Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Пт сен 17, 2021 12:10 am

В этой теме можно выкладывать результаты тестовых рассчетов на ваших машинах. Чтобы сравнение было корректным, предлагается использовать определенный софт и инпут.
Пока попробуем
ORCA 4.2.1 (OpenMPI 2.1.6) - набирающий популярность комбайн, бесплатный, и при этом имхо проще в установке и освоении, чем гауссиан. 4.2.1 - последний релиз у предыдущей на данный момент версии орки, оптимален, на мой взгляд т.к. это условно окончательная минимально забагованная версия, и при этом весит в разы меньше, чем пятая орка.
Тестим на DFT - самый востребованный метод сейчас (хотя лично мне бы было интереснее посмотреть на DLPNO-CCSD)
Инпут (пожалуйста, не меняйте в нем ничего, кроме числа ядер, иначе это исказит сравнение):

Код: Выделить всё

! UKS b3lyp def2-tzvp tightscf grid7
%pal nprocs  end
* xyz 0 1
7        5.263365000     -0.809094000      0.301207000
6        6.573875000     -0.272788000      0.577214000
6        7.676247000     -1.298471000      0.365855000
6        9.040975000     -0.709409000      0.673148000
7       10.148432000     -1.562897000      0.289452000
6       10.248995000     -2.816903000      1.002416000
6       11.415931000     -0.834654000      0.299215000
6       11.219991000     -3.722976000      0.274540000
6       12.616201000     -1.728404000      0.596641000
7       12.479498000     -3.040776000      0.008370000
6       13.574798000     -3.784343000     -0.374628000
6       13.407266000     -5.070792000     -0.923040000
6       14.889954000     -3.303523000     -0.241151000
6       14.497437000     -5.811691000     -1.337626000
6       15.954215000     -4.072569000     -0.671221000
6       15.794150000     -5.329993000     -1.225769000
7        4.835772000     -0.973795000     -0.996077000
6        4.395529000     -1.271139000      1.257513000
6        3.654749000     -1.533350000     -0.876188000
7        3.327586000     -1.736522000      0.465013000
6        2.715758000     -1.933372000     -1.852204000
6        1.545454000     -2.496808000     -1.443497000
6        2.154252000     -2.302219000      0.878375000
6        1.256931000     -2.685894000     -0.059367000
8        4.488440000     -1.288606000      2.474129000
17      17.581746000     -3.423758000     -0.479631000
1        2.033998000     -2.399764000      1.945985000
1        0.324817000     -3.133479000      0.248767000
1        0.816928000     -2.808697000     -2.178230000
1        2.953860000     -1.780764000     -2.894034000
1        6.554111000      0.068581000      1.610272000
1        6.717863000      0.592377000     -0.068151000
1        7.466435000     -2.155921000      1.004541000
1        7.658018000     -1.645300000     -0.666511000
1        9.150192000      0.220009000      0.109847000
1        9.093457000     -0.427101000      1.740796000
1       11.542924000     -0.345204000     -0.668225000
1       11.416418000     -0.043022000      1.063859000
1       13.490643000     -1.237666000      0.182744000
1       12.779915000     -1.795333000      1.679456000
1       11.393404000     -4.624746000      0.871541000
1       10.758268000     -4.030853000     -0.666412000
1       10.539040000     -2.692732000      2.059832000
1        9.281760000     -3.312189000      1.005791000
1       15.101308000     -2.351050000      0.214305000
1       16.645962000     -5.907387000     -1.549807000
1       14.333360000     -6.792112000     -1.764807000
1       12.419211000     -5.483721000     -1.049190000
*
UPD: версия для ORCA 5.X.X (кажется, ORCA 5.0.0/openmpi-4.1.1 работает примерно с той же скоростью, что и ORCA 4.2.1/openmpi-3.1.4

