Помощь по функционалу omega B97X-D

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
me_s
Сообщения: 76
Зарегистрирован: Вт июн 03, 2014 4:57 pm

Помощь по функционалу omega B97X-D

Сообщение me_s » Пн фев 12, 2018 7:29 pm

Уважаемые коллеги, имеющие в распоряжении софт, поддерживающий DFT функционал omega B97X-D,
Не могли бы кто-то оказать небольшую услугу: оптимизировать и рассчитать энергию трех небольших моделей методом DFT в данном функционале в базисе 6-311G(d,p).
У меня возникла проблема в связи с тем, что open sourсe пакет nwchem не поддерживает этот функционал, реализованный в проприетарных пакетах. Я проводил расчеты методом DFT B3LYP в данном базисе комплексов олефинов и полиенов с гидропероксильным и другими радикалами. Рецензент статьи возразил против B3LYP и настоятельно рекомендовал использовать omega B97X-D. Я попробовал другие range-separated functionals, имеющиеся в открытом доступе, и не увидел серьезных отличий для моих моделей. Однако это его не убедило. Не смог бы кто-то посчитать мне для сравнения три простейших модели: OOH, CH2=CH2 и их пи-комплекс. Нужно просто оптимизировать геометрию и вычислить энергию в минимуме. Заранее благодарен. Вот геометрии в минимуме B3LYP 6-311G(d,p)

3
OOH
O 0.09176406 -0.60523093 0.00000000
O 0.01207515 0.72051566 0.00000000
H -0.83071920 -0.92222698 0.00000000

6
CH2=CH2
C 0.00000000 -0.66350286 0.00000000
C 0.00000000 0.66350286 0.00000000
H 0.92253355 -1.23462928 0.00000000
H -0.92253355 -1.23462928 0.00000000
H 0.92253355 1.23462928 0.00000000
H -0.92253355 1.23462928 0.00000000

9
CH2=CH2_OOH
O -0.23706897 -1.45636592 0.67024607
O -0.00691706 -2.10297916 -0.46765617
H -0.15905524 -0.50427953 0.44141999
C -0.57062627 1.67843063 -0.24219126
C 0.73779264 1.57579534 -0.01814023
H -1.00605078 1.41154524 -1.19951096
H -1.25332543 2.04321137 0.51815598
H 1.41887234 1.22032005 -0.78435766
H 1.17821805 1.85207123 0.93415962

ihammers
Сообщения: 15
Зарегистрирован: Пн ноя 09, 2015 8:05 pm

Re: Помощь по функционалу omega B97X-D

Сообщение ihammers » Пн фев 12, 2018 10:19 pm

Если я правильно понял, то данный функционал есть в ORCA 4.0.X.
OOH 6-311G(2d,2p) :
------------------------- ----------------
Dispersion correction -0.000013156
FINAL SINGLE POINT ENERGY -150.910230104439
------------------------- --------------------
CH2=CH2 6-311G(2d,2p):
------------------------- ----------------
Dispersion correction -0.000256546
FINAL SINGLE POINT ENERGY -78.585792559273
------------------------- --------------------

В приложении выходные файлы orca.

PS: последний в расчёте.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
me_s
Сообщения: 76
Зарегистрирован: Вт июн 03, 2014 4:57 pm

Re: Помощь по функционалу omega B97X-D

Сообщение me_s » Пн фев 12, 2018 10:48 pm

Огромное спасибо! Я получил уже в личку расчет в гауссиане. Результаты, как я и ожидал оказались близки к другим аналогичным функционалам, но нужно было это показать рецензенту.
В гауссиане энергии получились такими:
OOH -150.899139216
CH2=CH2 -78.5795263415
Комплекс -229.488799006
Еще раз благодарю!

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 32 гостя