Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2548
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Droog_Andrey » Вс апр 07, 2019 12:10 pm

Ryzen 2700X неплохо показывает себя в G09 на 16 потоках.
2^74207281-1 is prime!

Cherep
Сообщения: 22720
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Cherep » Пт апр 12, 2019 5:34 pm

просто интересно.
в интернетах пишут, шито МЦСТшная VLIW поделка (Эльбрус-8 и потомки) хороша как "числодробилка".
Подошёл бы он для решения реальных задач квантовой химии?

ЗЫ на форуме ixbt уже больше 10 лет продолжается многосерийный эпический срач про сабж с частыми уклонами в политоту. У меня сложилось впечатление по результатам скудных тестов реальных расчётных задач, в которых требовалась оптимизация исходного кода под компилятор, что процессор не такой отсталый.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 983
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Пт апр 12, 2019 5:47 pm

Cherep писал(а):
Пт апр 12, 2019 5:34 pm
просто интересно.
в интернетах пишут, шито МЦСТшная VLIW поделка (Эльбрус-8 и потомки) хороша как "числодробилка".
Подошёл бы он для решения реальных задач квантовой химии?
а зачем, если Вас к этому, конечно, никто не принуждает?
нет, на БТРе можно ездить на дачу, но возникает очень много вопросов =)
Последний раз редактировалось Shorku Пт апр 12, 2019 5:53 pm, всего редактировалось 1 раз.
Мы не любим успокоительные иллюзии и сказки на ночь.Мы любим газовые атаки и механические марши железных солдат.Однажды,когда после ежедневной предательской работы на этот мир вы ляжете в свои мягкие кроватки,мы пожелаем вам страшной ночи и атомной войны.

Cherep
Сообщения: 22720
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Cherep » Пт апр 12, 2019 5:52 pm

Shorku писал(а):
Пт апр 12, 2019 5:47 pm
а зачем?
Отход от темы чуя я, ну да ладно. Вы (численные) эксперименты из любопытства проводите? Просто вот некоторые проводят из любопытства, чтобы познать тайны природы... А другим некоторым любопытно, как Эльбрус работает на реальных задачах. :very_shuffle:

Sartorius84
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Ср фев 26, 2014 11:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Sartorius84 » Пт апр 12, 2019 10:53 pm

Cherep писал(а):
Пт апр 12, 2019 5:34 pm
У меня сложилось впечатление по результатам скудных тестов реальных расчётных задач, в которых требовалась оптимизация исходного кода под компилятор, что процессор не такой отсталый.
Не совсем понятно, что оптимизация сорцов под компилятор может сказать о процессоре.

Да 125 Gflops пиковая на двойной это хорошо, но у МЦСТ такие цены... У вас их железо есть?

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 1553
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Сб апр 13, 2019 11:40 pm

Sartorius84 писал(а):
Пт апр 12, 2019 10:53 pm
Да 125 Gflops пиковая на двойной это хорошо, но у МЦСТ такие цены... У вас их железо есть?
его ни у кого нет и, скорее всего, никогда не будет (просто не продадут).
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Cherep
Сообщения: 22720
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Cherep » Вс апр 14, 2019 4:39 pm

Sartorius84 писал(а):
Пт апр 12, 2019 10:53 pm
Не совсем понятно, что оптимизация сорцов под компилятор может сказать о процессоре.
Как я понял, это особенность архитектуры. Во вложении файл с некоторым описанием, почему это так и примерами.
Sartorius84 писал(а):
Пт апр 12, 2019 10:53 pm
У вас их железо есть?
У меня нет, но мне простительно, я стоя под тягой и варю говна в колбахзанимаюсь тонким органическим синтезом.
bigM писал(а):
Сб апр 13, 2019 11:40 pm
его ни у кого нет и, скорее всего, никогда не будет (просто не продадут).
В институте Келдыша вполне себе смогли пощупать сабж. Не знаю, каких трудов им это стоило. :shuffle:
См аттач

Upd: файл гуглится по "эльбрус газодинамика" на

Код: Выделить всё

keldysh.ru/papers/2018/prep2018_152.pdf
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 1553
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Вс апр 14, 2019 5:19 pm

