Ошибка #2070 в Gaussian 09W

вопросы строения молекул и квантовой химии
VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение VTur » Вт мар 12, 2013 9:31 am

chronos377 писал(а):И не могли бы вы подсказать какой лучше метод\базис использовать для расчета dG dH
Для полной энергии молекул из атомов 1-3 строки т. М. я использую B3LYP/aug-cc-pvQZ. Ошибка где-то до 10 кДж/моль. Но считаю в ангармоническом приближении. Ангармонические частоты и постоянные ангармоничности считаю в B3LYP/6-311++g(3df,3pd)
chronos377 писал(а): и для расчета смещения электронной плотности и величины полузаряда на атомах???
Термодинамика здесь неприменима. Термодинамические свойства относятся к веществу, а не к молекуле. Молекулы не характеризуются т/д функциями.
Что Вы имеете в виду под
смещения электронной плотности и величины полузаряда на атомах
После отстоя требуйте долива

chronos377
Сообщения: 56
Зарегистрирован: Пт мар 08, 2013 1:50 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение chronos377 » Вт мар 12, 2013 2:55 pm

Спасибо Вам большое за ответы. Под смещением электронной плотности и величиной полузаряда я понимаю вероятность нахождения электрона к в области около ядра атома и отрицательным зарядом, который он создает в результате. Если глупости несу извините.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение VTur » Вт мар 12, 2013 3:38 pm

chronos377 писал(а):Под смещением электронной плотности и величиной полузаряда я понимаю вероятность нахождения электрона к в области около ядра атома и отрицательным зарядом, который он создает в результате. Если глупости несу извините.
Все равно непонятно

Разность электронной плотности промолекулы и молекулы, что считает программа Цирельсона?

Вероятность нахождения электрона в какой-то области есть интеграл от электронной плотности по этому бассейну, деленный на число электронов (безразмерный интеграл).
После отстоя требуйте долива

Prokop
Сообщения: 15
Зарегистрирован: Ср янв 30, 2013 12:08 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Prokop » Чт мар 14, 2013 10:25 pm

Здравствуйте! Не получается оптимизировать молекулы имидазолидов (пример в архиве). Нарисовал при помощи GaussView 5.0. При запуске расчета выскакивает ошибка 2070. Опыта работы с программой не имею. Помогите разобраться, в чем ошибка. За помощь буду очень благодарен. Спасибо!
AdCOIm.rar
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение VTur » Пт мар 15, 2013 8:14 am

Попробуйте убрать путь к чек файлу. Оставьте только
%chk=AdCOIm.chk
После отстоя требуйте долива

Prokop
Сообщения: 15
Зарегистрирован: Ср янв 30, 2013 12:08 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Prokop » Пт мар 15, 2013 5:20 pm

Спасибо! Расчет длился немного дольше. Однако опять выскакивает та же ошибка, но в этот раз в output файле указано:
Subroutine NAOANL could not find a S-type valence orbital on atom C 1.
IVAL : 1 1 0 0 M : 1 LA : 1
Error
Error termination via Lnk1e in C:\G09W\l607.exe at Fri Mar 15 18:12:11 2013.
Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 2.0 seconds.
File lengths (MBytes): RWF= 9 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1

Подскажите, пожалуйста, что это значит и как это исправить?

Rusia
Сообщения: 190
Зарегистрирован: Пн авг 06, 2007 9:35 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Rusia » Пт мар 15, 2013 6:18 pm

EvgeniX писал(а):Да там метод PM6, потянет.
Тогда надо пользоваться мопаком.

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение o-oxhem » Пт мар 15, 2013 8:01 pm

нужно удалить pop=nbo (если не удалить, то расчет заселенностей будет выполняться на каждом цикле оптимизации геометрии). pop=nbo не совместимо с pm3 (крайней мере nbo 3.1). Кстати, для полуэмипирических методов применяются манимальные базисные наборы (STO-3G) не думаю, что с такими наборами имеет смысл выполнять анализ NBO.
Файл приложен. Комментарии: для большинства квантово-химических методов нет необходимости указывать geom=connectivity и соответствующую матрицу связности. Рекомендую указывать %mem=выделенная оперативная память
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Prokop
Сообщения: 15
Зарегистрирован: Ср янв 30, 2013 12:08 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Prokop » Вс мар 17, 2013 12:37 pm

Спасибо! Теперь нормально удается считать. Вы мне очень помогли!

