расчёты для порфиринов

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: расчёты для порфиринов

Сообщение Любитель_Манниха » Пн окт 02, 2017 9:00 pm

Гесс писал(а):
Пн окт 02, 2017 8:55 pm
Если в природе есть включаемые поправки гримме на ДФТ
Нет и не будет, аффтар сказал.

В конце концов будет Орка, скорее всего.
Но хотелось бы, конечно, предварительно задействовать Природу.
Вот пока вопрос, почему с цинком вот так (аут выложу чуть позже), а со ртутью вот эдак :roll:
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: расчёты для порфиринов

Сообщение Гесс » Пн окт 02, 2017 9:28 pm

потому что ртуть заранее чувствует что свою толстую жопу она туда не впихнет, + по принципу ЖМКО она мягонько пытается прильнуть.
Ну а то что несимметрично относительно крауна - видимо жесткие кислороды крауна ее впечатляет меньше чем перспектива удобно улечься на
сопряженной порфириновой подушечке.

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: расчёты для порфиринов

Сообщение Любитель_Манниха » Пн окт 02, 2017 9:31 pm

Гесс писал(а):
Пн окт 02, 2017 9:28 pm
Ну а то что несимметрично относительно крауна - видимо жесткие кислороды крауна ее впечатляет меньше чем перспектива удобно улечься на
сопряженной порфириновой подушечке.
Так она несимметрично относительно азотов тоже же.
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: расчёты для порфиринов

Сообщение Любитель_Манниха » Чт окт 12, 2017 2:34 am

Вот понапихал немного воды и внезапно ртуть прикоординировалась к азоту. К одному :lol:
Базис тот же, basis4/L2.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: расчёты для порфиринов

Сообщение Любитель_Манниха » Чт окт 12, 2017 2:40 am

Гесс писал(а):
Вс окт 01, 2017 4:05 pm
можно попробовать заигнорить CI вообще и постараться отбиться ECP78MWB псевдопотенциальным базисом который квазирелятивистный и в который вогнано максимум электронов в собственно псевдопотенциал. Дешево и сердито.
Вот тут

Код: Выделить всё

Angew. Chem. Int. Ed.2011, 50, 1560 –1564
считали геометрию комплекса [порфирин(с пришитыми карбоксилатами)-две ртути-(DMSO)n] B88P86/SDD, и якобы слабо отличается от рентгена, насколько это недёшево?
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: расчёты для порфиринов

Сообщение Гесс » Чт окт 12, 2017 8:22 am

Любитель_Манниха писал(а):
Чт окт 12, 2017 2:40 am
B88P86/SDD, и якобы слабо отличается от рентгена, насколько это недёшево?
:lol:

SDD это общее наименование Штутгарт-Дредзеновских базисов. То что они псевдопотенциальные намекается фразой в суппортинге Gradient‐corrected calculations were performed using the Becke exchange3 and Perdew correlation4 (B88P86). Stuttgart/Dresden effective core potentials (SDD) were employed for all atoms.5 Вот тут http://gaussian.com/pseudo/ есть табличка рассказывающая о том сколько электронов засовывается в псевдопотенциал. Для ртути 2 варианта ECP60MWB и ECP78MWB, в первом случае в потенциал прячут 60 электронов а во втором 78. Пренебрегая в нулевом приближении стоимостью псевдопотенциала мы приходим к выводу что стоимость расчета атома ртути сравнима со стоимостью расчета атома Be-F или Mg-Cl. Так что вопрос исключительно о том умеет ли природа псевдопотенциалы.

Касательно B88P86 если я ничего не путаю это обычный BP86 - дешевый чистоГГА (негибридный) функционал. Люблю, ценю, везде есть.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 34 гостя