Построение молекул в программе Hyperchem

[plenochnik]

Сравнение теплот основного и возможного побочного продуктов. Если будет удобнее можно писать в аську; 433989468

[EvgeniX]

Сравнение теплот основного и возможного побочного продуктов. Если будет удобнее можно писать в аську; 433989468

Вы путаете теплоту реакции с теплотой образования.

[plenochnik]

Вот я тупица!!!!! Это же даже физхимию не надо знать, просто подумать!!! Спасибо, что заставили это сделать.

[Yu/2]

потому что я в физхимии полный ноль, и вообще хочу закончить институт и чтобы химия осталась приятным воспоминанием молодости! :D

А-ТА-ТА! :(

[plenochnik]

Подскажите еще пожалуйста, как в Hypercheme рассчитать энергию Гиббса и где выставлять температуру, чтобы не при нуле он считал?

[VTur]

По-моему, никак.

[cheb87]

Доброго времени суток:)(
Я только осваиваю квантово-химические пакеты и сейчас работаю в HyperChem
Во общем мой вопрос такой:как построить в нем нанотрубки вместе со связями.Исходники (hin) файлы я нашел.Но мне нужны нехиральные нанотрубки.Как самому или с помощью какой-то дополнительной программы или скрипта построить нанотрубки вместе со связями (я имею ввиду не просто координаты атомов)?
p/s этой мой первый пост на форуме:)

[EvgeniX]

HyperChem - зло, лучше начать с бесплатных PC GAMESS или ПРИРОДА!

[amge]

Как самому или с помощью какой-то дополнительной программы или скрипта построить нанотрубки вместе со связями (я имею ввиду не просто координаты атомов)?

Практически любой квантово-химический вьювер может зачитать координаты и сделать Save As в формат со связями (mol, etc.). Есть не-графическая программа, openbabel, которая предназначена, чтобы конвертировать между разнообразными химическими форматами.

А вообще, квантовой химии (в отличие от молекулярной механики) связи вовсе не нужны.

[Darth Vasya]

Я только осваиваю квантово-химические пакеты и сейчас работаю в HyperChem

Не сочтите за оффтоп, но осваивайте лучше на каком-нибудь другом софте. Каждый раз, когда вы пользуетесь гиперкемом или гау$$ианом, Бог убивает котёнка (инфа 100%).

По сабжу - конвертировать бабелем в pdb и открывать в ГК. Только учтите, что у вас связи будут однократные, а не ароматические - для ММ это важно.

[Mikkloud]

а для чего нужна функция ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ ОПТИМИЗАЦИИ ?

заранее благодарен и извиняюсь за глупый вопос

[EvgeniX]

Книжки надо умные читать, а не в моделирование играть.
Сначала теория - потом расчёт.

[Mikkloud]

в какой размерности Гиперхем строит графики энергии при расчетах молекулярной динамике, или где это можно посматреть????

[YuraM]

Подскажите еще пожалуйста, как в Hypercheme рассчитать энергию Гиббса и где выставлять температуру, чтобы не при нуле он считал?

Если знаете декартовы коордтнаты системы, и гармонические частоты колебаний (а Вы их знаете, так как наверное оптимизировали свои молекулы), то очень просто по формулам стат термодинамики можно расчитать термодинамические поправки (в т.ч для Gibbs free energy) для любой адекватной температуры.