Код: Выделить всё

! UKS b3lyp def2-tzvp tightscf defgrid3 nocosx nori
%pal nprocs  end
%method
AngularGrid 7
IntAcc 5.670
GridPruning OldPruning
BFCut 1e-11
WeightCut 1e-14
end
* xyz 0 1
7        5.263365000     -0.809094000      0.301207000
6        6.573875000     -0.272788000      0.577214000
6        7.676247000     -1.298471000      0.365855000
6        9.040975000     -0.709409000      0.673148000
7       10.148432000     -1.562897000      0.289452000
6       10.248995000     -2.816903000      1.002416000
6       11.415931000     -0.834654000      0.299215000
6       11.219991000     -3.722976000      0.274540000
6       12.616201000     -1.728404000      0.596641000
7       12.479498000     -3.040776000      0.008370000
6       13.574798000     -3.784343000     -0.374628000
6       13.407266000     -5.070792000     -0.923040000
6       14.889954000     -3.303523000     -0.241151000
6       14.497437000     -5.811691000     -1.337626000
6       15.954215000     -4.072569000     -0.671221000
6       15.794150000     -5.329993000     -1.225769000
7        4.835772000     -0.973795000     -0.996077000
6        4.395529000     -1.271139000      1.257513000
6        3.654749000     -1.533350000     -0.876188000
7        3.327586000     -1.736522000      0.465013000
6        2.715758000     -1.933372000     -1.852204000
6        1.545454000     -2.496808000     -1.443497000
6        2.154252000     -2.302219000      0.878375000
6        1.256931000     -2.685894000     -0.059367000
8        4.488440000     -1.288606000      2.474129000
17      17.581746000     -3.423758000     -0.479631000
1        2.033998000     -2.399764000      1.945985000
1        0.324817000     -3.133479000      0.248767000
1        0.816928000     -2.808697000     -2.178230000
1        2.953860000     -1.780764000     -2.894034000
1        6.554111000      0.068581000      1.610272000
1        6.717863000      0.592377000     -0.068151000
1        7.466435000     -2.155921000      1.004541000
1        7.658018000     -1.645300000     -0.666511000
1        9.150192000      0.220009000      0.109847000
1        9.093457000     -0.427101000      1.740796000
1       11.542924000     -0.345204000     -0.668225000
1       11.416418000     -0.043022000      1.063859000
1       13.490643000     -1.237666000      0.182744000
1       12.779915000     -1.795333000      1.679456000
1       11.393404000     -4.624746000      0.871541000
1       10.758268000     -4.030853000     -0.666412000
1       10.539040000     -2.692732000      2.059832000
1        9.281760000     -3.312189000      1.005791000
1       15.101308000     -2.351050000      0.214305000
1       16.645962000     -5.907387000     -1.549807000
1       14.333360000     -6.792112000     -1.764807000
1       12.419211000     -5.483721000     -1.049190000
*
P.S. давайте считать персональным компьютером и рабочие станции с эпиками и зенонами, и ноутбуки и вообще все, что не кластер, но используется для счета =)
P.P.S. кажется, версия openmpi тоже сильно влияет на результаты =(
Последний раз редактировалось Shorku Пн сен 20, 2021 10:18 am, всего редактировалось 6 раз.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Пт сен 17, 2021 12:57 am

Для удобства использования тут будут собираться все результаты:
спасибо endlesslake:
ORCA 4.2.1, Linux, openmpi-3.1.4, AMD Ryzen Threadripper 3970x, 32x3.7GHz, L3 128MB / 256Gb DDR4 3200/ SSD /nprocs 32: 0:05:32
?,?,?, AMD Ryzen 7 3700X 8x3.6GHz, L3 32MB /?/?/nprocs 8: - 00:19:07

спасибо YuraM:
ORCA 5.0.1, Linux, openmpi-4.1.1, Intel Core i5 10600K, 6x4.1GHz, L3 12MB / 16 Gb DDR4/ 512 SDD / nprocs 6: - 00:22:43 (4.5 GHz все ядра в Turbo boost)

ORCA 4.2.1, Linux, openmpi-2.1.6, dual Intel Xeon X5650, 12x2.7GHz/144 Gb DDR3/ATA HDD 0:32:30
ORCA 5.0.0, Linux, openmpi-4.1.1, dual Intel Xeon X5650, 12x2.7GHz/144 Gb DDR3/ATA HDD 0:29:45
ORCA 4.2.1, Linux, openmpi-2.1.6, Intel Core i9-10920x, 12x3.5GHz/128 Gb DDR4/M.2 SSD 00:18:45
ORCA 4.2.1, Linux, openmpi-3.1.4, Intel Core i9-10920x, 12x3.5GHz/128 Gb DDR4/M.2 SSD 00:14:50
ORCA 5.0.0, Linux, openmpi-4.1.1, Intel Core i9-10920x, 12x3.5GHz/128 Gb DDR4/M.2 SSD 00:14:40
Последний раз редактировалось Shorku Вт сен 21, 2021 9:51 pm, всего редактировалось 6 раз.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Пт сен 17, 2021 1:58 am

У меня OpenMPI 3.1.4 :(

Но все остальное удовлетворяет.

