шумоизоляцией, то обойдется системник максимум в 120к.
Хотя, стационарным ПК можно назвать и рабочую станцию под 4 или 6 процессоров, там уже один только корпус стоит около 70-90к + 6 Xeon E5-2699v4, хотя бы 128ггб оперативки, пара блоков питания и т.д. Уже кругленькая сумма получится.
-
- Сообщения: 168
- Зарегистрирован: Чт май 02, 2013 7:57 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
А по поводу "нужности" простенького стационарного компа... Он нужен. Далеко не все университеты нормально укомплектованы (как мой, например), а ходить и выпрашивать у 70ти летнего синтетика покупку рабочей станции для проведения расчетов, это все равно что бабке на рынке рассказывать про криптовалюту. И чаще всего наааамного проще и весьма продуктивно спокойненько и ни от кого не завися заниматься своим делом. Я, например, за прошлый год случайно наработал материала на 4 статьи на домашнем однопроцессорном компе.
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
just recently I have been reading an interesting article on how to build a cheap computer cluster, see https://polyfractal.com/post/4-node-ope ... e-cluster/
I do not have any serious background in computer hardware, but my limiting experience suggests that Intel would be much better for HPC. Then, I believe it is better to have fewer cores with higher frequency than the other way around: more cores with lower frequency. Many codes have some problems with parallelization. Then, you should probably think about RAM which would be the bottleneck in many applications, e.g. in case of MP2 or CCSD. Finally, SSD instead of HDD can speed up many disk-intensive calculations.
I do not have any serious background in computer hardware, but my limiting experience suggests that Intel would be much better for HPC. Then, I believe it is better to have fewer cores with higher frequency than the other way around: more cores with lower frequency. Many codes have some problems with parallelization. Then, you should probably think about RAM which would be the bottleneck in many applications, e.g. in case of MP2 or CCSD. Finally, SSD instead of HDD can speed up many disk-intensive calculations.
Кто смел тот и съел
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
ну вообще, еще хотел на firefly (нравится его подробные лог-файлы), но эта прога не считает электрические характеристики в растворителе, поэтому остановился на gaussian. Также лицензия есть на пакет schrodinger, в ягуаре тоже частенько считаю, но эта прога не считает MP2 , поэтому опять же gaussian оказывается универсальной прогой.Гесс писал(а): ↑Ср фев 07, 2018 4:41 pmОффтоп - а почему именно гауссиан и если гауссиан то почему именно 09?
Если лицензии нет и это не волнует то в сети есть 16ый, там какие то фишки с параллелизацией и линдой.
Если нет и это волнует - то возможно альтернативный пакет. Впрочем железо может оказаться весьма похожим.
Лицензия есть, конечно, и на 9 и на 16, просто 16 стоит на серваке универском, а на комп его нельзя поставить. (долгая история короче, но интересный факт, что gaussian 16 категорически отказываются продавать в РФ?? wtf ))
Что за альтернативный пакет?
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Спасибо большое за подробный и ясный ответ))mizuchi писал(а): ↑Ср фев 07, 2018 6:07 pmЕсли собирать рабочую машину для MP2-расчетов 30-40 атомов, включая тяжелые, на CPU, то, безотносительно используемого пакета, одни процессоры будут стоить минимум $1100, если брать два инженерника Xeon с ebay ядер на 18 каждый. Плюс куча памяти, ее Гауссиан глотает десятками гигабайт, плюс еще $600. Матплата, обвес, диски, если грубо, $600. Если бюджет меньше $2300, браться вообще не стоит.
А так рекомендации простые:
1. Идете на ebay, ищете там по запросу "Intel Xeon"
2. Из полученного списка выбираете образцы с количеством ядер от 18 и частотами от 2 ГГц, чем больше тем лучше. Поколение - Haswell (v3) или Broadwell (v4), идеальными в соотношении "цена-производительность" считаются E5-2686v3 (QS), но их хрен достанешь. Если бюджет позволяет, то E5-2699v4.