Cherep писал(а):
Вс апр 14, 2019 4:39 pm
В институте Келдыша вполне себе смогли пощупать сабж. Не знаю, каких трудов им это стоило. :shuffle:
спасибо. поработать смогли, но являются ли они их владельцем (или поюзать взяли)? а уж частному лицу и подавно не купить...
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Cherep
Сообщения: 22720
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Cherep » Вс апр 14, 2019 6:33 pm

bigM писал(а):
Вс апр 14, 2019 5:19 pm
спасибо. поработать смогли, но являются ли они их владельцем (или поюзать взяли)? а уж частному лицу и подавно не купить...
Судя по перепалке поцонов из ынтернета (пруфов не будет, искать в бурление говен на ixbt влом), частным лицам пока не продают, да и вопрос цены какбы кусается. Но еслибы я интересовался квантовохимическими рассчётами и чёто понимал в программировании, работал в бюджетной организации (к примеру на Химфаке) и умел добывать деньги, я бы сходил сюда
По вопросам приобретения продукции и заказа разработок:
адрес электронной почты: sales@mcst.ru

телефон: +7 (495) 363 96 65 доб. 239
телефон: +7 (499) 135 05 93

Код: Выделить всё

http://mcst.ru/kontakty-mcst
Где может стоять железо в "гражданском секторе"

Код: Выделить всё

https://www.altlinux.org/Ports/e2k
и ещё камент

Код: Выделить всё

http://www.sdelanounas.ru/blogs/119017/?pid=1122066#comments
и по ссылке чуть ниже оттуда

Код: Выделить всё

https://bitblaze.ru/
внизу чёто на экспорт идёт :shock:

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 1553
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Вс апр 14, 2019 7:53 pm

Cherep писал(а):
Вс апр 14, 2019 6:33 pm
внизу чёто на экспорт идёт :shock:
я вот так для работы гальванометр CT6200H искал, все предлагают, только купить нельзя, не продают..., заявку пришлите - рассмотрим...
а вы эльбрус, да на экспорт :lol: . реклама и имитация бурной деятельности
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Cherep
Сообщения: 22720
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Cherep » Вс апр 14, 2019 8:05 pm

bigM писал(а):
Вс апр 14, 2019 7:53 pm
а вы эльбрус, да на экспорт
Так это они, а не я.
bigM писал(а):
Вс апр 14, 2019 7:53 pm
:lol:
Искусство троллинга - оно простое, это мы знаем.
bigM писал(а):
Вс апр 14, 2019 7:53 pm
реклама и имитация бурной деятельности
Рубаху рвать на груди не буду, может так оно и есть, а может и нет, но я хотябы пруфы приводил. :dontknow:

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 1553
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Вс апр 14, 2019 8:25 pm

Cherep писал(а):
Вс апр 14, 2019 8:05 pm
bigM писал(а):
Вс апр 14, 2019 7:53 pm
а вы эльбрус, да на экспорт
Так это они, а не я.
да я разве про вас. за пруфы, конечно, спасибо. интересно.
да и не против я, что бы всё работало и продавалось в свободном доступе. кто-то из пиарщиков МЦСТ (горшенин или шигорин) на ютубе около 2 мес назад похвалялся, что себе добудет ноут на эльбрусе погонять, но что-то видоса об этом нет, не всё так просто, оказывается...
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Cherep
Сообщения: 22720
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Cherep » Вс апр 14, 2019 8:56 pm

Если вернутся к теме, то главный вопрос: распараллеливаются ли алгоритмы квантово-химических расчётов?
Иначе архитектура Эльбруса, как я понял, никаких преимуществ иметь не будет.

Sartorius84
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Ср фев 26, 2014 11:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Sartorius84 » Вс апр 14, 2019 8:59 pm

Странная закрытость Эльбрусов, при том, что чипы производятся тайваньской TMSC.

