Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение etzell » Вт окт 05, 2010 5:35 pm

Хотелось узнать теги оптимизации и вычисления колебательных частот. Полную энергию научился считать)) но что-то по мануалу набираю комманды не действует))

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 164
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение Lantano » Ср окт 06, 2010 1:09 am

Скопировал из своего input файла. Может поможет.

gthresh, optgrad=1.d-5;
optg
put,xyz,PhCHO-T1_min.xyz;
{frequencies
print,hessian
save,hessian=5300.2,freq=5400.2,task=5500.2}
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение etzell » Ср окт 06, 2010 8:33 pm

Увы, не нравится ему все, что находится после optg. Выдает ошибку. Считаю на кластере.

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 164
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение Lantano » Ср окт 06, 2010 9:37 pm

А каким методом решается электронная задача? Может быть для него Molpro не умеет оптимизировать геометрию?
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение etzell » Чт окт 07, 2010 7:58 am

После задания геометрии в декартовых координатах
memory, 350, m
symmetry, x,y
geometry={angstroms
.................
}
basis=6-31G
rks, b3lyp
optg

вот примерно так.

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение etzell » Пт окт 08, 2010 3:12 pm

Что здесь неверно?) вообще-то вначале я бы хотел геометрию оптимизировать и получить результат в декартовых координатах.

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение etzell » Вт окт 12, 2010 7:00 pm

После ввода геометрии я набираю
rks, b3lyp
optg, savexyz=tetra.xyz

у меня идет расчет, в out-файле выходит такая запись
long output writtent to logfile molpro.log..
geometry written to plack 1 of recorf 70 и указана директория.
Я не могу найти кординаты оптимизированной структуры по указанным адресам. Что здесь не так? И вообще,может кто пользовался этими пакетами даст input-файл для оптимизации геометрии, расчет колебательных частот и возбужденных состояний?)

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 164
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение Lantano » Чт окт 14, 2010 12:25 am

Если хотите геометрию, а желание сиё вполне естественно, то вставьте в input файле на том этапе расчета, где она Вам нужна (например, после задания оптимизации):
put,xyz,ИМЯ_ФАЙЛА.xyz;
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение etzell » Чт окт 14, 2010 6:35 pm

Хорошо, спасибо попролую. А как написать теги, чтобы получить отдельный файл с вычисленныи частотами (нормальные и основными колебательными) и фал - с полученными возбужденными состояниями?) Был бы очень признателен.

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Molpro- есть ли кто пользовался данным пакетом?

Сообщение etzell » Пт окт 15, 2010 7:13 am

увы, мне снова выдали тоже самое, что было и раньше. Никакого файла я не нашел, в котором хотел сохранить геометрию. ) Может там нужно прописывать полный путь в директории?

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 4 гостя