Природа и ЭПР

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
amge
Сообщения: 1707
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Природа и ЭПР

Сообщение amge » Вт май 08, 2018 7:42 am

Прошу помощи!

Меня попросили попробовать посчитать ЭПР Природой, поскольку в ней вроде как имеется честный релятивизм и полноэлектронные базисы для тяжелых ядер. Но я полный ноль в ЭПР. Подскажите, пожалуйста, можно ли (и если да, то как) из приложенного аутпута извлечь константы СТВ и g-фактор?

Код: Выделить всё

 Electric Field Gradient Tensors:
 atom   1   N:                     eigenvalues:  -0.486386  -0.448786   0.935172
   0.935172                           axes (x):   0.000000  -0.000000   1.000000
  -0.000000  -0.470092                axes (y):   0.752765  -0.658290  -0.000000
  -0.000000  -0.018632  -0.465080     axes (z):   0.658290   0.752765  -0.000000
 atom   2   C:                     eigenvalues:  -0.071829  -0.044872   0.116701
   0.116701                           axes (x):  -0.000000  -0.000000   1.000000
   0.000000  -0.057233                axes (y):  -0.677149   0.735846   0.000000
   0.000000   0.013432  -0.059469     axes (z):   0.735846   0.677149   0.000000
 atom   3   C:                     eigenvalues:  -0.071829  -0.044872   0.116701
   0.116701                           axes (x):  -0.000000  -0.000000   1.000000
   0.000000  -0.057233                axes (y):   0.677148   0.735846   0.000000
   0.000000  -0.013432  -0.059469     axes (z):   0.735846  -0.677148   0.000000
 atom   4   N:                     eigenvalues:  -0.486386  -0.448786   0.935172
   0.935172                           axes (x):   0.000000   0.000000   1.000000
  -0.000000  -0.470092                axes (y):   0.752762   0.658293  -0.000000
   0.000000   0.018632  -0.465080     axes (z):  -0.658293   0.752762   0.000000
 atom   5  Te:                     eigenvalues:  -0.750474  -0.654201   1.404674
   1.404674                           axes (x):  -0.000000  -0.000001   1.000000
   0.000000  -0.750474                axes (y):   1.000000   0.000038   0.000000
   0.000003   0.000004  -0.654201     axes (z):  -0.000038   1.000000   0.000001
 atom   6   H:                     eigenvalues:  -0.009076  -0.005294   0.014370
  -0.005294                           axes (x):   0.000000   1.000000   0.000000
  -0.000000  -0.002169                axes (y):   0.839882   0.000000  -0.542768
   0.000000  -0.010688   0.007463     axes (z):   0.542768  -0.000000   0.839882
 atom   7   H:                     eigenvalues:  -0.009076  -0.005294   0.014370
  -0.005294                           axes (x):  -0.000000   1.000000   0.000000
   0.000000  -0.002169                axes (y):   0.839882   0.000000   0.542768
   0.000000   0.010688   0.007463     axes (z):  -0.542768  -0.000000   0.839882
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 879
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Природа и ЭПР

Сообщение Shorku » Вт май 08, 2018 6:33 pm

Если я правильно понял лог, то Вам нужна вот эта таблица:

Код: Выделить всё

 Spin Density at the Nuclei:
   1   N      0.044904
   2   C     -0.004455
   3   C     -0.004456
   4   N      0.044904
   5  Te     -0.100515
   6   H     -0.001980
   7   H     -0.001980
Отсюда Вы можете посчитать ферми-контактные составляющие констант СТВ - домножить на 4/3*pi*(Sz)^-1*ge*gN*be*bN*pN (Спин, g-фактора электрона и ядра, их же магнетоны). У Телура наверняка еще вылезает большая спин-орбита. Диполь-дипольные составляющие из этого лога вроде бы не вытащить.

В целом я бы советовал посчитать оркой.
Мы не любим успокоительные иллюзии и сказки на ночь.Мы любим газовые атаки и механические марши железных солдат.Однажды,когда после ежедневной предательской работы на этот мир вы ляжете в свои мягкие кроватки,мы пожелаем вам страшной ночи и атомной войны.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 879
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Природа и ЭПР

Сообщение Shorku » Вт май 08, 2018 6:52 pm

Ну вот я попробовал оркой с релятивистскими поправками- спросите у своих ЭПРщиков, насколько это разумные цифры.
testTeZORA_v2.txt
Поскольку с настолько тяжелыми ядрами я никогда дела не имел, я наугад поставил ключ ZORA и какой-то минимальный полноэлектронный базисный набор. Функционал - отдельная боль, поставил наугад b3lyp. По опыту работы с комплексами меди - правда лежит где-то между b3lyp и bhandhlyp, но то было давно и неправда и без релятивистских поправок.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Мы не любим успокоительные иллюзии и сказки на ночь.Мы любим газовые атаки и механические марши железных солдат.Однажды,когда после ежедневной предательской работы на этот мир вы ляжете в свои мягкие кроватки,мы пожелаем вам страшной ночи и атомной войны.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 1707
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Природа и ЭПР

Сообщение amge » Ср май 09, 2018 5:44 am

Спасибо большое за ответ и советы. Завтра буду разбираться.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 3 гостя