А если меня интересует только сравнение этого барьера по амино и гидразидо группе. Или все-таки нужно брать ПС с молекулой или двумя воды (в статье эти данные присутствуют)?
P.S. Вот что получилось с геометрией ПС, что Вы дали:
А если меня интересует только сравнение этого барьера по амино и гидразидо группе. Или все-таки нужно брать ПС с молекулой или двумя воды (в статье эти данные присутствуют)?
А правильно ли составлен кейворд что-бы проверить IRC: #P B3LYP irc=(calcfc) scf=xqc?
а с ним спорить о переходных состояниях вредно, я уже один раз облажался
впринципе для начал вполне ок. не считая конечно потерянного базисаYeugen2018 писал(а): ↑Ср июл 18, 2018 10:02 amА правильно ли составлен кейворд что-бы проверить IRC: #P B3LYP irc=(calcfc) scf=xqc?
так а исходник по вашему IRC - ...С(O-)-NH2+... или индивидуальные ...С=O + NH2... ?
Понял. Буду конкретнее...Гесс писал(а): ↑Ср июл 18, 2018 11:17 amЕсли вы будете указывать между чем должны быть ваши переходные состояния - их будет проще идентифицировать. Несколько оптимистично верить что я или amge держим в голове статью которую вы воспроизводите.
Да, это переходное состояние совершенно неинтересное, оно не может находиться между какими либо интересными минимумуами.
попробывал провести #P B3LYP/Def2svp irc=(readfc), и сразу получил: You must use ReadCartesianFC, FCCards, or CalcFC with IRC
Я понимаю мне надо что-то взять из out файла?
Нет не нужно. Ваш расчет должен куда то (скорее всего в ту же папку) писать еще один файл с расгирением chk.
этот файл бинарный, то есть вы его прочитать не сможете. А гауссиан сможет. Файл хранит в себе массу информации о волновой функции, орбиталях и многом другом чего нет в аутпуте и не так часто надо. Вприницпе его можно конвертировать в fchk который уже более читабелен, но сейчас вам это не требуется.$RunGauss
%chk=Mono.chk
#p b3lyp/def2svp EmpiricalDispersion=GD3BJ Opt Freq SCF=xqc
Dissoc
0 2
6 1.343993000 -0.148970000 0.439645000
Код: Выделить всё
**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is 0.13203566D+02
**** Warning!!: The smallest alpha delta epsilon is 0.93653430D-01
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 32 гостя