Как работать в Hyperchem

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
Jekson2007
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Вт дек 08, 2009 3:18 pm

Как работать в Hyperchem

Сообщение Jekson2007 » Сб янв 16, 2010 5:16 pm

Подскажите как в Hyperchem спрогнозировать возможность взаимодействия двух молекул. Спасибо!!!

Marxist

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Marxist » Сб янв 16, 2010 5:24 pm

При сближении две молекулы обязательно будут взаимодействовать

Аватара пользователя
Jekson2007
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Вт дек 08, 2009 3:18 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Jekson2007 » Сб янв 16, 2010 5:26 pm

Marxist писал(а):При сближении две молекулы обязательно будут взаимодействовать
Я понимаю, поэтому и спрашиваю как в Hyperchem это можно сделать.

Marxist

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Marxist » Сб янв 16, 2010 6:10 pm

Для того, чтобы это сказать, гиперкем не нужен. Сформулируйте задачу чётко

Аватара пользователя
Jekson2007
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Вт дек 08, 2009 3:18 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Jekson2007 » Сб янв 16, 2010 6:21 pm

Marxist писал(а):Для того, чтобы это сказать, гиперкем не нужен. Сформулируйте задачу чётко
Необходимы расчеты силы действующие на атомы двух разных молекул, тобиш силы которые зависит от длины связей, углов связи и т. д. и т.п.

fullerene
Сообщения: 46
Зарегистрирован: Ср сен 10, 2008 9:35 am
Контактная информация:

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение fullerene » Сб янв 16, 2010 6:29 pm

Jekson2007 писал(а):
Marxist писал(а):Для того, чтобы это сказать, гиперкем не нужен. Сформулируйте задачу чётко
Необходимы расчеты силы действующие на атомы двух разных молекул, тобиш силы которые зависит от длины связей, углов связи и т. д. и т.п.
Заходите в меню, находите там таблицу Мендеелева и рисуете свои молекулы, потом через меню с правой стороны делаете Single Point Сalculation понравившимся методом.

Аватара пользователя
Jekson2007
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Вт дек 08, 2009 3:18 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Jekson2007 » Сб янв 16, 2010 6:55 pm

fullerene писал(а):
Заходите в меню, находите там таблицу Мендеелева и рисуете свои молекулы, потом через меню с правой стороны делаете Single Point Сalculation понравившимся методом.
Нарисовал две молекулы (наугад), выделил их и дальше что-то ничего не пойму

Аватара пользователя
propellane
Сообщения: 253
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 5:23 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение propellane » Сб янв 16, 2010 11:38 pm

В мануале все есть, вот небольшой транслит оттуда в виде уроков

P.S. Гипер в топку, юзайте природу или/и FireFly
Не верьте в чудеса — прямо полагайтесь на них....

fullerene
Сообщения: 46
Зарегистрирован: Ср сен 10, 2008 9:35 am
Контактная информация:

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение fullerene » Вс янв 17, 2010 1:57 am

Jekson2007 писал(а): Нарисовал две молекулы (наугад), выделил их и дальше что-то ничего не пойму
Выделять, насколько я помню, не нужно. Вверху ближе к правому краю есть меню Compute, там сначала, видимо, Geometry Optimization, потом Single Point. Дальше вычисляйте энергию образования комплекса, если я правильно понимаю Вашу задачу.
Гипер в топку, юзайте природу или/и FireFly
Раз хочет Гипер - значит, пусть будет Гипер. :D

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение VTur » Вс янв 17, 2010 1:03 pm

Jekson2007 писал(а):Нарисовал две молекулы (наугад), выделил их и дальше что-то ничего не пойму
File->Start_log (файл_нейм)
Setup->ab initio или Density Functional, или что понравиться (выбор)
Compute->Geometry Optimization
File->Stop_log
Читаем файл (файл_нейм) из директории. Всё.

Только работает хуже и медленнее, чем гауссиан или файэфлай.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Jekson2007
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Вт дек 08, 2009 3:18 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Jekson2007 » Вс янв 17, 2010 11:08 pm

VTur писал(а):
Jekson2007 писал(а):Нарисовал две молекулы (наугад), выделил их и дальше что-то ничего не пойму
File->Start_log (файл_нейм)
Setup->ab initio или Density Functional, или что понравиться (выбор)
Compute->Geometry Optimization
File->Stop_log
Читаем файл (файл_нейм) из директории. Всё.

Только работает хуже и медленнее, чем гауссиан или файэфлай.
Спасибо!!!

Mikkloud
Сообщения: 5
Зарегистрирован: Чт июн 03, 2010 2:39 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Mikkloud » Чт июн 03, 2010 2:44 pm

в какой размерности Гиперхем строит графики энергии при расчетах молекулярной динамике, или где это можно посматреть????
Последний раз редактировалось Mikkloud Ср июн 16, 2010 12:44 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
pomogblin
Сообщения: 235
Зарегистрирован: Чт янв 22, 2009 10:40 am

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение pomogblin » Пт июн 04, 2010 1:17 pm

находите мануал и изучаете

Mikkloud
Сообщения: 5
Зарегистрирован: Чт июн 03, 2010 2:39 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Mikkloud » Сб июн 05, 2010 1:57 pm

в какой размерности Гиперхем строит графики энергии при расчетах молекулярной динамике, или где это можно посматреть????
Последний раз редактировалось Mikkloud Ср июн 16, 2010 12:43 pm, всего редактировалось 2 раза.

Mikkloud
Сообщения: 5
Зарегистрирован: Чт июн 03, 2010 2:39 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Mikkloud » Сб июн 05, 2010 2:30 pm

в какой размерности Гиперхем строит графики энергии при расчетах молекулярной динамике, или где это можно посматреть????

alexksu
Сообщения: 1
Зарегистрирован: Ср окт 20, 2010 7:42 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение alexksu » Ср окт 20, 2010 7:47 pm

Здравствуйте, нужна ваша помшь!
Как при помощи HyperChem посчитать энергию молекулы?

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение EvgeniX » Ср окт 20, 2010 8:10 pm

В HyperChem этого лучше не делать, ибо это очень плохая программа.

Elena
Сообщения: 77
Зарегистрирован: Вс ноя 01, 2009 6:19 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Elena » Пт ноя 19, 2010 10:26 pm

Доброго времени суток!
Подскажите, пожалуйста, что не так?
Я строю молекулу, оптимизирую ее геометрию. Затем мне нужен электростатический потенциал, я его выбираю, но программа выдает, что все атомы в молекуле (нитробензол) несут положительный заряд %-)

С помощью какого базиса, метода или другой программы лучше исследовать возможность образования комплексов?

Marxist

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Marxist » Пт ноя 19, 2010 10:43 pm

Elena писал(а):Я строю молекулу, оптимизирую ее геометрию. Затем мне нужен электростатический потенциал, я его выбираю, но программа выдает, что все атомы в молекуле (нитробензол) несут положительный заряд %-)
Чем заряды считаете?

Elena
Сообщения: 77
Зарегистрирован: Вс ноя 01, 2009 6:19 pm

Re: Как работать в Hyperchem

Сообщение Elena » Пт ноя 19, 2010 10:47 pm

Все рассчеты в ММ+

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 19 гостей