Сравнительный анализ квантохимического софта

вопросы строения молекул и квантовой химии
VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение VTur » Вс июн 12, 2011 6:48 pm

Я думаю, что в ЯМР в этих программах заложена параметризация. А то эффект слишком тонкий, нужна огромная сетка.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Yurii » Вс июн 12, 2011 6:52 pm

Cherep писал(а):
Yurii писал(а):2. Считал давно химсдвиги и получал часто лажу. Гауссиан 98 давал приемлемый результат.
вобщем, одни слова, штоле :wink:
Да нет: дочь на 2 или 3 курсе универа что то там писала (уже забыл, как называется). Начинали с PC GAMESS и пришлось переходить на gaussian 98. Деталей уже воспроизвести не могу.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

АлександрI
Сообщения: 378
Зарегистрирован: Ср мар 23, 2011 5:09 pm

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение АлександрI » Вс июн 12, 2011 8:53 pm

Yurii писал(а):Тогда для начала: http://software.intel.com/en-us/forums/ ... hp?t=77331
Спасибо, но для меня это не начало, а концовка моего намерения решить поставленную проблему... :dontknow:
VTur писал(а):В ГАМЕССе в STATPT была опция STPT и STSTEP. Немного подергать ядра в разные стороны на предмет уменьшения энергии.
Спасибо, но мы это уже проходили на форуме. Следуя советам, я, чтобы выскочить из локального минимума, ставил гессиан из предыдущего расчёта, получал сообщения о локальных квадратурах и, в конце концов, геометрия долго и нудно скатывалась обратно... А названные Вами опции дадут размах или амплитуду анализа близлежащей части PES. А я спрашивал (неужели есть такая возможность?): как заранее узнать, что частота "должна быть вещественная" БЕЗ РАСЧЁТА ГЕССИАНА ?
Я думал, что Юрий ЭТО имел в виду, и в результате я сел в лужу :oops:

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение VTur » Вс июн 12, 2011 9:37 pm

АлександрI писал(а):
VTur писал(а):В ГАМЕССе в STATPT была опция STPT и STSTEP. Немного подергать ядра в разные стороны на предмет уменьшения энергии.
Спасибо, но мы это уже проходили на форуме. Следуя советам, я, чтобы выскочить из локального минимума, ставил гессиан из предыдущего расчёта, получал сообщения о локальных квадратурах и, в конце концов, геометрия долго и нудно скатывалась обратно... А названные Вами опции дадут размах или амплитуду анализа близлежащей части PES. А я спрашивал (неужели есть такая возможность?): как заранее узнать, что частота "должна быть вещественная" БЕЗ РАСЧЁТА ГЕССИАНА ?
Я думал, что Юрий ЭТО имел в виду, и в результате я сел в лужу :oops:
Ядра будите дергать не Вы, а ГАМЕСС.

Можно, построив ППЭ.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Yurii » Вс июн 12, 2011 10:24 pm

АлександрI писал(а):
Yurii писал(а):Тогда для начала: http://software.intel.com/en-us/forums/ ... hp?t=77331
Спасибо, но для меня это не начало, а концовка моего намерения решить поставленную проблему... :dontknow:
Ничего страшного: профессионалы Интела уже несколько лет в прострации, ну а остальным, как говорится, и Бог велел.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
Himera
Сообщения: 3454
Зарегистрирован: Ср мар 05, 2003 5:38 pm
Контактная информация:

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Himera » Вт июн 14, 2011 10:40 pm

Дискуссия об интегралах, перешедшая в разговоры о правильности и точности -- в отдельной теме.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Droog_Andrey » Пт июн 17, 2011 8:33 pm

Yurii писал(а):Ничего страшного: профессионалы Интела уже несколько лет в прострации, ну а остальным, как говорится, и Бог велел.
Возможно, такие алгоритмы понадобятся в задачах по факторизации методами NFS:
http://www.mersenneforum.org/forumdisplay.php?f=83
2^74207281-1 is prime!

dkrylov
Сообщения: 89
Зарегистрирован: Пн мар 30, 2009 1:20 pm

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение dkrylov » Ср июн 22, 2011 11:12 am

А кто-нибудь слушал (или видел) такую программу CRYSTAL06 (теперь вроде уже CRYSTAL09)?
Используется для ab-initio вычислений свойств кристаллических тел

Есть ли у нее бесплатные аналоги?

Аватара пользователя
Himera
Сообщения: 3454
Зарегистрирован: Ср мар 05, 2003 5:38 pm
Контактная информация:

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Himera » Ср июн 22, 2011 11:21 am

dkrylov писал(а):Есть ли у нее бесплатные аналоги?
В каком смысле аналоги? С тем же базисом?

dkrylov
Сообщения: 89
Зарегистрирован: Пн мар 30, 2009 1:20 pm

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение dkrylov » Ср июн 22, 2011 11:56 am

Нет, базис там, насколько я понимаю, может быть разный
Хотелось бы знать, какие еще программы "заточены" под квантовомех вычисления ab-initio для кристаллических тел
Меня, например, конкретно интересуют программы с возможностью расчета влияния изотопных замещений на
частоты колебаний в неорганичеких соединениях
CRYSTAL вроде бы подходит, да бедные мы, академики

Аватара пользователя
Himera
Сообщения: 3454
Зарегистрирован: Ср мар 05, 2003 5:38 pm
Контактная информация:

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Himera » Ср июн 22, 2011 2:42 pm

Вообще, твердотельных программ вагон и маленькая тележка. Если Вам нужны именно бесплатные и именно для фононов, то смотрите в сторону ABINIT, Quantum Espresso, Siesta. А по поводу Crystal в Питере можно попробовать пообщаться с Эварестовым -- у него точно есть лицензия и он точно знает авторов: возможно, они и бесплатно дадут попользоваться на определённых условиях.

dkrylov
Сообщения: 89
Зарегистрирован: Пн мар 30, 2009 1:20 pm

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение dkrylov » Ср июн 22, 2011 3:12 pm

Спасибо большое,
попробую пообщаться, но и посмотреть в сторону abinit, QE and/or Siesta (про последнюю и не слышал еще, буду гуглить)

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Yurii » Пт июл 01, 2011 10:30 pm

У кого-нибудь есть патч для jaguar (schrodinger 2010 suite) под Linux?
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Cherep
Сообщения: 23304
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Cherep » Пт июл 01, 2011 10:56 pm

вареза захотелось?

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Сравнительный анализ квантохимического софта

Сообщение Yurii » Пт июл 01, 2011 11:05 pm

Без ягуара - это не жизнь.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 24 гостя