Запуск GAMESS

[sdf]

Доброго времени суток!

Решил установить на своем ноутбуке GAMESS и посмотреть что это за зверь такой, но видимо что-то сделал не так или наоборот чего-то не сделал. Помогите плиз.

1) скачал pcgamess_linux_mpich_p4
2) распаковал в папку test
3) создал скрипт

Код: Выделить всё

#!/bin/bash
./pcg710.exe >output

4) создал файл input:

Код: Выделить всё

$CONTRL SCFTYP=RHF  RUNTYP=ENERGY  UNITS=BOHR NPRINT=9 $END
 $SYSTEM TIMLIM=600 MEMORY=300000 $END
 $BASIS  GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END
 $GUESS  GUESS=HUCKEL $END
 $DATA

CS

C  6   -2.295578700819  0.669882156020  0.000000000000         
N  7   -2.147798327207 -1.917920766191  0.000000000000
C  6    0.112241811135 -3.211271663673  0.000000000000
C  6    2.323791836429 -2.012730040786  0.000000000000
C  6    2.370550219488  0.732755402224  0.000000000000
N  7    0.000000000000  1.864138335694  0.000000000000
H  1   -0.037665032635 -5.223431147997  0.000000000000
H  1    4.083987838054 -2.986804220470  0.000000000000
H  1   -3.782182955024 -2.826642526134  0.000000000000
H  1   -0.042043482200  3.740372948988  0.000000000000
O  8   -4.307560212164  1.796974713362  0.000000000000
O  8    4.275867827771  2.028171141186  0.000000000000
 $END

после запуска скрипта создается пустой файл output. Признаков вычисления нет. Что не так? OS - Linux Ubuntu

[Yu/2]

$ должны начинаться со второй позиции. После $DATA должна быть строка с комментарием (job title), потом строка с обозначением точечной группы, затем пустая строка и только потом координаты.

А вообще, PC GAMESS все-таки должен как-то ругаться на неправильный инпут, да.

[sdf]

$ должны начинаться со второй позиции. После $DATA должна быть строка с комментарием (job title), потом строка с обозначением точечной группы, затем пустая строка и только потом координаты.

А вообще, PC GAMESS все-таки должен как-то ругаться на неправильный инпут, да.

Да, с тонкостями составления инпут файла мне конечно еще придется разбираться, но дело в том, что расчет не идет даже если брать пример из архива samples, который поставляется вместе с гамесом.

По-видимому у меня что-то с запуском исполняемого файла pcg710.exe А что в линуксе должна выдавать команда ./pcg710.exe без указания параметров и инпут файла? У меня не выдает ровным счетом ничего...

[Yu/2]

А этот pcg710.exe случайно не второй запароленный архив?

Чтобы достать PC GAMESS, нужно два пароля для двух архивов вложенных один в другой. Внешний из ISU, внутренний - от А.А. Грановского. Вы распаковали оба?

[sdf]

по-моему я распаковал только один. Спасибо, буду разбираться с архивом

[Shiver]

А этот pcg710.exe случайно не второй запароленный архив?

Чтобы достать PC GAMESS, нужно два пароля для двух архивов вложенных один в другой. Внешний из ISU, внутренний - от А.А. Грановского. Вы распаковали оба?

Пихать линуксовый pc-gamess в pcg*.exe - это издевательство над линуксом. Забавно, если его еще и под виндой распаковывать надо...
З.Ы. А судя по неудачной попытке запуска этого бинарника - так и есть! Грановского на кол!

[Yu/2]

Пихать линуксовый pc-gamess в pcg*.exe - это издевательство над линуксом.

А в чем проблема?

Забавно, если его еще и под виндой распаковывать надо...

Не надо.

З.Ы. А судя по неудачной попытке запуска этого бинарника - так и есть! Грановского на кол!

Нет, так не есть.
А инструкции по установке надо читать, да.

[Shiver]

А в чем проблема?

Ни в чем нет особенной проблемы. Просто помечать исполняемые файлы в линуксе расширением exe - совершенно ненужно и даже глупо, так как наводит на аналогии с виндой.

