Взаимодействие молекул
-
- Сообщения: 193
- Зарегистрирован: Ср май 30, 2018 12:47 pm
Re: Взаимодействие молекул
Если так, подойдет?
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Взаимодействие молекул
В остальном да, расположение атомов нормальное. А вот замораживать чтолибо я не предлагал. Либо обрезать с заменой на простейгие заместители либо оптимизировать как есть. Но не замораживать!
-
- Сообщения: 193
- Зарегистрирован: Ср май 30, 2018 12:47 pm
-
- Сообщения: 193
- Зарегистрирован: Ср май 30, 2018 12:47 pm
Re: Взаимодействие молекул
Добрый вечер!
Получилось вот такое ПС, но IRC не проходит (ограничение по количеству шагов). Если использовать его в качестве основы? А то не пойму оно подходит или нет (перенос протона H12 от N9 к О10 будет ли осуществляться).
Получилось вот такое ПС, но IRC не проходит (ограничение по количеству шагов). Если использовать его в качестве основы? А то не пойму оно подходит или нет (перенос протона H12 от N9 к О10 будет ли осуществляться).
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Взаимодействие молекул
скорее всего будет. Движение H17 довольно многообещающее, азот пирамидализнется. Если в IRC нехватает шагов - их можно добавить.
Ну либо вместо IRC провести оптимизацию из смещенной геометрии в минимум.
* "oт О10 к N9"
Ну либо вместо IRC провести оптимизацию из смещенной геометрии в минимум.
* "oт О10 к N9"
-
- Сообщения: 193
- Зарегистрирован: Ср май 30, 2018 12:47 pm
Re: Взаимодействие молекул
Доброе утро! Подскажите пожалуйста по умолчанию при каких условиях происходят расчеты оптимизации в Gaussian и как они задаются в кейвордах? Спасибо!
Re: Взаимодействие молекул
Оптимизация игнорирует понятие температуры поэтому можно считать что при 0 кельвинов.
Термохимия считается по умолчанию при 298.15 кельвинах. Модифицируется http://gaussian.com/temp/
Для индивидуальных молекул понятие давления не имеет смысла.
Термохимия считается по умолчанию при 298.15 кельвинах. Модифицируется http://gaussian.com/temp/
Для индивидуальных молекул понятие давления не имеет смысла.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 52 гостя