Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

вопросы строения молекул и квантовой химии
ximi
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Сб фев 10, 2018 8:13 pm

Как я знаю, процессорам на базе AMD нет равным в многоядерном режиме
Это не так. i9 вполне хорош в многопотоке.

ximi
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Сб фев 10, 2018 8:19 pm

А для MP2 советую собрать RAID из 4-х хороших дисков + 128 гб оперативной памяти.
Райд не советую .... берем SSD Samsung 960 PRO 512 Гб MZ-V6P512BW M.2

У него чтение До 3500 МБ/сек запись До 2100 Мб/сек 330000 IOPS

За глаза хватает ... у самого такой стоит.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 654
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Yurii » Сб фев 10, 2018 11:02 pm

Вы, наверное, пошутили: для серьезных MP2 расчетов всего 512 Гб.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

ximi
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Вс фев 11, 2018 12:19 am

512 Гб SSD + 4 Тб HDD

Можно взять 1 Тб SSD + 10 Тб HDD

Аватара пользователя
6apu_aJlu6acoB
Сообщения: 43
Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение 6apu_aJlu6acoB » Пн фев 12, 2018 8:20 pm

Гесс писал(а):
Сб фев 10, 2018 2:58 am
На данный момент я использую G16 преимущественно для ДФТ, а орку для DLPNO. И вообще мне счас деньги за работу в VASP платят, а не вот это вот всё
MP2 мне требуется редко, если я буду заранее планировать SCS-MP2 или SOS-MP2 то пойду в орку, в противном случае - гауссиан.
TDDFT - в гауссиане, CAS - в орке. В принципе можно и наоборот, но так сложилось исторически.
Гауссиан пока превосходит орку в группах симметрии (но отстает скажем от молпро) и кажется несколько больший выбор континиумных моделей растворителей хотя они там изначально разные. Орка давно перебивала Гауссиан по использованию RI (в гауссиане называется DF-апроксимация) и кажется с последними релизами (16 vs 4.0.1) ситуация не изменилась. Орка лучше приспособлена к мультиреференсу хотя функционал у гауссиана типа есть. Разумеется до уровня специализированных на этом Молкаса и Файерфлая они не дотягивают. Оба кода непригодны для периодики хотя гауссиан и утверждает обратное. Относительно сходимости - есть ощущение что в среднем по больнице орка сходится медленнее, но надежнее чем гауссиан, впрочем контрпример найти думаю несложно. Специальных бенчмарков я не проводил хотя бы потому что у них весьма разные конвержеры. Канонический каплдкластер я бы делал в гауссиане, но в первую очередь потому что он начнет выигрывать при наличии симметрии, а шанс что малая система будет симметрична неплох. Ни тот ни другой код не умеют CC2, CC3, CCSDT. Ошибки гауссиана обычно легко гуглятся (есть исключения, но они весьма специфичные), ошибки орки преимущественно неинтуитивны и решаются преимущественно через их форум, благо он весьма активен.
Юзерфренлиность инпута и аутпута у них имхо весьма близка (лучи ненависти в сторону Турбомоля).
да уж)) :roll: видать Вы уже давно занимаетесь, я о половине этого не слышал) но раз уж я услышал от Вас про орк, то скачаю на днях, посмотрю, что да как)) еще хочу hyperchem посмотреть)

Аватара пользователя
6apu_aJlu6acoB
Сообщения: 43
Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение 6apu_aJlu6acoB » Пн фев 12, 2018 8:22 pm

Yurii писал(а):
Сб фев 10, 2018 7:42 pm
Чего тут думать: покупайте 18-ядерный Core i9, оттранслируйте g09 под AVX512 (только не так, как предлагается китайцами через "одно место") и будет Вам счастье. Все лопнут от зависти. А для MP2 советую собрать RAID из 4-х хороших дисков + 128 гб оперативной памяти.
Не совсем понимаю выражение "оттранслировать под AVX512" :dontknow: Чувствую мне пока рано до этого(

Аватара пользователя
6apu_aJlu6acoB
Сообщения: 43
Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение 6apu_aJlu6acoB » Пн фев 12, 2018 8:25 pm

ximi писал(а):
Сб фев 10, 2018 8:07 pm
Если более менее недорого то Core i7 8700K и разогнать немного.
Или AMD Ryzen 7 1800X
+ 32-64Гб DDR4 2300 -3000 Мгц

Ежели есть нормально денег то смотрим AMD Threadripper 1920X или INTEL Core i9-7940X.