3. Заказываете пару камней, ждете. Попутно собираете по всяким Регардам остальной комп.
4. Некоторые старшие Haswell-EP умеют гнаться до 3.5 ГГц по всем ядрам. Не страшно спалить все к чертям? Охлад самый дорогой водяной? Матплата от ASUS? - вперед, мануалы в сети.
Есть еще способ получить вожделенные MP2 и TD-DFT с существенно меньшими (или большими?) затратами, просто отказавшись от CPU и продав душу (и не только)дьяволуNVIDIA.
А если монет сильно больше миллиона в деревянной валюте, а опыта нет, то пишите в л/с, соберем кластер
я обязательно передам Ваши "слова" научному руководителю, чтобы решили, какой бюджет можно выделить. Я, конечно, на 99,99% вряд ли они когда-нибудь будут собирать кластер за 1кк (деньги, конечно, есть, но..), но мы чуть не выиграли в этом году недавно мегагрант на 90кк С ним бы можно было спокойно выделить бюджет на собственный кластер).
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Ну если лицензия есть то собственно альтернативы непринципиальны. Из бесплатного с растворителем и мп2 - орка и вероятно гамесс. Ягуар не считает мп2? Я не работал с этим пакетом но был о нем лучшего мнения.
Ssd нужны для скретча, для хранения результатов hdd достаточно. Памяти для таких расчетов много никогда не будет. Расчетные ноды серверов где я работаю от 16 (чаще) до 40 (реже обычно это гипертпдинг) ядер.
Upd. Позырил. Шредингеровцы впаяли локализнутый мп2 вероято без канонического. Оригинально.
Ssd нужны для скретча, для хранения результатов hdd достаточно. Памяти для таких расчетов много никогда не будет. Расчетные ноды серверов где я работаю от 16 (чаще) до 40 (реже обычно это гипертпдинг) ядер.
Upd. Позырил. Шредингеровцы впаяли локализнутый мп2 вероято без канонического. Оригинально.
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Спасибо за ответ)) то есть g16 уже видит больше ядер, чем g09? 18 значит есть смысл ставить?Tonnie Fox писал(а): ↑Чт фев 08, 2018 12:48 amМожно и за меньший бюджет собрать сносный комп за пол дня. Для 40 атомов вполне хватает i7 6ти или 8ми ядерные без графического ядра, кажется 5820 и 5960 модели по 3400 ггц без разгона. Не то что бы очень комфортно расчеты проводить, но за неимением лучшего и с бюджетом около 100к великодержавных вполне сносно получается. g09 под виндой не видит больше 4х ядер и 1700мб оперативки, поэтому лучше сразу g16 через ubuntu под виндой10 - минимум возни, если, конечно, нет фанатичного стремления сократить длительность расчетов аж на целых 15 минут.
Когда я подобный комп собирал пару лет назад особых требований к остальным комплектующим не было. Ну SSD m2 конечно же, скорость у них выше раз 6-7 чем у обычных, мать покрепче - я брал ASUS из TUF линейки с пассивным охлаждением (обшитую так называемой броней и с гарантией 5 лет). Никакого супер охлаждения, i7 не склонны к суициду и максимум что нужно это башенный кулер с 2мя вентиляторами. В целом, даже если на корпусе не скупиться и взять нормальный с шумоизоляцией, то обойдется системник максимум в 120к.
Хотя, стационарным ПК можно назвать и рабочую станцию под 4 или 6 процессоров, там уже один только корпус стоит около 70-90к + 6 Xeon E5-2699v4, хотя бы 128ггб оперативки, пара блоков питания и т.д. Уже кругленькая сумма получится.
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
20 реальных видит точно и польжзупт иж.6apu_aJlu6acoB писал(а): ↑Пт фев 09, 2018 10:01 pmСпасибо за ответ)) то есть g16 уже видит больше ядер, чем g09? 18 значит есть смысл ставить?