Nbveh
Сообщения: 214
Зарегистрирован: Вт окт 04, 2011 4:38 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Nbveh » Пн дек 16, 2013 6:12 pm

Помогите пожалуйста разобраться. Выскакивает ошибка #2070. Не идут расчеты йодпроизводных бензола во вложении input и uotput
Расчеты.rar
Вроде все правильно, молекула предварительно рассчитана полуэмперикой в hyperhchem (для длины связи I-C). Аналогичные соединения (Br, Cl ...) считаются без проблем. :235:
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Гесс » Пн дек 16, 2013 6:54 pm

Nbveh писал(а):Помогите пожалуйста разобраться. Выскакивает ошибка #2070. Не идут расчеты йодпроизводных бензола во вложении input и uotput
Расчеты.rar
Вроде все правильно, молекула предварительно рассчитана полуэмперикой в hyperhchem (для длины связи I-C). Аналогичные соединения (Br, Cl ...) считаются без проблем. :235:
Там в последних строках написано:
Standard basis: 6-31G(d,p) (6D, 7F)
Atomic number out of range for 6-31G basis set.

И бром в этом базисе тоже считаться не должен.
С помощью Gen можно дозадать базис для Йода, например 6-311, LANLDZ, ну или на выбор с https://bse.pnl.gov/bse/portal

Nbveh
Сообщения: 214
Зарегистрирован: Вт окт 04, 2011 4:38 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Nbveh » Пн дек 16, 2013 8:27 pm

Про базис то забыл...
Спасибо!

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Гесс » Пн дек 16, 2013 11:49 pm

Только учтите что задав для всех атомов 6-311 вы получите то же самое, 6-311 для йода есть, но в Гауссиан он не вписан, его надо добавлять именно через Gen.

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Любитель_Манниха » Чт янв 15, 2015 6:24 pm

Если гауссиан выдаёт ошибку 2070 и последняя строка в аутпуте:
open-new-file
- тупо памяти не хватает, или возможны варианты? :shuffle:
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Гесс » Чт янв 15, 2015 7:23 pm

Любитель_Манниха писал(а):Если гауссиан выдаёт ошибку 2070 и последняя строка в аутпуте:
open-new-file
- тупо памяти не хватает, или возможны варианты? :shuffle:
а можно чуть больше последних строк?

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Любитель_Манниха » Чт янв 15, 2015 7:45 pm

бла-бла копирайты-ссылки......
******************************************
%chk=E:\filename.chk
%mem=1GB
fname=E:\filename.chk fd = -1

open-new-file
Усё :shuffle:
Инпут генереровал в гауссвью на основе мол-файла :roll:
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Гесс » Чт янв 15, 2015 7:52 pm

Ну методом научного тыка:
1) а с меньшей задачей ранится?
2) а место на диске есть?

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Любитель_Манниха » Чт янв 15, 2015 8:50 pm

1) То же самое
2) > 100 Gb
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Гесс » Чт янв 15, 2015 8:58 pm

Шапку инпута покажите....

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: Ошибка #2070 в Gaussian 09W

Сообщение Любитель_Манниха » Сб янв 17, 2015 8:09 pm

Инпут:
[cut]
%chk=E:\2-Ac-pyrrole.chk
# opt b3lyp/3-21g geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C 17.62080000 -14.52000000 0.00000000
N 18.40260000 -13.44400000 0.00000000
C 18.40260000 -15.59600000 0.00000000
C 19.66750000 -13.85500000 0.00000000
C 19.66750000 -15.18500000 0.00000000
C 16.29080000 -14.52000000 0.00000000
O 15.62580000 -13.36820000 0.00000000
C 15.62580000 -15.67180000 0.00000000
H 18.24809887 -12.96846935 0.86602540
H 18.07196757 -16.61363559 0.00000000
H 20.53315022 -13.22607259 0.00000000
H 20.53315022 -15.81392741 0.00000000
H 14.57381634 -15.47627410 0.00000000
H 15.88428943 -16.23288515 0.87365134
H 15.88428943 -16.23288515 -0.87365134

1 2 1.0 3 2.0 6 1.0
2 4 1.0 9 1.0
3 5 1.0 10 1.0
4 5 2.0 11 1.0
5 12 1.0
6 7 2.0 8 1.0
7
8 13 1.0 14 1.0 15 1.0
9
10
11
12
13
14
15

[/cut]
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 19 гостей