С исходным файлом: 0:21:53
С nprocs 24 : 0:13:51

2*XEON E5-2697 v2 12x2.7 GHz 30720 Kb/256Gb DDR3 1600MHz)/SATA HDD

Это правда ни разу не персоналный компьютер (в моем понимании), но вдруг это пригодится как альтернатива для темы про инпуты для платного гауссиана.
Последний раз редактировалось Ahha Вт сен 21, 2021 2:12 am, всего редактировалось 2 раза.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

endlesslake
Сообщения: 191
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение endlesslake » Пт сен 17, 2021 3:06 am

Ryzen 7 3700X 8x3.6 - 00:19:07

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Сб сен 18, 2021 12:01 am

Shorku писал(а):
Пт сен 17, 2021 12:10 am
давайте считать персональным компьютером и рабочие станции с эпиками и зенонами, и ноутбуки и вообще все, что не кластер
Ну коль пошла такая пьянка, вот вам еще одна точка для статистики: эта машинка покупалась исключительно как печатная плюс визуализация, но, по-видимому, какие-то несложные расчеты на ней производить можно. Ось та же - линукс, но с иксами. Все остальные софтварные параметры как в предыдущем моем посте.

Core i7-8700 6X3.2 GHz 12288 KB/8Gb DDR4 2666 MHz/SATA HDD

npocs 6: 0:30:18
nprocs 12: 0:40:58

Во время расчета память отожрана по максимуму.
Последний раз редактировалось Ahha Вт сен 21, 2021 2:47 am, всего редактировалось 1 раз.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

mizuchi
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение mizuchi » Сб сен 18, 2021 10:16 pm

Shorku писал(а):
Пт сен 17, 2021 12:10 am
ORCA 4.2.1 (OpenMPI 2.1.6)
Падажжи. ORCA 5 же вышла с полностью переработанными оптимизаторами. Сам не проверял, но говорят, что производительность сильно поднялась по сравнению с четвертой.

dycost
Сообщения: 21
Зарегистрирован: Чт мар 29, 2012 1:15 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение dycost » Вс сен 19, 2021 1:36 pm

mizuchi писал(а):
Сб сен 18, 2021 10:16 pm
говорят, что производительность сильно поднялась по сравнению с четвертой.
Есть предложение запилить аналогичный тест и для ORCA 5.

Изменения по сравнению с 4.2.1 минимальны:

Код: Выделить всё

%pal nprocs  end
! UKS b3lyp def2-tzvp tightscf defgrid3
ОС: Ubuntu 20.04, 5.4.0-84-generic
OpenMPI 4.0.3, ORCA 5.0.1
Xeon E5-2658 V3 12x2.6 GHz L3 cache 30MiB / DDR4 ECC REG 2133MHz 32Gb / HDD -- 00:10:19

Четвертой орки под рукой нет.
В понедельник еще на одной системе тест сделаю.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Вс сен 19, 2021 9:44 pm

mizuchi писал(а):
Сб сен 18, 2021 10:16 pm
Падажжи. ORCA 5 же вышла с полностью переработанными оптимизаторами. Сам не проверял, но говорят, что производительность сильно поднялась по сравнению с четвертой.
Такое себе на 5-ке пока что сравнивать - вот дочистят оттуда все баги, тогда это станет осмысленно.
Если говорить за скорость счета, то я пока не видел ни одного полноценного сравнения 4-ки и 5-ки, надо еще заморочиться приведением тех же сеток к единому знаменателю. Оптимизаторы те же, вроде, плюс они добавили TRAH, который мне, скажем, категорически не зашел.
Последний раз редактировалось Shorku Вс сен 19, 2021 9:48 pm, всего редактировалось 1 раз.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Вс сен 19, 2021 9:47 pm

dycost писал(а):
Вс сен 19, 2021 1:36 pm
Есть предложение запилить аналогичный тест и для ORCA 5.

Изменения по сравнению с 4.2.1 минимальны:

Код: Выделить всё

%pal nprocs  end
! UKS b3lyp def2-tzvp tightscf defgrid3
ОС: Ubuntu 20.04, 5.4.0-84-generic
OpenMPI 4.0.3, ORCA 5.0.1
Xeon E5-2658 V3 12x2.6 GHz L3 cache 30MiB / DDR4 ECC REG 2133MHz 32Gb / HDD -- 00:10:19

Четвертой орки под рукой нет.
В понедельник еще на одной системе тест сделаю.
Чтобы хотя бы примерно сравнивать с 4-ой версией, надо сильнее модифицировать инпут: теперь RIJCOSX является дефолтной опцией, отсюда и разница с похожей машиной в три раза =)
PS и еще defgrid3 в этом случае в полтора раза меньше, чем grid7 - это ничего не говорит о качестве самих сеток, только о возможности адекватного сравнения
Make quantum chemistry, not war

dycost
Сообщения: 21
Зарегистрирован: Чт мар 29, 2012 1:15 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение dycost » Пн сен 20, 2021 10:28 am