Не надо.

Сам не пробовал. Только предположил, что расширение exe могло означать именно это. Опять-таки - глупо было давать такое расширение, которое может привести к такой двусмысленности. exe файлы - атрибут другой операционной системы.

Нет, так не есть.
А инструкции по установке надо читать, да.

И что там за инструкции (сам-то не пробовал)? В винде аналогичный исполняемый файл надо было, помнится, запустить и набрать пароль, когда попросят. В линуксе запуск исполняемого файла, который произвел топикстартер, к такому эффекту, очевидно, не привел.

[Marxist]

Просто помечать исполняемые файлы в линуксе расширением exe - совершенно ненужно и даже глупо, так как наводит на аналогии с виндой.

Совершенно нормальная практика помечать исполнимый файл расширением executable. Ни на какие аналогии это не наводит.

[Shiver]

Совершенно нормальная практика помечать исполнимый файл расширением executable. Ни на какие аналогии это не наводит.

Может, у меня недостаточно опыта, но я в линуксе исполняемых файлов с таким расширением не видел до этого случая. Чаще всего, исполняемые файлы, которые я руками пускаю (т.е. знаю точное название файла), не имеют расширения вообще.

[sdf]

архив распаковал rar-ом. Но вот такая проблема: при запуске мсполняемого файла pcgamess выдает ошибку

p4_error: Could not gethostbyname for host laptop; may be invalid name

у меня в настройках wired connection прописано host name -- laptop, но причем тут имя хоста??? И какое оно должно быть. Кто-нибудь сталкивался с этим или такие чудеса только у меня?

[Marxist]

Может, у меня недостаточно опыта, но я в линуксе исполняемых файлов с таким расширением не видел до этого случая. Чаще всего, исполняемые файлы, которые я руками пускаю (т.е. знаю точное название файла), не имеют расширения вообще.

Это для исполняемых дистрибутивов часто применяется.

Но вот такая проблема: при запуске мсполняемого файла pcgamess выдает ошибку

Код: Выделить всё

p4_error: Could not gethostbyname for host laptop; may be invalid name

у меня в настройках wired connection прописано host name -- laptop, но причем тут имя хоста??? И какое оно должно быть. Кто-нибудь сталкивался с этим или такие чудеса только у меня?

Это распространённая ошибка мпича, в простых случаях лечится явным заданием флага machinefile, в более сложных -- гуглением и курением манов. ЕМНИП, это связано с неправильным /etc/hosts, но могу ошибаться.

[EvgeniX]

Может, у меня недостаточно опыта, но я в линуксе исполняемых файлов с таким расширением не видел до этого случая. Чаще всего, исполняемые файлы, которые я руками пускаю (т.е. знаю точное название файла), не имеют расширения вообще.

Это для исполняемых дистрибутивов часто применяется.

Да не очень то и часто, я бы даже сказал что очень редко. В основном это бывшие вантус-программисты делают.

[sdf]

ошибка пропала после того как я добавил в etc/hosts строчку с ip, который получил мой eth0. Только теперь мне непонятно: что если провайдер мне будет раздавать динамический ip мне каждый раз придется грузиться под рутом и прописывать ip руками?

[EvgeniX]

ошибка пропала после того как я добавил в etc/hosts строчку с ip, который получил мой eth0. Только теперь мне непонятно: что если провайдер мне будет раздавать динамический ip мне каждый раз придется грузиться под рутом и прописывать ip руками?

Пропиши IP 127.0.0.1 (это loopback, петлевое соединение на твой же компьютер).

[sdf]

Пропиши IP 127.0.0.1 (это loopback, петлевое соединение на твой же компьютер).

127.0.0.1 localhost -- это у меня было изначально прописано первой строчкой, но почему-то не работало

[EvgeniX]

Пропиши IP 127.0.0.1 (это loopback, петлевое соединение на твой же компьютер).

127.0.0.1 localhost -- это у меня было изначально прописано первой строчкой, но почему-то не работало

Добавь после слова localhost через пробел ещё и "laptop".