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
ахахахаTonnie Fox писал(а): ↑Чт фев 08, 2018 1:12 amА по поводу "нужности" простенького стационарного компа... Он нужен. Далеко не все университеты нормально укомплектованы (как мой, например), а ходить и выпрашивать у 70ти летнего синтетика покупку рабочей станции для проведения расчетов, это все равно что бабке на рынке рассказывать про криптовалюту. И чаще всего наааамного проще и весьма продуктивно спокойненько и ни от кого не завися заниматься своим делом. Я, например, за прошлый год случайно наработал материала на 4 статьи на домашнем однопроцессорном компе.
ну у нас лаба состоит из синтетиков и квантовиков (благо руководитель лабы квантовик), да и статьи идут лучше по квантам, когда в наше время это главный показатель продуктивности (нам надо за этот год написать чуть более 40 статей , но если статьи будут, то денег будет вообще норм)
У нас, кстати, ввели интересную, но пугающую вещь: деньги выделяются каждый месяц в зависимости от продуктивности, то есть каждый месяц надо работать, покладая рук
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
-
- Сообщения: 168
- Зарегистрирован: Чт май 02, 2013 7:57 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
да, эта гонка за количеством убивает, когда коллектив на протяжении года 20 раз публикуется в успехах науки сызрани или какой-нибудь мурзилке только лишь ради статистики для очередного супер-управленца - бывшего охранника короля. Перестаешь понимать на кой х.... вообще всё это нужно. Но что уж поделать.
Мне кажется, Вам стоит задуматься о рабочей станции под 4-6 процев. Никто не обидится в смежном коллективе "синтетиков-квантовиков", если потратить тыщ 400-600.
Мне кажется, Вам стоит задуматься о рабочей станции под 4-6 процев. Никто не обидится в смежном коллективе "синтетиков-квантовиков", если потратить тыщ 400-600.
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Thx for interesting article)YuraM писал(а): ↑Пт фев 09, 2018 5:12 pmjust recently I have been reading an interesting article on how to build a cheap computer cluster, see https://polyfractal.com/post/4-node-ope ... e-cluster/
I do not have any serious background in computer hardware, but my limiting experience suggests that Intel would be much better for HPC. Then, I believe it is better to have fewer cores with higher frequency than the other way around: more cores with lower frequency. Many codes have some problems with parallelization. Then, you should probably think about RAM which would be the bottleneck in many applications, e.g. in case of MP2 or CCSD. Finally, SSD instead of HDD can speed up many disk-intensive calculations.
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
А можно объяснить предпоследнее предложение, что значит?Гесс писал(а): ↑Пт фев 09, 2018 9:57 pmНу если лицензия есть то собственно альтернативы непринципиальны. Из бесплатного с растворителем и мп2 - орка и вероятно гамесс. Ягуар не считает мп2? Я не работал с этим пакетом но был о нем лучшего мнения.
Ssd нужны для скретча, для хранения результатов hdd достаточно. Памяти для таких расчетов много никогда не будет. Расчетные ноды серверов где я работаю от 16 (чаще) до 40 (реже обычно это гипертпдинг) ядер.
Upd. Позырил. Шредингеровцы впаяли локализнутый мп2 вероято без канонического. Оригинально.
Я еще пока "зеленый" в квантовых расчетах((локализнутый мп2 вероято без канонического
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Шредингеровцы - команда разработки и развития ягуара.
Впаяли - заимплементировали, добавили такую функциональность.
Локализнутый - local то есть использующий локализованные както орбитали. Это счас весьма популярно, подобные методы есть в молпро, орке, кажется в psi4. Достоинство - резко возрастает скорость. Ктото на lmp2 помнится считал тысячи атомов на одной ноде (могу найти если надо). Недостатки - не используйте локализованные методы для делокализованных структур. И не только. Локализзованные методы воспроизводят какой то процент от корреляционной энергии высчитываемой каноническим методом. Сколько - зависит от критериев отсечки, системы и возможно фазы луны. В статьях авторов методов - обычно от 98 и выше. У остальных - как карта ляжет.