Про RIJCOSX не знал.
Сетку тогда руками нужно строить ибо из автогенерируемых defgrid3 это максимальная.
Т.к. четвертой под рукой нету, никто не подскажет какие параметры AngularGrid и IntAcc ORCA 4 генерит при grid7? (в оутпуте посмотреть можно)
так будет что-то такое:

Код: Выделить всё

!NoCOSX 
%method
	AngularGrid N1
	IntAcc N2
end
%scf
	AutoTRAH false
end
Хотя возможно это сведет на нет все оптимизации алгоритмов, которые в пятой орке внедрили.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Пн сен 20, 2021 10:33 am

dycost писал(а):
Пн сен 20, 2021 10:28 am
Про RIJCOSX не знал.
Сетку тогда руками нужно строить ибо из автогенерируемых defgrid3 это максимальная.
Т.к. четвертой под рукой нету, никто не подскажет какие параметры AngularGrid и IntAcc ORCA 4 генерит при grid7? (в оутпуте посмотреть можно)
так будет что-то такое:

Код: Выделить всё

!NoCOSX 
%method
	AngularGrid N1
	IntAcc N2
end
%scf
	AutoTRAH false
end
Хотя возможно это сведет на нет все оптимизации алгоритмов, которые в пятой орке внедрили.
Добавил вчера инпут для пятой орки. Сетка там не совсем такая, как grid7 получилась, но очень похоже. Вероятно, хитрые схемы с построением сетки интегрирования тоже вносят свой вклад в обещанное ускорение. Но нам сейчас интересно машины сравнивать, а на похожих настройках сетки и без RIJCOSX четвертая и пятая орка работают почти одинаково - чудес не бывает =)
Make quantum chemistry, not war

dycost
Сообщения: 21
Зарегистрирован: Чт мар 29, 2012 1:15 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение dycost » Пн сен 20, 2021 12:08 pm

Shorku писал(а):
Пн сен 20, 2021 10:33 am
Добавил вчера инпут для пятой орки
Извиняюсь, не заметил.

ОС: Ubuntu 20.04, 5.4.0-84-generic
OpenMPI 4.0.3, ORCA 5.0.1
Xeon E5-2658 V3 12x2.6 GHz L3 cache 30MiB / DDR4 ECC REG 2133MHz 32Gb / HDD -- 00:23:15

ОС: Ubuntu 20.04, 5.4.0-77-generic
OpenMPI 4.0.3, ORCA 5.0.1
2 x Xeon E5-2680 V2 10x3.6 GHz L3 cache 50MiB / DDR3 ECC REG 1066MHz 64Gb / HDD -- 00:17:17

Из чего можно заключить, что частота памяти, таки да, существенна для орки.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Пн сен 20, 2021 3:32 pm

dycost писал(а):
Пн сен 20, 2021 12:08 pm

Из чего можно заключить, что частота памяти, таки да, существенна для орки.
из этого прмера можно сделать противоположный вывод: частота памяти для DFT в орке не так уж и важна, зато ядер можно меньше, но позлее :D
хотя если сравнивать с моим тестом, то таки да, но там и камень постарше, и кэша поменьше
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4949
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение bigM » Пн сен 20, 2021 6:49 pm

dycost писал(а):
Пн сен 20, 2021 12:08 pm
Xeon E5-2658 V3 12x2.6 GHz L3 cache 30MiB / DDR4 ECC REG 2133MHz 32Gb / HDD -- 00:23:15

2 x Xeon E5-2680 V2 10x3.6 GHz L3 cache 50MiB / DDR3 ECC REG 1066MHz 64Gb / HDD -- 00:17:17
из этого можно сделать вывод, что существенно влияют L3 кэш и объём оперативки!
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Пн сен 20, 2021 7:10 pm

bigM писал(а):
Пн сен 20, 2021 6:49 pm
из этого можно сделать вывод, что существенно влияют L3 кэш и объём оперативки!
кэш вероятно, объем оперативки нет - этой задаче столько просто не надо :D
Но в целом все как обычно: меньше более злых ядер работают быстрее, чем побольше ядер поленивее. Неидеальность распараллеливания :235:
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4949
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение bigM » Пн сен 20, 2021 8:14 pm

