Проблема с базисным набором

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Проблема с базисным набором

Сообщение AlexKsen » Пт авг 09, 2019 3:25 pm

Добрый день уважаемые форумчане. При расчете структур в Gamess столкнулся с проблемой базисного набора (с EMSL BSE).
Ошибка следующего рода: "ERROR, INPUT ATOM 13 HAS ZERO EXPONENT FOR BASIS FUNCTION TYPES ". Это ошибка наблюдается для атома бора (для молекул GluRBDPdef2TZVP и GluCBDPdef2TZVP). Хотя оптимизация другой молекулы этим же базисом проходит нормально (LysNBDPdef2TZVP). Подскажите, как решить проблему?
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Проблема с базисным набором

Сообщение Гесс » Пт авг 09, 2019 7:13 pm

А зачем у вас пустая строка в базисе бора
S 1

1 0.35762965239 1.0000000
И вообзе зачем задавать этот базис вручную, неужто в гамессе нет олдриховских базисов?

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1485
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: Проблема с базисным набором

Сообщение surius » Пт авг 09, 2019 9:33 pm

Вся проблема в том что у вас в инпут файле для GluRBDP есть лишнаяя пустая строка (строка за номером 787).
Прогамма ее интерпритирует как конец блока и соответвенно не находит нужных экспонент.
В LysNBDP такой строки нет и гамес работает как нужно.

с наилучшими пожеланиями
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1485
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: Проблема с базисным набором

Сообщение surius » Пт авг 09, 2019 9:35 pm

LOL
написал коммент ночью, а нажал отправить сейчас. Гесс все уже сказал
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: Проблема с базисным набором

Сообщение AlexKsen » Пн авг 12, 2019 9:43 am

Гесс, surius, спасибо за ответы. Подскажите, в какой программе Вы увидели пустую строку? В notepad я не могу увидеть.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Проблема с базисным набором

Сообщение Гесс » Пн авг 12, 2019 11:30 am

У меня был Notepad++ и Chemcraft, отображади оба. vi не смотрел, но думаю что будет тоже.

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: Проблема с базисным набором

Сообщение AlexKsen » Пн авг 12, 2019 3:07 pm

Действительно, в тех файлах, которые я скинул сюда есть лишняя строка.
Спасибо.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Vit Nhoc и 23 гостя