Обычно в код сначала вводится стандартный функционал (и я считаю что если мы говорим о постхф методах и не упираемся в каплдкластер (привет CFOUR) - то классический MP2 это первая вещь). По видимому разработчики ягуара считают иначе. Но я думаю у них есть на то причины которых я не вижу (наивно считать себя умнее корпорации чей софт коммерчески успешен долгие годы).
Впаяли - заимплементировали, добавили такую функциональность.
Локализнутый - local то есть использующий локализованные както орбитали. Это счас весьма популярно, подобные методы есть в молпро, орке, кажется в psi4. Достоинство - резко возрастает скорость. Ктото на lmp2 помнится считал тысячи атомов на одной ноде (могу найти если надо). Недостатки - не используйте локализованные методы для делокализованных структур. И не только. Локализзованные методы воспроизводят какой то процент от корреляционной энергии высчитываемой каноническим методом. Сколько - зависит от критериев отсечки, системы и возможно фазы луны. В статьях авторов методов - обычно от 98 и выше. У остальных - как карта ляжет.
Обычно в код сначала вводится стандартный функционал (и я считаю что если мы говорим о постхф методах и не упираемся в каплдкластер (привет CFOUR) - то классический MP2 это первая вещь). По видимому разработчики ягуара считают иначе. Но я думаю у них есть на то причины которых я не вижу (наивно считать себя умнее корпорации чей софт коммерчески успешен долгие годы).
- 6apu_aJlu6acoB
- Сообщения: 44
- Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
спасибо за объяснения)Гесс писал(а): ↑Сб фев 10, 2018 12:29 amШредингеровцы - команда разработки и развития ягуара.
Впаяли - заимплементировали, добавили такую функциональность.
Локализнутый - local то есть использующий локализованные както орбитали. Это счас весьма популярно, подобные методы есть в молпро, орке, кажется в psi4. Достоинство - резко возрастает скорость. Ктото на lmp2 помнится считал тысячи атомов на одной ноде (могу найти если надо). Недостатки - не используйте локализованные методы для делокализованных структур. И не только. Локализзованные методы воспроизводят какой то процент от корреляционной энергии высчитываемой каноническим методом. Сколько - зависит от критериев отсечки, системы и возможно фазы луны. В статьях авторов методов - обычно от 98 и выше. У остальных - как карта ляжет.
Обычно в код сначала вводится стандартный функционал (и я считаю что если мы говорим о постхф методах и не упираемся в каплдкластер (привет CFOUR) - то классический MP2 это первая вещь). По видимому разработчики ягуара считают иначе. Но я думаю у них есть на то причины которых я не вижу (наивно считать себя умнее корпорации чей софт коммерчески успешен долгие годы).
это да, считать их глупыми - это неправильно) и пакет у них крутой, их лог файл и лог файл gaussian - это небо и земля. Насколько в нем легко берется нужная мне информация, хотя, конечно в 16g подпилили это слегка)
А Вы в орке в основном работаете? почему не в gaussian?
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
На данный момент я использую G16 преимущественно для ДФТ, а орку для DLPNO. И вообще мне счас деньги за работу в VASP платят, а не вот это вот всё
MP2 мне требуется редко, если я буду заранее планировать SCS-MP2 или SOS-MP2 то пойду в орку, в противном случае - гауссиан.
TDDFT - в гауссиане, CAS - в орке. В принципе можно и наоборот, но так сложилось исторически.
