Ghemical. Оптимизация геометрии. Немеряная энергия.

[Cherep]

Я вообще не физхимик.

Молекула - енамин с N-арил
Собственно, в setup выбираю MOPAC/PM3
Потом выбираю "оптимизацию геометрии"
Машина считает. Вроде и геометрия недурная.
Только энергия сотни тысяч кДж.
Это имеет какое-либо отношение к реальности?
Как с этим бороться?

Да, там ещё нужно указать какое-то толи спиновое число для молекулы, толи чёто такое. Радикалов там нет. Ставил 0 и 1. Однофигственно.

[Marxist]

Кривой мопак? Что на более простых молекулах показывает?
Ещё можно попробовать OpenMopac и сравнить

[VTur]

Это наверно полная электронно-ядерная энергия (TOTAL ENERGY)

[pokoleg]

Это наверно полная электронно-ядерная энергия (TOTAL ENERGY)

Угу. А что Вы хотели с помощью расчёта узнать? Энергии, даваемые расчётом, полезны только при сравнении с другими себе подобными.

[Cherep]

То есть это не энтальпия образования?
Гы, тогда ОК.
Да собственно просто хотел посмотреть как эта молекула в пространстве выглядит.

[EvgeniX]

То есть это не энтальпия образования?

Это полная энергия всех взаимодействий в молекуле, за исключением внутриядерных
(за 0 принимается бесконечное разнесение ядра и всех электронов между собой).
И естественно значение будет всегда иметь знак "-" и большое число.

Гы, тогда ОК.
Да собственно просто хотел посмотреть как эта молекула в пространстве выглядит.

[EvgeniX]

Пример для C60:

---------------------- arc-файл ----------------------

SUMMARY OF PM3 CALCULATION

MOPAC2007 (Version: 8.211W)
Sun Dec 21 17:59:18 2008
No. of days left = 294

Empirical Formula: C60 = 60 atoms

PM3 charge=0 singlet
Fullerene (C60)

GEOMETRY OPTIMISED USING EIGENVECTOR FOLLOWING (EF).
SCF FIELD WAS ACHIEVED

HEAT OF FORMATION = 811.03069 KCAL = 3393.35241 KJ
TOTAL ENERGY = -7083.25524 EV
ELECTRONIC ENERGY = -100183.52102 EV
CORE-CORE REPULSION = 93100.26578 EV
DIPOLE = 0.00050 DEBYE POINT GROUP: Ih
NO. OF FILLED LEVELS = 120
IONIZATION POTENTIAL = 9.481892 EV
HOMO LUMO ENERGIES (EV) = -9.482 -2.887
MOLECULAR WEIGHT = 720.660
COSMO AREA = 405.61 SQUARE ANGSTROMS
COSMO VOLUME = 627.31 CUBIC ANGSTROMS

... остальное ...
---------------------- arc-конец ----------------------

Основной вывод:
---------------------- mop-файл ----------------------
... начало ...

FINAL HEAT OF FORMATION = 811.03069 KCAL = 3393.35241 KJ

TOTAL ENERGY = -7083.25524 EV
ELECTRONIC ENERGY = -100183.52102 EV POINT GROUP: Ih
CORE-CORE REPULSION = 93100.26578 EV
COSMO AREA = 405.61 SQUARE ANGSTROMS
COSMO VOLUME = 627.31 CUBIC ANGSTROMS

IONIZATION POTENTIAL = 9.48189
NO. OF FILLED LEVELS = 120
MOLECULAR WEIGHT = 720.660
... остальное ...
---------------------- mop-конец ----------------------

Вроде значения более-менее (правда dHf,эксп.,газ. там всё-же 2502.0 kJ/mol).

[Cherep]

Спасибо за пояснения