Shorku писал(а):
Пн сен 20, 2021 7:10 pm
bigM писал(а):
Пн сен 20, 2021 6:49 pm
из этого можно сделать вывод, что существенно влияют L3 кэш и объём оперативки!
кэш вероятно, объем оперативки нет - этой задаче столько просто не надо :D
смелое заявление, но проверять мы его, конечно, не будем? вот я и прошу логи обращений к памяти показать и как swap файл используется.
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Пн сен 20, 2021 8:25 pm

bigM писал(а):
Пн сен 20, 2021 8:14 pm
смелое заявление, но проверять мы его, конечно, не будем? вот я и прошу логи обращений к памяти показать и как swap файл используется.
Выше есть пример машины со 100+ Гб оперативки, и там все медленнее. Своп у меня вообще выключен, подозреваю, что у большинства тоже.
Ест эта задача около 500 Мб на ядро, если хотите подробностей.
от частоты памяти - может, от того, как память расставили на матери - может, от количества каналов - может, но для DFT разница будет очень невелика.
P.S. у линуксов нету своп-файла, есть раздел. Использование которого нормальные админы серьезно ограничивают. Но это тема профессионального срача людей другой профессии.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4949
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение bigM » Пн сен 20, 2021 8:51 pm

по загрузке свопа можно судить о загрузке оперативки
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Shorku » Пн сен 20, 2021 9:04 pm

Числа стали теряться за флудом. Никто не будет возражать, если я буду копировать все результаты куда-нибудь в заглавный пост?
Make quantum chemistry, not war

dycost
Сообщения: 21
Зарегистрирован: Чт мар 29, 2012 1:15 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение dycost » Пн сен 20, 2021 10:43 pm

Shorku писал(а):
Пн сен 20, 2021 9:04 pm
Никто не будет возражать, если я буду копировать все результаты куда-нибудь в заглавный пост?
Никто наверное.
Что-то не то с выводами.
Смотрим: 20 ядер по 3.6 ГГц, выдают 17 минут, 12 ядер по 2.6 ГГц выдают 23 минуты.
Оперативы используется 424.3 MB (из оутпута) и там и там.
Ядра более "злые" как раз там где больше. Кеш на ядро в первом случае 50/10 = 5 MiB, во втором 30/12 = 2.5 MiB.
Прирост же всего около 35%, хотя частота выше на 38%, количество ядер на 67%.
Единственный плюс в пользу второй системы, более быстрая ОЗУ, из чего можно сделать вывод о ее существенном влиянии на результат.
по логам
первая система:

Код: Выделить всё

Total time                  ....    1024.508 sec
Sum of individual times     ....    1018.891 sec  ( 99.5%)

Fock matrix formation       ....     961.416 sec  ( 93.8%)
  XC integration            ....     139.602 sec  ( 14.5% of F)
    Basis function eval.    ....      10.112 sec  (  7.2% of XC)
    Density eval.           ....      91.791 sec  ( 65.8% of XC)
    XC-Functional eval.     ....       1.312 sec  (  0.9% of XC)
    XC-Potential eval.      ....      20.899 sec  ( 15.0% of XC)
Diagonalization             ....      22.479 sec  (  2.2%)
Density matrix formation    ....       1.435 sec  (  0.1%)
Population analysis         ....       1.865 sec  (  0.2%)
Initial guess               ....       1.867 sec  (  0.2%)
Orbital Transformation      ....       0.000 sec  (  0.0%)
Orbital Orthonormalization  ....       0.000 sec  (  0.0%)
DIIS solution               ....       9.883 sec  (  1.0%)
Grid generation             ....      19.947 sec  (  1.9%)
вторая:

Код: Выделить всё

Total time                  ....    1387.910 sec
Sum of individual times     ....    1383.378 sec  ( 99.7%)

Fock matrix formation       ....    1330.933 sec  ( 95.9%)
  XC integration            ....     113.990 sec  (  8.6% of F)
    Basis function eval.    ....      17.953 sec  ( 15.7% of XC)
    Density eval.           ....      58.683 sec  ( 51.5% of XC)
    XC-Functional eval.     ....       1.363 sec  (  1.2% of XC)
    XC-Potential eval.      ....      26.691 sec  ( 23.4% of XC)
Diagonalization             ....      18.203 sec  (  1.3%)
Density matrix formation    ....       0.583 sec  (  0.0%)
Population analysis         ....       0.894 sec  (  0.1%)
Initial guess               ....       1.966 sec  (  0.1%)
Orbital Transformation      ....       0.000 sec  (  0.0%)
Orbital Orthonormalization  ....       0.000 sec  (  0.0%)
DIIS solution               ....       6.622 sec  (  0.5%)
Grid generation             ....      24.177 sec  (  1.7%)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 13 гостей