Гауссиан пока превосходит орку в группах симметрии (но отстает скажем от молпро) и кажется несколько больший выбор континиумных моделей растворителей хотя они там изначально разные. Орка давно перебивала Гауссиан по использованию RI (в гауссиане называется DF-апроксимация) и кажется с последними релизами (16 vs 4.0.1) ситуация не изменилась. Орка лучше приспособлена к мультиреференсу хотя функционал у гауссиана типа есть. Разумеется до уровня специализированных на этом Молкаса и Файерфлая они не дотягивают. Оба кода непригодны для периодики хотя гауссиан и утверждает обратное. Относительно сходимости - есть ощущение что в среднем по больнице орка сходится медленнее, но надежнее чем гауссиан, впрочем контрпример найти думаю несложно. Специальных бенчмарков я не проводил хотя бы потому что у них весьма разные конвержеры. Канонический каплдкластер я бы делал в гауссиане, но в первую очередь потому что он начнет выигрывать при наличии симметрии, а шанс что малая система будет симметрична неплох. Ни тот ни другой код не умеют CC2, CC3, CCSDT. Ошибки гауссиана обычно легко гуглятся (есть исключения, но они весьма специфичные), ошибки орки преимущественно неинтуитивны и решаются преимущественно через их форум, благо он весьма активен.
Юзерфренлиность инпута и аутпута у них имхо весьма близка (лучи ненависти в сторону Турбомоля).
MP2 мне требуется редко, если я буду заранее планировать SCS-MP2 или SOS-MP2 то пойду в орку, в противном случае - гауссиан.
TDDFT - в гауссиане, CAS - в орке. В принципе можно и наоборот, но так сложилось исторически.
Гауссиан пока превосходит орку в группах симметрии (но отстает скажем от молпро) и кажется несколько больший выбор континиумных моделей растворителей хотя они там изначально разные. Орка давно перебивала Гауссиан по использованию RI (в гауссиане называется DF-апроксимация) и кажется с последними релизами (16 vs 4.0.1) ситуация не изменилась. Орка лучше приспособлена к мультиреференсу хотя функционал у гауссиана типа есть. Разумеется до уровня специализированных на этом Молкаса и Файерфлая они не дотягивают. Оба кода непригодны для периодики хотя гауссиан и утверждает обратное. Относительно сходимости - есть ощущение что в среднем по больнице орка сходится медленнее, но надежнее чем гауссиан, впрочем контрпример найти думаю несложно. Специальных бенчмарков я не проводил хотя бы потому что у них весьма разные конвержеры. Канонический каплдкластер я бы делал в гауссиане, но в первую очередь потому что он начнет выигрывать при наличии симметрии, а шанс что малая система будет симметрична неплох. Ни тот ни другой код не умеют CC2, CC3, CCSDT. Ошибки гауссиана обычно легко гуглятся (есть исключения, но они весьма специфичные), ошибки орки преимущественно неинтуитивны и решаются преимущественно через их форум, благо он весьма активен.
Юзерфренлиность инпута и аутпута у них имхо весьма близка (лучи ненависти в сторону Турбомоля).
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Чего тут думать: покупайте 18-ядерный Core i9, оттранслируйте g09 под AVX512 (только не так, как предлагается китайцами через "одно место") и будет Вам счастье. Все лопнут от зависти. А для MP2 советую собрать RAID из 4-х хороших дисков + 128 гб оперативной памяти.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.
Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09
Если более менее недорого то Core i7 8700K и разогнать немного.
Или AMD Ryzen 7 1800X
+ 32-64Гб DDR4 2300 -3000 Мгц
Ежели есть нормально денег то смотрим AMD Threadripper 1920X или INTEL Core i9-7940X.
Так же можно смотреть Xeon Processor E5-2690 V4
Или AMD Ryzen 7 1800X
+ 32-64Гб DDR4 2300 -3000 Мгц
Ежели есть нормально денег то смотрим AMD Threadripper 1920X или INTEL Core i9-7940X.
Так же можно смотреть Xeon Processor E5-2690 V4
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 25 гостей