Gaussian 03W: "writwa"

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Droog_Andrey » Сб дек 12, 2009 7:59 pm

При расчётах, требующих большой (т.е. заставляющий использовать подкачку) объём памяти, Гауссиан иногда вылетает, оставляя в .out-файле вместо сообщения об ошибке странную строку:

writwa

Это ошибка записи в память, связанная с глюками винды по поводу распределения страниц памяти, или это что-то другое? Как этого можно было бы избежать?
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение EvgeniX » Сб дек 12, 2009 8:05 pm

"Gaussian 03W" эта версия славится своими глюками.
Способ? Нужно использовать "Gaussian 03".

alxyppv
Сообщения: 560
Зарегистрирован: Сб апр 07, 2007 11:23 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение alxyppv » Сб дек 12, 2009 8:34 pm

Вы уверены что гауссиановский scratch-файл в этих расчетах меньше 2 Гб? Если больше, то Gaussian будет вылетать при попытке записи этого файла. Чтобы этого не было, надо во входном файле указывать, что scratch-файл надо разбивать на кусочки.
Последний раз редактировалось alxyppv Вс дек 13, 2009 5:14 am, всего редактировалось 1 раз.
А.П.

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение EvgeniX » Сб дек 12, 2009 8:39 pm

alxyppv писал(а):Вы уверены что гауссиановский scrtach-файл в этих расчетах меньше 2 Гб? Если больше, то Gaussian будет вылетать пир попытке записи этого файла. Чтобы этого не было, надо во входном файле указывать, что scrtach-файл надо разбивать на кусочки.
Можно так попробовать:
%rwf=c:\temp\1.rwf,2000MB,c:\temp\2.rwf,2000MB,c:\temp\3.rwf,2000MB,c:\temp\4.rwf,-1

Только в Windows есть ограничение на длину этой строки (вместе с другими параметрами длина не должна превышать 255 символов).

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение VTur » Сб дек 12, 2009 10:04 pm

Droog_Andrey писал(а):При расчётах, требующих большой (т.е. заставляющий использовать подкачку) объём памяти, Гауссиан иногда вылетает, оставляя в .out-файле вместо сообщения об ошибке странную строку:

writwa

Это ошибка записи в память, связанная с глюками винды по поводу распределения страниц памяти, или это что-то другое? Как этого можно было бы избежать?
Часто это ошибка оперативки, куда всё не поместилось, например, при MP2.
Избежать можно распараллелив расчет.
После отстоя требуйте долива

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение VTur » Сб дек 12, 2009 10:06 pm

EvgeniX писал(а):Можно так попробовать:
%rwf=c:\temp\1.rwf,2000MB,c:\temp\2.rwf,2000MB,c:\temp\3.rwf,2000MB,c:\temp\4.rwf,-1
Лучше так
%rwf=L1,1800MB,L2,1800MB,L3,1800MB,L4,1800MB,L5,1800MB и т.д.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Droog_Andrey » Вс дек 13, 2009 12:20 pm

Scratch-файл у меня при этом больше, чем 2 GB. Но файловая система NTFS такие файлы поддерживает, и проблем с большими файлами никогда не было.

Впрочем, попробую разбить.
2^74207281-1 is prime!

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение VTur » Вс дек 13, 2009 3:30 pm

Droog_Andrey писал(а):Scratch-файл у меня при этом больше, чем 2 GB. Но файловая система NTFS такие файлы поддерживает, и проблем с большими файлами никогда не было.
Виндюк не поддерживает. Ифайл подкачки не поможет.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Droog_Andrey » Вс дек 13, 2009 5:18 pm

Винда прекрасно работает с большими файлами. По-видимому, в Гауссиане просто используется 4-байтная, а не 8-байтная переменная для указания смещения от начала файла.

Подкачка к rwf-файлу не имеет никакого отношения.
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Yurii » Вс дек 13, 2009 6:03 pm

Droog_Andrey писал(а):Винда прекрасно работает с большими файлами.
Да, в последних версиях разбивать ничего не нужно. Но... У вас FAT32 или NTFS? Судя по вашим предыдущим замечаниям, у вас комп древний.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Droog_Andrey » Вс дек 13, 2009 6:51 pm

Судя по моим постам в этой теме, у меня на этом диске NTFS. :)

Впрочем, поставил разбиение, пока вроде работает :up:
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение EvgeniX » Вс дек 13, 2009 8:04 pm

Droog_Andrey писал(а):По-видимому, в Гауссиане просто используется 4-байтная, а не 8-байтная переменная для указания смещения от начала файла.
Не по-видимому, а точно. Файлы больше ~2ГБ 32-битная версия гауссиана не поддерживает (что в Windows, что в Linux), а 64-битная версия поддерживает.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Yurii » Вс дек 13, 2009 9:41 pm

EvgeniX писал(а): Файлы больше ~2ГБ 32-битная версия гауссиана не поддерживает
Последние версии поддерживают.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение EvgeniX » Вс дек 13, 2009 9:56 pm

Yurii писал(а):
EvgeniX писал(а): Файлы больше ~2ГБ 32-битная версия гауссиана не поддерживает
Последние версии поддерживают.
Gaussian 09?

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Yurii » Вс дек 13, 2009 10:09 pm

EvgeniX писал(а):
Yurii писал(а):
EvgeniX писал(а): Файлы больше ~2ГБ 32-битная версия гауссиана не поддерживает
Последние версии поддерживают.
Gaussian 09?
Например, E01: -#- MaxDisk=16GB
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение EvgeniX » Вс дек 13, 2009 11:38 pm

Yurii писал(а):Например, E01: -#- MaxDisk=16GB
у вас есть Gaussian 03 Rev.E01 32-битный?

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Yurii » Вс дек 13, 2009 11:43 pm

EvgeniX писал(а):
Yurii писал(а):Например, E01: -#- MaxDisk=16GB
у вас есть Gaussian 03 Rev.E01 32-битный?
Ответ в личке.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение Droog_Andrey » Вс дек 13, 2009 11:59 pm

У меня, кстати, есть.

Появился лишний повод поставить :D
2^74207281-1 is prime!

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение VTur » Пн дек 14, 2009 8:03 pm

EvgeniX писал(а):
Yurii писал(а):Например, E01: -#- MaxDisk=16GB
у вас есть Gaussian 03 Rev.E01 32-битный?
Gaussian 03 Rev.E01 или Gaussian 03 W Rev.E01?
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Gaussian 03W: "writwa"

Сообщение EvgeniX » Пн дек 14, 2009 9:31 pm

VTur писал(а):
EvgeniX писал(а):
Yurii писал(а):Например, E01: -#- MaxDisk=16GB
у вас есть Gaussian 03 Rev.E01 32-битный?
Gaussian 03 Rev.E01 или Gaussian 03 W Rev.E01?
Конечно, имел в виду Gaussian 03 W Rev.E01, но оно оказывается на торрентсе есть.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 20 гостей