Sartorius84
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Ср фев 26, 2014 11:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Sartorius84 » Вс апр 14, 2019 9:08 pm

Cherep писал(а):
Вс апр 14, 2019 8:56 pm
Если вернутся к теме, то главный вопрос: распараллеливаются ли алгоритмы квантово-химических расчётов?
Иначе архитектура Эльбруса, как я понял, никаких преимуществ иметь не будет.
Да QM параллелится - http://www.unn.ru/pages/issues/aids/2006/26.pdf (глава 3). Хотя и не так хорошо как MD.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 11603
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Вс апр 14, 2019 10:00 pm

Sartorius84 писал(а):
Вс апр 14, 2019 9:08 pm
Да QM параллелится - http://www.unn.ru/pages/issues/aids/2006/26.pdf (глава 3). Хотя и не так хорошо как MD.
некоторые данные, полученные в Центре компьютерного
обеспечения химических исследований РАН (ЦКОХИ РАН) в Институте органической
химии. Они относятся к распараллеливанию на 6-процессорной мини суперЭВМ SGI
Power Challenge, оснащенной микропроцессорами R8000 с тактовой частотой 90 МГц и
главной памятью емкостью 512 Мбайт.
А это Эльбрус? Как то не впечатляет.
С другой стороны какой софт? Прирост скорости от оптимизации кода в квантах за последние 10 лет сравним с приростом скорости за счет нового железа (Это очень сильное утверждение, ссылок давать не буду).

Sartorius84
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Ср фев 26, 2014 11:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Sartorius84 » Вс апр 14, 2019 10:36 pm

Гесс писал(а):
Вс апр 14, 2019 10:00 pm
А это Эльбрус? Как то не впечатляет.
Не Это к вопросу о возможности распараллеливания QM впринципе - первое что нашлось.

Вроде годные обзоры железок Эльбрус кстати : https://www.youtube.com/channel/UC6pnRo ... MJg/videos
http://www.mcst.ru/files/58ca52/820cd8/ ... ernogo.pdf
Последний раз редактировалось Sartorius84 Вс апр 14, 2019 11:04 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 11603
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Вс апр 14, 2019 10:56 pm

Пффф.
Говорить о распараллеливании квантов можно как о масштабировании органического синтеза.

Общий ответ - кванты параллелятся, а органика масштабируется.

Какие кванты? DFT и CCSD параллелить две огромные разницы. Planewave, GAO, вейвлеты?
Какой код? Есть коды не дающие прироста уже с десятка процессоров, в то время как есть задачи которые решали параллельно на десятках тысяч ядер. В частности этим славен NWChem, Crystal, Empire.
Какая точность, одинарная, двойная, четверная. Скажем для упомянутого МД обычно одинарной точности с головой в то время как для квантов - нет. Поэтому МД считают на видеокартах а для квантов это экзотика.
Какая система - сколько базисных функций и каких? При прочих равных - там где с ростом числа ядер скорость расчета молекулы воды пройдет пик и начнет снижаться - для тысячи молекул кривая будет еще очень далека от выхода на плато.

Sartorius84
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Ср фев 26, 2014 11:22 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Sartorius84 » Вс апр 14, 2019 11:16 pm

Гесс писал(а):
Вс апр 14, 2019 10:56 pm
Пффф.
Говорить о распараллеливании квантов можно как о масштабировании органического синтеза.
Так какой вопрос, такой и ответ )
Cherep писал(а):
Вс апр 14, 2019 8:56 pm
Если вернутся к теме, то главный вопрос: распараллеливаются ли алгоритмы квантово-химических расчётов?

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 983
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Пн апр 15, 2019 1:42 am

Cherep писал(а):
Пт апр 12, 2019 5:52 pm
Отход от темы чуя я, ну да ладно. Вы (численные) эксперименты из любопытства проводите? Просто вот некоторые проводят из любопытства, чтобы познать тайны природы... А другим некоторым любопытно, как Эльбрус работает на реальных задачах. :very_shuffle:
Любопытно было бы, если бы Эльбрус хотя бы теоретически обещал обойти хоть что-то современное. На практике рабочая станция на Эльбрусе за 300 тыр имеет (теоретическую) производительность (GFlop/s), ниже, чем (измеренная) производительность рабочей станции на двух ксеонах 2010 года выпуска (с рыночной стоимостью около 30-40 тыр за всю станцию). На этом моменте (особенно после сравнения денег) все (по крайней мере мое) любопытство куда-то улетучивается. Дальше уже только любопытство уровня "а можно ли запустить гауссиан на смартфоне, холодильнике или стиральной машине".
Мы не любим успокоительные иллюзии и сказки на ночь.Мы любим газовые атаки и механические марши железных солдат.Однажды,когда после ежедневной предательской работы на этот мир вы ляжете в свои мягкие кроватки,мы пожелаем вам страшной ночи и атомной войны.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 1 гость