Так же можно смотреть Xeon Processor E5-2690 V4
спасибо за совет)

ximi
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Пн фев 12, 2018 9:21 pm

Как вариант можно смотреть в сторону облачных сервисов.

ximi
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Пн фев 12, 2018 10:21 pm

VPS облако сам конфигурируеш сколько нужно ядер CPU сколько ОЗУ.
Можно хоть 100 ядер установить.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 11438
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Ср фев 14, 2018 3:59 pm

6apu_aJlu6acoB писал(а):
Пн фев 12, 2018 8:20 pm
да уж)) :roll: видать Вы уже давно занимаетесь, я о половине этого не слышал) но раз уж я услышал от Вас про орк, то скачаю на днях, посмотрю, что да как)) еще хочу hyperchem посмотреть)
http://chemport.ru/forum/viewtopic.php? ... 18#p592518 - 6 лет.
Гиперхем, по отзывам, "несерьезный" пакет, хотя и очень простой в освоении.

Аватара пользователя
6apu_aJlu6acoB
Сообщения: 43
Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение 6apu_aJlu6acoB » Чт фев 15, 2018 2:38 pm

хорошо) принял к сведению)

Rupreht
Сообщения: 309
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 9:34 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Rupreht » Ср мар 21, 2018 12:01 am

позвольте вклиниться в тему. А какую конфигурацию посоветуете при бюджете 150-200 тысяч рублей?
Можно что то приличное собрать?

ximi
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Ср мар 21, 2018 12:47 am

Core i7 8700K + DDR4 64 Гб (3200Мгц или выше) + 1 Tб SSD Samsung 960 PRO + 4 Tб HDD ( HGST Ultrastar 7K6000)
GeForce® GTX 1050 Ti
БП 600-800Вт.

Монитор 27-30" (IPS)

или AMD Ryzen 7 1800X

В 140 -150 Т.р. вполне можно уложиться.

Если до 200 т.р. то смотрите в сторону AMD Threadripper 1920X (для подобных задач это будет почти в 2 раза быстрее i7 8700K)

mizuchi
Сообщения: 72
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение mizuchi » Ср мар 21, 2018 6:41 pm

Rupreht писал(а):
Ср мар 21, 2018 12:01 am
позвольте вклиниться в тему. А какую конфигурацию посоветуете при бюджете 150-200 тысяч рублей?
Можно что то приличное собрать?
Под какие задачи?

Rupreht
Сообщения: 309
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 9:34 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Rupreht » Чт мар 22, 2018 2:44 pm

Тут не задачи, тут бюджет)

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 11438
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Чт мар 22, 2018 9:02 pm

Машина нацеленная на неэмпирические расчеты и на форсфилдовскую молдинамику - это две очень разные машины.

ximi
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Пт мар 23, 2018 2:06 am

Не совсем понимаю выражение "оттранслировать под AVX512
Это система команд. Разновидность векторных инструкций. Если софт их поддерживает то может серьезно ускорить вычисление.
Особенно это касается матетатики (матрицы).

Он имел ввиду компиляция из исходиков c++ с поддержкой AVX512

Последние процы их поддерживают !

Rupreht
Сообщения: 309
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 9:34 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Rupreht » Пт мар 23, 2018 1:51 pm

Гесс писал(а):
Чт мар 22, 2018 9:02 pm
Машина нацеленная на неэмпирические расчеты и на форсфилдовскую молдинамику - это две очень разные машины.

В чем принципиальная разница по машине?

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 977
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Пт мар 23, 2018 2:48 pm

Rupreht писал(а):
Пт мар 23, 2018 1:51 pm
В чем принципиальная разница по машине?
В первом случае максимально толстые (в расчете на ядро) CPU и мноооого оперативки, во втором случае уже GPU побольше и пошустрее
Мы не любим успокоительные иллюзии и сказки на ночь.Мы любим газовые атаки и механические марши железных солдат.Однажды,когда после ежедневной предательской работы на этот мир вы ляжете в свои мягкие кроватки,мы пожелаем вам страшной ночи и атомной войны.

Rupreht
Сообщения: 309
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 9:34 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Rupreht » Пт мар 23, 2018 3:43 pm

Понятно, значит основной уклон на ЦПУ.
Спасибо

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 1 гость